Protein Bloomova syndromu - Bloom syndrome protein - Wikipedia

BLM
Bloom syndrome protein.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyBLM, BS, RECQ2, RECQL2, RECQL3, Bloomův syndrom RecQ jako helikáza, BLM RecQ jako helikáza, MGRISCE1
Externí IDOMIM: 604610 MGI: 1328362 HomoloGene: 47902 Genové karty: BLM
Umístění genu (člověk)
Chromozom 15 (lidský)
Chr.Chromozom 15 (lidský)[1]
Chromozom 15 (lidský)
Genomic location for BLM
Genomic location for BLM
Kapela15q26.1Start90,717,346 bp[1]
Konec90,816,166 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

641

12144

Ensembl

ENSG00000197299

ENSMUSG00000030528

UniProt

P54132

O88700

RefSeq (mRNA)

NM_000057
NM_001287246
NM_001287247
NM_001287248

NM_001042527
NM_007550

RefSeq (protein)

NP_000048
NP_001274175
NP_001274176
NP_001274177
NP_001274177.1

NP_001035992
NP_031576

Místo (UCSC)Chr 15: 90,72 - 90,82 MbChr 7: 80,45 - 80,54 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein Bloomova syndromu je protein že u lidí je kódován BLM gen a není vyjádřen v Bloomův syndrom.[5]

Genový produkt Bloomova syndromu souvisí s RecQ podmnožina DNA obsahující DExH box helikázy a má obě stimulované DNA ATPáza a aktivity ATP-dependentní DNA helikázy. Mutace způsobující Bloomův syndrom odstranit nebo upravit motivy helikázy a může deaktivovat aktivitu helikázy 3 '→ 5'. Normální protein může působit potlačením nevhodného homologní rekombinace.[6]

Redukční dělení buněk

Současný model meiotické rekombinace, iniciovaný dvouvláknovým zlomem nebo mezerou, následovaný párováním s homologním chromozomem a invazí vlákna, aby byl zahájen proces rekombinace. Oprava mezery může vést k crossover (CO) nebo non-crossover (NCO) z přilehlých oblastí. Předpokládá se, že k rekombinaci CO dochází u modelu Double Holliday Junction (DHJ), znázorněného vpravo nahoře. Předpokládá se, že NCO rekombinanty se vyskytují primárně na modelu Synthesis Dependent Strand Annealing (SDSA), ilustrovaném vlevo nahoře. Většina událostí rekombinace se zdá být typu SDSA.

Rekombinace v době redukční dělení buněk je často iniciováno dvouřetězcovým zlomem DNA (DSB). Během rekombinace byly části DNA v 5 'končí přestávky jsou odříznuty v procesu zvaném resekce. V následujícím kroku invaze pramenů převis 3 'konec zlomené molekuly DNA pak „napadne“ DNA homologního chromozomu, který není porušen. Po invazi řetězce může další sled událostí následovat buď ze dvou hlavních cest vedoucích k crossover (CO) nebo non-crossover (NCO) rekombinantní (viz Genetická rekombinace a spodní část obrázku v této části).

Nadějné droždí Saccharomyces cerevisiae kóduje ortolog proteinu Bloomova syndromu (BLM), který je označen Sgs1 (Potlačovač malého růstu 1). Sgs1 (BLM) je a helikáza který funguje v homologní rekombinace oprava DSB. The Sgs1 (BLM) helikáza se jeví jako centrální regulátor většiny rekombinačních událostí, ke kterým dochází během S. cerevisiae redukční dělení buněk.[7] Během normální meiózy je Sgs1 (BLM) zodpovědný za směrování rekombinace k alternativní tvorbě časných poddůstojníků nebo Křižovatka Holliday společné molekuly, které se následně rozloží jako CO.[7]

V rostlině Arabidopsis thaliana, homology helikázy Sgs1 (BLM) působí jako hlavní bariéry tvorby meiotického CO.[8] Předpokládá se, že tyto helikázy vytlačí napadající vlákno, které umožní jeho žíhání s druhým 3'vysunutým koncem DSB, což povede k tvorbě NCO rekombinace procesem nazývaným žíhání vlákna závislého na syntéze (SDSA) (viz Genetická rekombinace a Obrázek v této části). Odhaduje se, že pouze asi 4% DSB jsou opraveny rekombinací CO.[9] Sequela-Arnaud a kol.[8] navrhl, že počty CO jsou omezeny kvůli dlouhodobým nákladům na rekombinaci CO, tj. rozpadu příznivých genetických kombinací alel vytvořených v minulosti přírodní výběr.

