Serinová racemáza - Serine racemase

SRR
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3L6B, 3L6R
Identifikátory
Aliasy	SRR, ILV1, ISO1, serinová racemáza
Externí ID	OMIM: 606477 MGI: 1351636 HomoloGene: 22775 Genové karty: SRR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	2,325,260 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	74,925,948 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita threonin racemázy; • vazba nukleotidů; • vazba iontů vápníku; • Vazba domény PDZ; • aktivita homodimerizace proteinu; • Aktivita L-serin amoniak-lyázy; • aktivita izomerázy; • vazba glycinu; • vazba kovových iontů; • katalytická aktivita; • aktivita lyázy; • vazba pyridoxal fosfátu; • ATP vazba; • vazba iontů hořčíku; • Aktivita D-serin amoniak-lyázy; • aktivita serin racemázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčná membrána; • apikální část buňky; • tělo neuronových buněk; • cytosol;
Biologický proces	• reakce na organickou cyklickou sloučeninu; • metabolický proces rodiny aminokyselin serinu; • Metabolický proces L-serinu; • buněčný metabolický proces aminokyselin; • Metabolický proces D-serinu; • stárnutí; • proces biosyntézy pyruvátu; • reakce na morfin; • reakce na lipopolysacharid; • Proces biosyntézy D-serinu; • metabolismus; • homotetramerizace bílkovin; • reakce na drogu; • vývoj mozku; • Proces biosyntézy L-serinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	63826
	27364
	ENSG00000167720
	ENSMUSG00000001323
	Q9GZT4
	Q9QZX7
	NM_001304803; NM_021947
	NM_001163311; NM_013761; NM_001362742; NM_001362743; NM_001362744
	NP_001291732; NP_068766
	NP_001156783; NP_038789; NP_001349671; NP_001349672; NP_001349673
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Serinová racemáza je enzym který generuje D-serin z L-serinu. D-serin působí aktivací jako neuronální signální molekula NMDA receptory v mozku. U lidí serinová racemáza protein je kódován SRR gen.^[5]

Savčí serinová racemáza je pyridoxal 5'-fosfát závislý enzym, který katalyzuje oba racemizace z L-serin na D-serin a také vylučování vody z L-serinu, generování pyruvát a amoniak.^[6] Enzym je fyziologicky stimulován dvojmocnými kationty (např. hořčík ) a je alostericky aktivován hořčíkem /ATP komplex.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167720 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001323 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ De Miranda J, Santoro A, Engelender S, Wolosker H (říjen 2000). "Lidská serinová racemáza: molekulární klonování, genomová organizace a funkční analýza". Gen. 256 (1–2): 183–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00356-5. PMID 11054547.
^ De Miranda J, Panizzutti R, Foltyn VN, Wolosker H (říjen 2002). „Kofaktory serinové racemázy, které fyziologicky stimulují syntézu koagonisty receptoru N-methyl-D-aspartátu (NMDA) D-serinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (22): 14542–7. doi:10.1073 / pnas.222421299. PMC 137919. PMID 12393813.

