Terminální doména terpenové syntázy N - Terpene synthase N terminal domain
| Terpene_synth | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 (+) - bornyldifosfát syntáza: komplex s mg a produktem | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Terpene_synth | ||||||||
| Pfam | PF01397 | ||||||||
| InterPro | IPR001906 | ||||||||
| SCOP2 | 5eau / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii tohle proteinová doména patří k terpenu syntáza rodina (TPS). Jeho rolí je syntetizovat terpeny které jsou součástí primárních metabolismus, jako steroly akaroten a také část sekundárního metabolismu. Tato položka se zaměří na N terminál doména proteinu TPS.
Funkce
Terpeny syntázy mají roli v produkci důležitých molekul v metabolismu, tyto molekuly jsou součástí velké skupiny zvané terpenoidy . Zejména má N koncová doména rys aktivního místa kopalyldifosfát syntáza (CPS).[1]
Struktura
N-terminální doména tvoří alfa-hlaveň podobnou té, kterou má seskviterpen cyklasová epiaristolochen syntáza.[2]
Zachování
Sekvence obsahující toto proteinová doména patří k terpenu syntáza rodina. Bylo navrženo, že toto genová rodina být označeny jako tps (pro terpenovou syntázu). Sekvence srovnání odhalují podobnosti mezi monoterpenem (C.10) syntázy, seskviterpen (C.15) syntázy a diterpen (C20) syntázy. Bylo rozděleno do šesti podskupin na základě fylogeneze, zvané Tpsa-Tpsf.[3]
- Tpsa zahrnuje vetispiridien syntáza.[4]
- Tpsb zahrnuje (-) - limonen syntáza.[5]
- TPSC zahrnuje kopalyldifosfát syntáza (kaurensyntáza A ).[6]
- Tpsd zahrnuje taxadiensyntáza,[7] pinen syntáza,[8] a myrcenová syntáza.[9]
- Tpse zahrnuje ent-kaurensyntáza B.[10]
- Tpsf zahrnuje S-linalool syntáza.[11] V houba Phaeosphaeria sp. (kmen L487) je syntéza ent-kaurenu z geranylgeranyldiposfátu podporována jediným bifunkčním protein.[12]
Viz také
Terminální doména terpenové syntázy C
Reference
- ^ Chen F, Tholl D, Bohlmann J, Pichersky E (2011). „Rodina terpenových syntáz v rostlinách: středně velká rodina genů pro specializovaný metabolismus, která je v celém království vysoce diverzifikovaná“. Rostlina J. 66 (1): 212–29. doi:10.1111 / j.1365-313X.2011.04520.x. PMID 21443633.
- ^ Whittington DA, Wise ML, Urbansky M, Coates RM, Croteau RB, Christianson DW (2002). „Bornyldifosfát syntáza: struktura a strategie manipulace karbokationu terpenoid cyklázou“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15375–80. doi:10.1073 / pnas.232591099. PMC 137724. PMID 12432096.
- ^ Bohlmann J, Steele CL, Croteau R (srpen 1997). „Monoterpenové syntázy z jedle velké (Abies grandis). Izolace, charakterizace a funkční exprese cDNA myrcenové syntázy, (-) - (4S) -limonensyntázy a (-) - (1S, 5S) -pinensyntázy“. J. Biol. Chem. 272 (35): 21784–92. doi:10.1074 / jbc.272.35.21784. PMID 9268308.
- ^ [1], 5-epi- aristolochen syntáza, [2] a (+) - delta-cadinen syntáza SWISSPROT
- ^ Hyatt, D. C .; Youn, B .; Zhao, Y .; Santhamma, B .; Coates, R. M .; Croteau, R. B .; Kang, C. (2007). "Prekurzor 4S-limonensyntázy - Mentha spicata (Spearmint)". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. Uniprot.org. 104 (13): 5360–5. doi:10.1073 / pnas.0700915104. PMC 1838495. PMID 17372193. Citováno 2012-08-02.
- ^ Ait-Ali, T .; Swain, S. M .; Reid, J. B .; Sun, T .; Kamiya, Y. (1997). "Ent-copalyl difosfát syntáza, chloroplastický prekurzor - Pisum sativum (hrach zahradní)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. Uniprot.org. 11 (3): 443–54. doi:10.1046 / j.1365-313X.1997.11030443.x. PMID 9107034. Citováno 2012-08-02.
- ^ Wildung, M. R.; Croteau, R. (1996). "Taxadiene syntáza - Taxus brevifolia (tis tichomořský)". The Journal of Biological Chemistry. Uniprot.org. 271 (16): 9201–4. doi:10.1074 / jbc.271.16.9201. PMID 8621577. S2CID 3191132. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Pinene synthase, chloroplastic prekurzor - Abies grandis (jedle velká)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Myrcene syntáza, chloroplastický předchůdce - Abies grandis (jedle velká)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ Yamaguchi, S .; Saito, T .; Abe, H .; Yamane, H .; Murofushi, N .; Kamiya, Y. (1996). "Ent-kaur-16-en syntáza, chloroplastický prekurzor - Cucurbita maxima (dýně)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. Uniprot.org. 10 (2): 203–13. doi:10.1046 / j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Linalool syntáza - Clarkia concinna (červené stužky)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ Kawaide H, Imai R, Sassa T, Kamiya Y (srpen 1997). „Ent-kaurensyntáza z houby Phaeosphaeria sp. L487. Izolace, charakterizace a bakteriální exprese bifunkční diterpencyklázy v biosyntéze houbového giberelinu“ cDNA. J. Biol. Chem. 272 (35): 21706–12. doi:10.1074 / jbc.272.35.21706. PMID 9268298.