Interakce

Ukázalo se, že protein Bloomova syndromu komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197299 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030528 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Karow JK, Chakraverty RK, Hickson ID (leden 1998). „Produktem genu Bloomova syndromu je 3'-5 'DNA helikáza“. J Biol Chem. 272 (49): 30611–4. doi:10.1074 / jbc.272.49.30611. PMID  9388193.
  6. ^ "Bloomův syndrom". Genetická domácí reference. NIH. Citováno 19. března 2013.
  7. ^ A b De Muyt A, Jessop L, Kolar E, Sourirajan A, Chen J, Dayani Y, Lichten M (2012). „BLM helikáza ortholog Sgs1 je centrálním regulátorem intermediárního metabolismu meiotické rekombinace“. Mol. Buňka. 46 (1): 43–53. doi:10.1016 / j.molcel.2012.02.020. PMC  3328772. PMID  22500736.
  8. ^ A b Séguéla-Arnaud M, Crismani W, Larchevêque C, Mazel J, Froger N, Choinard S, Lemhemdi A, Macaisne N, Van Leene J, Gevaert K, De Jaeger G, Chelysheva L, Mercier R (2015). „Více mechanismů omezuje meiotické přechody: TOP3α a dva BLM homology antagonizují křížení paralelně s FANCM“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 112 (15): 4713–8. Bibcode:2015PNAS..112.4713S. doi:10.1073 / pnas.1423107112. hdl:1854 / LU-6829814. PMC  4403193. PMID  25825745.
  9. ^ Crismani W, Girard C, Froger N, Pradillo M, Santos JL, Chelysheva L, Copenhaver GP, Horlow C, Mercier R (2012). "FANCM omezuje meiotické přechody". Věda. 336 (6088): 1588–90. Bibcode:2012Sci ... 336.1588C. doi:10.1126 / science.1220381. PMID  22723424. S2CID  14570996.
  10. ^ A b Wang Y, Cortez D, Yazdi P, Neff N, Elledge SJ, Qin J (duben 2000). „BASC, super komplex proteinů asociovaných s BRCA1 zapojených do rozpoznávání a opravy nenormálních struktur DNA“. Genes Dev. 14 (8): 927–39. doi:10,1101 / gad.14.8.927 (neaktivní 11. 11. 2020). PMC  316544. PMID  10783165.CS1 maint: DOI neaktivní od listopadu 2020 (odkaz)
  11. ^ Beamish H, Kedar P, Kaneko H, Chen P, Fukao T, Peng C, Beresten S, Gueven N, Purdie D, Lees-Miller S, Ellis N, Kondo N, Lavin MF (srpen 2002). „Funkční souvislost mezi BLM defektní při Bloomově syndromu a proteinem mutovaným v ataxii-telangiektázii, ATM“. J. Biol. Chem. 277 (34): 30515–23. doi:10,1074 / jbc.M203801200. PMID  12034743.
  12. ^ Jiao R, Bachrati CZ, Pedrazzi G, Kuster P, Petkovic M, Li JL, Egli D, Hickson ID, Stagljar I (červen 2004). „Fyzická a funkční interakce mezi produktem genu Bloomova syndromu a největší podjednotkou faktoru 1 pro sestavení chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (11): 4710–9. doi:10.1128 / MCB.24.11.4710-4719.2004. PMC  416397. PMID  15143166.
  13. ^ A b C d Sengupta S, Robles AI, Linke SP, Sinogeeva NI, Zhang R, Pedeux R, Ward IM, Celeste A, Nussenzweig A, Chen J, Halazonetis TD, Harris CC (září 2004). „Funkční interakce mezi BLM helikázou a 53BP1 v dráze zprostředkované Chk1 během zástavy S-fáze“. J. Cell Biol. 166 (6): 801–13. doi:10.1083 / jcb.200405128. PMC  2172115. PMID  15364958.
  14. ^ Deans AJ, West SC (24. prosince 2009). „FANCM spojuje poruchy nestability genomu Bloomův syndrom a Fanconiho anémii“. Mol. Buňka. 36 (6): 943–53. doi:10.1016 / j.molcel.2009.12.006. PMID  20064461.
  15. ^ Sharma S, Sommers JA, Wu L, Bohr VA, Hickson ID, Brosh RM (březen 2004). "Stimulace klapkové endonukleázy-1 proteinem Bloomova syndromu". J. Biol. Chem. 279 (11): 9847–56. doi:10,1074 / jbc.M309898200. PMID  14688284.
  16. ^ A b Freire R, d'Adda Di Fagagna F, Wu L, Pedrazzi G, Stagljar I, Hickson ID, Jackson SP (srpen 2001). „Štěpení produktu genu Bloomova syndromu během apoptózy kaspázou-3 vede ke zhoršené interakci s topoizomerázou IIIalfa“. Nucleic Acids Res. 29 (15): 3172–80. doi:10.1093 / nar / 29.15.3172. PMC  55826. PMID  11470874.
