Enzym konjugující s ubikvitinem - Ubiquitin-conjugating enzyme
| Ubikvitin - proteinová ligáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 6.3.2.19 | ||||||||
| Číslo CAS | 74812-49-0 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Enzym konjugující ubikvitin, E2 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | UBQ-konjugát_E2 | ||||||||
| Pfam | PF00179 | ||||||||
| InterPro | IPR000608 | ||||||||
| CHYTRÝ | SM00212 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00163 | ||||||||
| Membranome | 241 | ||||||||
| |||||||||
Enzymy konjugující s ubikvitinem, také známý jako E2 enzymy a vzácněji jako enzymy nosiče ubikvitinu, proveďte druhý krok v ubikvitinace reakce, která se zaměřuje a protein pro degradaci prostřednictvím proteazom. Proces ubikvitinace kovalentně připojí ubikvitin, krátký protein 76 aminokyseliny, do a lysin zbytek na cílovém proteinu. Jakmile je protein označen jednou ubiquitinovou molekulou, tvoří další kola ubikvitinace polyubiquitinový řetězec, který je rozpoznán regulačními částicemi proteazomu 19S, což ATP -závislý odvíjející se cílového proteinu, který umožňuje průchod do 20S jádrové částice proteazomu, kde proteázy degradovat cíl na krátký peptid fragmenty určené k recyklaci buňka.
Vztahy
A enzym aktivující ubikvitin nebo E1 nejprve aktivuje ubikvitin kovalentním připojením molekuly k jeho Aktivní stránky cystein zbytek. Aktivovaný ubikvitin je poté přenesen do E2 cysteinu. Jakmile je molekula E2 konjugována s ubikvitinem, váže jednu z několika ubikvitinové ligázy nebo E3 přes strukturálně konzervovaný vazba kraj. Molekula E3 je zodpovědná za vazbu cílového proteinu Podklad a přenos ubikvitinu z cysteinu E2 na lysinový zbytek na cílovém proteinu.[1]
Schematické znázornění ubikvitylačního systému.
Konkrétní buňka obvykle obsahuje pouze několik typů molekul E1, větší rozmanitost E2 a velmi širokou škálu E3. Molekuly E3 odpovědné za identifikaci a vazbu substrátu jsou tedy mechanismy substrátové specificity při proteazomální degradaci. Každý typ E2 se může spojit s mnoha E3.[2]
Isozymes
Následující lidské geny kódují enzymy konjugující s ubikvitinem:
- UBE2A
- UBE2B
- UBE2C
- UBE2D1, UBE2D2, UBE2D3, UBE2D4 (druhá domnělá)
- UBE2E1, UBE2E2, UBE2E3
- UBE2F (domnělý)
- UBE2G1, UBE2G2
- UBE2H
- UBE2I
- UBE2J1, UBE2J2
- UBE2K
- UBE2L3, UBE2L6; (UBE2L1, UBE2L2, UBE2L4 jsou pseudogeny)
- UBE2M
- UBE2N
- UBE2O
- UBE2Q1, UBE2Q2
- UBE2R1 (CDC34), UBE2R2
- UBE2S
- UBE2T (domnělý)
- UBE2U (domnělý)
- UBE2V1, UBE2V2
- UBE2W (domnělý)
- UBE2Z
- ATG3
- BIRC6
- UFC1
Viz také
Reference
- ^ Nandi D, Tahiliani P, Kumar A, Chandu D (2006). „Systém ubikvitin-proteazom“ (PDF). Journal of Biosciences. 31 (1): 137–55. doi:10.1007 / BF02705243. PMID 16595883. S2CID 21603835.
- ^ Risseeuw EP, Daskalchuk TE, Banks TW, Liu E, Cotelesage J, Hellmann H, Estelle M, Somers DE, Crosby WL (2003). "Analýza proteinových interakcí podjednotek ligázy SCF ubikvitinu E3 z Arabidopsis". The Plant Journal. 34 (6): 753–67. doi:10.1046 / j.1365-313X.2003.01768.x. PMID 12795696.
externí odkazy
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů MOD_SUMO
- Konjugující ubikvitin + enzymy v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
 | Tento enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |