Astacin - Astacin
| Astacin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura astacinu s inhibitorem kyseliny hydroxamové | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Astacin | ||||||||
| Pfam | PF01400 | ||||||||
| Pfam klan | CL0126 | ||||||||
| InterPro | IPR001506 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00129 | ||||||||
| MEROPS | M12 | ||||||||
| SCOP2 | 1ast / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd04280 | ||||||||
| |||||||||
Astaciny jsou rodinou více domén metaloendopeptidázy které jsou buď vylučovány, nebo zakotveny na membráně.[1] Tyto metalopeptidázy patří do skupiny MEROPS rodina peptidů M12, podčeleď M12A (rodina astacinů, klan MA (M)). Protein složit peptidázové domény pro členy této rodiny se podobá doméně peptidázy termolyzin, typový příklad pro klan MA a předpokládaný Aktivní stránky zbytky pro členy této rodiny se termolyzin vyskytuje v motivu HEXXH.[2]
Rodina astacinů metaloendopeptidáz (EC 3.4.24.21) zahrnuje řadu proteinů nalezených v hydra pro člověka ve zralých a vývojových systémech.[3] Mezi jejich funkce patří aktivace z růst faktory, degradace polypeptidy a zpracování extracelulární bílkoviny.[3] The bílkoviny jsou syntetizovány s N-koncovým signálem a proenzymovými sekvencemi a mnohé obsahují více domén C-terminálně k proteáza doména. Buď jsou vylučováno z buněk nebo jsou spojeny s plazmatická membrána.
Molekula astacinu přijímá tvar ledviny s hlubokou rozštěpem aktivního místa mezi jeho N- a C-koncem domén.[4] The zinek ion, který leží ve spodní části rozštěpu, vykazuje jedinečný penta-koordinovaný způsob vazby, zahrnující 3 histidin zbytky, a tyrosin a molekula vody (která je také vázána na karboxylát boční řetěz Glu93).[4] N-terminální doména obsahuje 2 alfa-šroubovice a 5vláknové beta-list. Celková topologie této domény je sdílena typický zinek-endopeptidáza, termolyzin. Astacin proteáza domén také sdílet společné funkce s serralysiny, matricové metaloendopeptidázy, a had jed proteázy; štěpí se peptidové vazby v polypeptidy jako inzulín B řetěz a bradykinin, a v proteinech, jako je kasein a želatina; a mají arylamidázovou aktivitu.[3]
Dějiny
Astaciny jsou pojmenovány po Astacus astacus, evropský rak, druh sladkovodního korýša, kde byly objeveny.[1] BMP1 byl první popsaný astacin.[1]
Členové rodiny astacinů
Mezi proteiny obsahující astacinovou doménu patří:
- Astacin podobná metaloendopeptidáza (ASTL)
- Kostní morfogenetický protein 1 (BMP1)
- Meprin Podjednotka alfa (MEP1A)
- Meprin A podjednotka beta (MEP1B)
- Tolloidový protein 1 (TLL1)
- Proteiny podobné toloidům 2 (TLL2)
Reference
- ^ A b C Gomis-Rüth, FX; Trillo-Muyo, S; Stöcker, W (říjen 2012). "Funkční a strukturální pohledy na astacin metalopeptidázy". Biologická chemie. 393 (10): 1027–41. doi:10.1515 / hsz-2012-0149. hdl:10261/87872. PMID 23092796. S2CID 11098025.
- ^ Rawlings ND, Barrett AJ (1995). "Evoluční rodiny metalopeptidáz". Pervitin Enzymol. 248: 183–228. doi:10.1016/0076-6879(95)48015-3. PMID 7674922.
- ^ A b C Bond JS, Beynon RJ (červenec 1995). "Astacinová rodina metaloendopeptidáz". Protein Sci. 4 (7): 1247–61. doi:10.1002 / pro.5560040701. PMC 2143163. PMID 7670368.
- ^ A b Gomis-Ruth FX, Stocker W, Huber R, Zwilling R, Bode W (únor 1993). „Rafinovaná 1,8 Rentgenová krystalová struktura astacinu, zink-endopeptidáza z raků Astacus astacus L. Stanovení struktury, rafinace, molekulární struktura a srovnání s termolyzinem.“ J. Mol. Biol. 229 (4): 945–68. doi:10.1006 / jmbi.1993.1098. PMID 8445658.