Další čtení

Morita Y, Ujike H, Tanaka Y, Otani K, Kishimoto M, Morio A, Kotaka T, Okahisa Y, Matsushita M, Morikawa A, Hamase K, Zaitsu K, Kuroda S (květen 2007). „Genetická varianta genu pro serin racemázu je spojena se schizofrenií.“. Biologická psychiatrie. 61 (10): 1200–3. doi:10.1016 / j.biopsych.2006.07.025. PMID 17067558. S2CID 8142062.
Steffek AE, Haroutunian V, Meador-Woodruff JH (červenec 2006). "Exprese proteinu serinové racemázy v kůře a hipokampu u schizofrenie". NeuroReport. 17 (11): 1181–5. doi:10.1097 / 01.wnr.0000230512.01339.72. PMID 16837850. S2CID 35663584.
Fujii K, Maeda K, Hikida T, Mustafa AK, Balkissoon R, Xia J, Yamada T, Ozeki Y, Kawahara R, Okawa M, Huganir RL, Ujike H, Snyder SH, Sawa A (únor 2006). „Serinová racemáza se váže na PICK1: potenciální význam pro schizofrenii“. Molekulární psychiatrie. 11 (2): 150–7. doi:10.1038 / sj.mp.4001776. PMID 16314870.
Dumin E, Bendikov I, Foltyn VN, Misumi Y, Ikehara Y, Kartvelishvily E, Wolosker H (červenec 2006). „Modulace hladin D-serinu prostřednictvím ubikvitin-dependentní proteazomální degradace serinové racemázy“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (29): 20291–302. doi:10,1074 / jbc.M601971200. PMID 16714286.
Strísovský K, Jirásková J, Barinka C, Majer P, Rojas C, Slusher BS, Konvalinka J (leden 2003). „Myší mozková serinová racemáza katalyzuje specifickou eliminaci L-serinu na pyruvát“. FEBS Dopisy. 535 (1–3): 44–8. doi:10.1016 / s0014-5793 (02) 03855-3. PMID 12560076. S2CID 43772379.
Hoffman HE, Jirásková J, Ingr M, Zvelebil M, Konvalinka J (leden 2009). "Rekombinantní lidská serinová racemáza: enzymologická charakterizace a srovnání s jejím myším ortologem". Exprese a čištění proteinů. 63 (1): 62–7. doi:10.1016 / j.pep.2008.09.003. PMID 18812225.
Sarras H, Semeralul MO, Fadel MP, Feldcamp LA, Labrie V, Wong AH (červenec 2010). „Zvýšená mRNA PICK1 u schizofrenie zvýšila mRNA SRR při sebevraždě“. Výzkum schizofrenie. 120 (1–3): 236–7. doi:10.1016 / j.schres.2010.03.002. PMID 20385472. S2CID 21820692.
Yamada K, Ohnishi T, Hashimoto K, Ohba H, Iwayama-Shigeno Y, Toyoshima M, Okuno A, Takao H, Toyota T, Minabe Y, Nakamura K, Shimizu E, Itokawa M, Mori N, Iyo M, Yoshikawa T ( Června 2005). „Identifikace izoforem mRNA mnohonásobné serin racemázy (SRR) a genetické analýzy SRR a DAO u schizofrenie a hladin D-serinu“. Biologická psychiatrie. 57 (12): 1493–503. doi:10.1016 / j.biopsych.2005.03.018. PMID 15953485. S2CID 22811942.
Xia M, Liu Y, Figueroa DJ, Chiu CS, Wei N, Lawlor AM, Lu P, Sur C, Koblan KS, Connolly TM (červen 2004). "Charakterizace a lokalizace lidské serinové racemázy". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 125 (1–2): 96–104. doi:10.1016 / j.molbrainres.2004.03.007. PMID 15193426.

externí odkazy

Serin + racemáza v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9GZT4 (Serinová racemáza) na PDBe-KB.

Tento izomeráza článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167720 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001323 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11054547-5] De Miranda J, Santoro A, Engelender S, Wolosker H (říjen 2000). "Lidská serinová racemáza: molekulární klonování, genomová organizace a funkční analýza". Gen. 256 (1–2): 183–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00356-5. PMID 11054547.

[pmid12393813-6] De Miranda J, Panizzutti R, Foltyn VN, Wolosker H (říjen 2002). „Kofaktory serinové racemázy, které fyziologicky stimulují syntézu koagonisty receptoru N-methyl-D-aspartátu (NMDA) D-serinu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (22): 14542–7. doi:10.1073 / pnas.222421299. PMC 137919. PMID 12393813.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Izomerázy: Epimeráza a racemázy (ES 5.1)
5.1.1: Aminokyseliny	Aminokyselinová racemáza: Fenylalanin racemáza (ATP-hydrolyzující) Serinová racemáza
5.1.2: Hydroxykyseliny	Mandelátová racemáza
5.1.3: Sacharidy	UDP-glukóza-4-epimeráza N-acetylneuraminát epimeráza
5.1.99: Jiný	Methylmalonyl CoA epimeráza

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )