Fenylalanin racemáza (ATP-hydrolyzující) - Phenylalanine racemase (ATP-hydrolysing)
Fenylalanin racemáza (ATP-hydrolyzující) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Fenylalanin Racemase (ATP Hydrolysing), obrázek z Protein Data Bank | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
EC číslo | 5.1.1.11 | ||||||||
Číslo CAS | 37290-95-2 | ||||||||
Databáze | |||||||||
IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
|
Enzym fenylalanin racemáza (ES 5.1.1.11, fenylalanin racemáza, fenylalanin racemáza (hydrolyzující adenosintrifosfát), gramicidin S syntetáza I) je enzym, který působí na aminokyseliny a deriváty. Aktivuje oba stereoizomery L & D fenylalaninu za vzniku L-fenylalanyl adenylátu a D-fenylalanyl adenylátu, které jsou vázány na enzym. Tyto vázané sloučeniny se poté přenesou na thiolovou skupinu enzymu s následnou konverzí jeho konfigurace, přičemž D-izomer je příznivější konfigurací těchto dvou sloučenin, přičemž mezi těmito dvěma izomery je poměr 7: 3. Racemizační reakce fenylalaninu je spojena s velmi příznivou hydrolýzou adenosintrifosfát (ATP) do adenosinmonofosfát (AMP) a pyrofosfát (PP), což jí umožňuje termodynamicky pokračovat. Tato reakce je poté prodloužena další hydrolýzou PP na anorganický fosfát (Pi), přes Le Chatelierův princip.
Ostatní jména
- fenylalanin racemáza
- fenylalanin racemáza (hydrolyzující adenosintrifosfát)
- gramicidin S syntetáza I
Cesta
- Metabolismus fenylalaninu
Podklad
- L - Fenylalanin
Produkt
- D - fenylalanin
Kofaktor
- Pyridoxal-fosfát (aktivní forma vitaminu B6)
Odkazy na nemoci
Problémy s trávením fenylalanin (phe) do tyrosin (tyr) vedou k hromadění jak phe, tak fenylpyruvátu při onemocnění zvaném Fenylketonurie (PKU). Tyto dvě sloučeniny se hromadí v krevním řečišti a mozkové tekutině, což může vést k mentální retardaci, pokud se neléčí. Léčba spočívá v omezené dietě potravin, které obsahují phe nebo sloučeniny, které se mohou rozpadnout na phe. Děti v USA jsou na to rutinně testovány při narození. Pro více informací viz Fenylketonurie stránka nebo odkaz níže.
Rychlá fakta
- Rozsah pH = 7,2 - 8,6
- Rovnovážný poměr:
L-Phe: D-Phe = 3: 7 - Specifická aktivita: 0,019
Reakce
L-Fenylalanin | Fenylalanin Racemase | D-Fenylalanin | |
ATP | AMP +PP | ||
Sloučenina C00079 v KEGG Databáze cest. Sloučenina C00002 v KEGG Databáze cest. Enzym 5.1.1.11 v KEGG Databáze cest.Sloučenina C00020 v KEGG Databáze cest. Sloučenina C00013 v KEGG Databáze cest. Sloučenina C00001 v KEGG Databáze cest.Reakce R00686 v KEGG Databáze cest. Cesta MAP00360 v KEGG Databáze cest. Sloučenina C00018 v KEGG Databáze cest.|}
Viz také
Reference
- Takahashi H, Sato E, Kurahashi K (1971). "Racemizace fenylalaninu adenosintrifosfát-dependentní fenylalaninovou racemázou Bacillus brevis Nagano". J. Biochem. 69 (5): 973–6. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a129548. PMID 5577156.
- E. Conti; T. Stachelhaus; M. A. Marahiel; P. Brick (1997). "Strukturální základ pro aktivaci fenylalaninu v neribozomální biosyntéze gramicidinu S". EMBO J.. 16 (14): 4174–4183. doi:10.1093 / emboj / 16.14.4174. PMC 1170043. PMID 9250661.
externí odkazy
- Proteinová datová banka 1amu [1]