Undecaprenyl-difosfatáza - Undecaprenyl-diphosphatase
| undekapenyl-difosfatáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 3.6.1.27 | ||||||||
| Číslo CAS | 9077-80-9 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Protein rezistence na bacitracin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ? | ||||||||
| Pfam | PF02673 | ||||||||
| InterPro | IPR003824 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 479 | ||||||||
| OPM protein | 5 měsíců | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, an undekapenyl-difosfatáza (ES 3.6.1.27 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- undekapenyldifosfát + H2Ó undecaprenyl fosfát + fosfát
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou undekapenyldifosfát a H2Ó, zatímco jeho dva produkty jsou undecaprenyl fosfát a fosfát. Enzymatická aktivita je zvýšena dvojmocnými kationty, zejména Ca2+.
V mnoha bakteriích je tento enzym a membránový protein který se účastní biosyntéza peptidoglykanu. Enzym se podílí na přenosu odpor na antibiotikum bacitracin.[1]
Nomenklatura
Tento enzym patří do rodiny hydrolázy, konkrétně ty, které působí na anhydridy kyselin v anhydridech obsahujících fosfor. The systematické jméno této třídy enzymů je undekapprenyl-difosfátfosfohydroláza. Mezi další běžně používané názvy patří Undecaprenyl-pyrofosfátfosfatáza (Uppp), UPP fosfatáza, BacA, C55-isoprenyldifosfatáza, C55-isoprenylpyrofosfatáza a isoprenylpyrofosfatáza.
Poznámka: Enzym Uppp / BacA (EC 3.6.1.27) byl občas nesprávně označen jako „undekaprenolinkináza ".[2] Tento název by však měl být vyhrazen pro odlišný enzym (EC 2.7.1.66), který katalyzuje přidání fosfátové skupiny z ATP na undekapprenol (C55-isoprenylalkohol).
Struktura
Rentgenové krystalové struktury membránové formy enzymu z E-coli[3][4] jsou k dispozici (ID PDB: 5OON,[5] 6CB2[6]).
Reference
- ^ Chalker AF, Ingraham KA, Lunsford RD, Bryant AP, Bryant J, Wallis NG, Broskey JP, Pearson SC, Holmes DJ (červenec 2000). „Gen bacA, který určuje citlivost na bacitracin u Streptococcus pneumoniae a Staphylococcus aureus, je také nezbytný pro virulenci“. Mikrobiologie. 146 (Pt 7): 1547–53. doi:10.1099/00221287-146-7-1547. PMID 10878119.
- ^ El Ghachi M, Bouhss A, Blanot D, Mengin-Lecreulx D (červenec 2004). „Gen bacA z Escherichia coli kóduje aktivitu undekapprenylpyrofosfátfosfatázy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (29): 30106–13. doi:10,1074 / jbc.M401701200. PMID 15138271.
- ^ El Ghachi M, Howe N, Huang CY, Olieric V, Warshamanage R, Touzé T, Weichert D, Stansfeld PJ, Wang M, Kerff F, Caffrey M (březen 2018). „Krystalová struktura undekapprenylpyrofosfátfosfatázy a její role v biosyntéze peptidoglykanu“. Příroda komunikace. 9 (1): 1078. doi:10.1038 / s41467-018-03477-5. PMC 5852022. PMID 29540682.
- ^ Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (březen 2018). „Krystalová struktura intramembranální fosfatázy centrální vůči biosyntéze peptidoglykanů buněčné stěny a recyklaci lipidů“. Příroda komunikace. 9 (1): 1159. doi:10.1038 / s41467-018-03547-8. PMC 5861054. PMID 29559664.
- ^ „5OON - Struktura undekapprenyl-pyrofosfátfosfatázy, BacA“. RCSB Proteinová datová banka.
- ^ "6CB2 - krystalová struktura Escherichia coli UppP". RCSB Proteinová datová banka.
Další čtení
| Tento EC 3.6 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |