Terminální doména terpenové syntázy C - Terpene synthase C terminal domain
| Terpene_synth_C | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 5-epi-aristolochen syntáza z nicotiana tabacum | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Terpene_synth_C | ||||||||
| Pfam | PF03936 | ||||||||
| InterPro | IPR005630 | ||||||||
| SCOP2 | 5eau / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii tohle proteinová doména patří k terpenu syntáza rodina (TPS). Jeho rolí je syntetizovat terpeny které jsou součástí primárních metabolismus, jako steroly akaroten a také část sekundárního metabolismu. Tato položka se zaměří na C terminál doména proteinu TPS.
Funkce
Terpeny syntázy mají roli v produkci důležitých molekul v metabolismu, tyto molekuly jsou součástí velké skupiny zvané terpenoidy . Zejména C koncová doména katalyzuje cyklizaci geranyldifosfátu, orientuje a stabilizuje více reaktivních meziproduktů karbokationtu. Nebo jednodušeji, C terminál napomáhá syntéze nových molekul.
Struktura
Předpokládá se, že má alespoň dvě alfa helixy.[1]
Zachování
Sekvence obsahující toto proteinová doména patří k terpenu syntáza rodina. Bylo navrženo, že toto genová rodina být označeny jako tps (pro terpenovou syntázu). Sekvence srovnání odhalují podobnosti mezi monoterpenem (C.10) syntázy, seskviterpen (C.15) syntázy a diterpen (C20) syntázy. Bylo rozděleno do šesti podskupin na základě fylogeneze, zvané Tpsa-Tpsf.[2]
- Tpsa zahrnuje vetispiridien syntáza.[3]
- Tpsb zahrnuje (-) - limonen syntáza.[4]
- TPSC zahrnuje kopalyldifosfát syntáza (kaurensyntáza A).[5]
- Tpsd zahrnuje taxadiensyntáza,[6] pinen syntáza,[7] a myrcenová syntáza.[8]
- Tpse zahrnuje ent-kaurensyntáza B.[9]
- Tpsf zahrnuje linalool syntázu.[10] V houba Phaeosphaeria sp. (kmen L487) je syntéza ent-kaurenu z geranylgeranyl-doposfátu podporována jediným bifunkčním protein.[11]
Viz také
Terminální doména terpenové syntázy N
Reference
- ^ Starks CM, Back K, Chappell J, Noel JP (1997). "Strukturální základ pro cyklickou terpenovou biosyntézu tabákovou 5-epi-aristolochen syntázou". Věda. 277 (5333): 1815–20. doi:10.1126 / science.277.5333.1815. PMID 9295271.
- ^ Bohlmann J, Steele CL, Croteau R (srpen 1997). „Monoterpenové syntázy z jedle velké (Abies grandis). Izolace, charakterizace a funkční exprese cDNA myrcenové syntázy, (-) - (4S) -limonensyntázy a (-) - (1S, 5S) -pinensyntázy“. J. Biol. Chem. 272 (35): 21784–92. doi:10.1074 / jbc.272.35.21784. PMID 9268308.
- ^ [1], 5-epi- aristolochen syntáza, [2] a (+) - delta-cadinen syntáza SWISSPROT
- ^ "Prekurzor 4S-limonensyntázy - Mentha spicata (Spearmint)". Uniprot.org. doi:10.1073 / pnas.0700915104. PMID 17372193. S2CID 27479350. Citováno 2012-08-02. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ Ait-Ali, T .; Swain, S. M .; Reid, J. B .; Sun, T .; Kamiya, Y. (1997). "Ent-copalyl difosfát syntáza, chloroplastický prekurzor - Pisum sativum (hrach zahradní)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. Uniprot.org. 11 (3): 443–54. doi:10.1046 / j.1365-313X.1997.11030443.x. PMID 9107034. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Taxadiene syntáza - Taxus brevifolia (tis tichomořský)". Uniprot.org. doi:10.1074 / jbc.271.16.9201. PMID 8621577. S2CID 3191132. Citováno 2012-08-02. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ "Pinene synthase, chloroplastic prekurzor - Abies grandis (jedle velká)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Myrcene syntáza, chloroplastický předchůdce - Abies grandis (jedle velká)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ Yamaguchi, S .; Saito, T .; Abe, H .; Yamane, H .; Murofushi, N .; Kamiya, Y. (1996). "Ent-kaur-16-en syntáza, chloroplastický prekurzor - Cucurbita maxima (dýně)". The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. Uniprot.org. 10 (2): 203–13. doi:10.1046 / j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778. Citováno 2012-08-02.
- ^ "Linalool syntáza - Clarkia concinna (červené stužky)". Uniprot.org. Citováno 2012-08-02.
- ^ Kawaide H, Imai R, Sassa T, Kamiya Y (srpen 1997). „Ent-kaurensyntáza z houby Phaeosphaeria sp. L487. Izolace, charakterizace a bakteriální exprese bifunkční diterpencyklázy v biosyntéze houbového giberelinu“ cDNA. J. Biol. Chem. 272 (35): 21706–12. doi:10.1074 / jbc.272.35.21706. PMID 9268298.