  17. ^ Langland G, Kordich J, Creaney J, Goss KH, Lillard-Wetherell K, Bebenek K, Kunkel TA, Groden J (srpen 2001). „Protein Bloomova syndromu (BLM) interaguje s MLH1, ale není nutný pro opravu nesouladu DNA“. J. Biol. Chem. 276 (32): 30031–5. doi:10,1074 / jbc.M009664200. PMID  11325959.
  18. ^ Pedrazzi G, Perrera C, Blaser H, Kuster P, Marra G, Davies SL, Ryu GH, Freire R, Hickson ID, Jiricny J, Stagljar I (listopad 2001). „Přímá asociace produktu genu Bloomova syndromu s lidským proteinem pro opravu nesouladu MLH1“. Nucleic Acids Res. 29 (21): 4378–86. doi:10.1093 / nar / 29.21.4378. PMC  60193. PMID  11691925.
  19. ^ Wang XW, Tseng A, Ellis NA, Spillare EA, Linke SP, Robles AI, Seker H, Yang Q, Hu P, Beresten S, Bemmels NA, Garfield S, Harris CC (srpen 2001). "Funkční interakce p53 a BLM DNA helikázy při apoptóze". J. Biol. Chem. 276 (35): 32948–55. doi:10,1074 / jbc.M103298200. PMID  11399766.
  20. ^ Garkavtsev IV, Kley N, Grigorian IA, Gudkov AV (prosinec 2001). „Protein Bloomova syndromu interaguje a spolupracuje s p53 při regulaci transkripce a řízení buněčného růstu“. Onkogen. 20 (57): 8276–80. doi:10.1038 / sj.onc.1205120. PMID  11781842.
  21. ^ Yang Q, Zhang R, Wang XW, Spillare EA, Linke SP, Subramanian D, Griffith JD, Li JL, Hickson ID, Shen JC, Loeb LA, Mazur SJ, Appella E, Brosh RM, Karmakar P, Bohr VA, Harris CC (Srpen 2002). „Zpracování křižovatek Holliday pomocí BLM a WRN helikáz je regulováno p53“. J. Biol. Chem. 277 (35): 31980–7. doi:10,1074 / jbc.M204111200. PMID  12080066.
  22. ^ A b Braybrooke JP, Li JL, Wu L, Caple F, Benson FE, Hickson ID (listopad 2003). "Funkční interakce mezi Bloomovým syndromem helikázy a RAD51 paralogem, RAD51L3 (RAD51D)". J. Biol. Chem. 278 (48): 48357–66. doi:10,1074 / jbc.M308838200. hdl:10026.1/10297. PMID  12975363.
  23. ^ Wu L, Davies SL, Levitt NC, Hickson ID (červen 2001). „Potenciální role BLM helikázy v rekombinační opravě prostřednictvím konzervované interakce s RAD51“. J. Biol. Chem. 276 (22): 19375–81. doi:10,1074 / jbc.M009471200. PMID  11278509.
  24. ^ A b Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (srpen 2000). „Replikační protein A fyzicky interaguje s proteinem Bloomova syndromu a stimuluje jeho aktivitu helikázy“. J. Biol. Chem. 275 (31): 23500–8. doi:10,1074 / jbc.M001557200. PMID  10825162.
  25. ^ Opresko PL, von Kobbe C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (říjen 2002). „Telomere-binding protein TRF2 se váže na a stimuluje helikázy Wernerova a Bloomova syndromu“. J. Biol. Chem. 277 (43): 41110–9. doi:10,1074 / jbc.M205396200. PMID  12181313.
  26. ^ Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (duben 2002). „Časový průběh a chromozomální lokalizace proteinů souvisejících s rekombinací při meióze u myší jsou kompatibilní s modely, které mohou vyřešit časné interakce DNA-DNA bez vzájemné rekombinace.“ J. Cell Sci. 115 (Pt 8): 1611–22. PMID  11950880.
  27. ^ Wu L, Davies SL, North PS, Goulaouic H, Riou JF, Turley H, Gatter KC, Hickson ID (březen 2000). „Produkt genu Bloomova syndromu interaguje s topoizomerázou III“. J. Biol. Chem. 275 (13): 9636–44. doi:10.1074 / jbc.275.13.9636. PMID  10734115.
  28. ^ Hu P, Beresten SF, van Brabant AJ, Ye TZ, Pandolfi PP, Johnson FB, Guarente L, Ellis NA (červen 2001). „Důkazy interakce BLM a topoisomerázy IIIalfa v genomové stabilitě“. Hučení. Mol. Genet. 10 (12): 1287–98. doi:10,1093 / hmg / 10.12.1287. PMID  11406610.
  29. ^ von Kobbe C, Karmakar P, Dawut L, Opresko P, Zeng X, Brosh RM, Hickson ID, Bohr VA (červen 2002). „Kolokalizace, fyzická a funkční interakce mezi proteiny Wernerova a Bloomova syndromu“. J. Biol. Chem. 277 (24): 22035–44. doi:10,1074 / jbc.M200914200. PMID  11919194.

Další čtení

externí odkazy