ERCC4 - ERCC4

ERCC4
Protein ERCC4 PDB 1z00.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyERCC4, ERCC11, FANCQ, RAD1, XPF, XFEPS, křížová komplementační skupina excizní opravy 4, ERCC excizní oprava 4, endonukleázová katalytická podjednotka
Externí IDOMIM: 133520 MGI: 1354163 HomoloGene: 3836 Genové karty: ERCC4
Umístění genu (člověk)
Chromozom 16 (lidský)
Chr.Chromozom 16 (lidský)[1]
Chromozom 16 (lidský)
Genomic location for ERCC4
Genomic location for ERCC4
Kapela16p13.12Start13,920,154 bp[1]
Konec13,952,348 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ERCC4 210158 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

2072

50505

Ensembl

ENSG00000175595

ENSMUSG00000022545

UniProt

Q92889

Q9QZD4

RefSeq (mRNA)

NM_005236

NM_015769

RefSeq (protein)

NP_005227

NP_056584

Místo (UCSC)Chr 16: 13,92 - 13,95 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

ERCC4 je protein označen jako DNA opravná endonukleáza XPF že u lidí je kódován ERCC4 gen. Dohromady s ERCC1 „ERCC4 tvoří komplex enzymů ERCC1-XPF, kterého se účastní Oprava DNA a DNA rekombinace.[4][5]

The nukleáza enzym ERCC1-XPF řeže specifické struktury DNA. Mnoho aspektů těchto dvou genových produktů je zde popsáno společně, protože jsou partnery během opravy DNA. Nukleáza ERCC1-XPF je nezbytnou aktivitou v dráze DNA oprava nukleotidové excize (NER). Nukleáza ERCC1-XPF také funguje v cestách k opravě dvouvláknové zlomy v DNA a při opravě poškození „zesítění“, které škodlivě spojuje dva řetězce DNA.

Buňky s deaktivujícími mutacemi v ERCC4 jsou citlivější než obvykle na konkrétní látky poškozující DNA, včetně ultrafialová radiace a na chemikálie, které způsobují zesíťování mezi řetězci DNA. Geneticky upravené myši s deaktivace mutací v ERCC4 mají také poruchy v opravě DNA doprovázené změnami fyziologie vyvolanými metabolickým stresem, které vedou k předčasnému stárnutí.[6] Úplné smazání ERCC4 je nekompatibilní s životaschopností myší a nebyly nalezeny žádné lidské jedince s úplnou (homozygotní) delecí ERCC4. Vzácní jedinci v lidské populaci mají zděděné mutace, které zhoršují funkci ERCC4. Pokud normální geny chybí, mohou tyto mutace vést k lidským syndromům, včetně xeroderma pigmentosum, Cockaynův syndrom a Fanconiho anémie.

ERCC1 a ERCC4 jsou jména lidských genů a Ercc1 a Ercc4 jsou analogický názvy genů savců. Podobné geny s podobnými funkcemi se nacházejí ve všech eukaryotických organismech.

Gen

Člověk ERCC4 Gen může opravit defekt opravy DNA ve specifických mutantních buněčných liniích citlivých na ultrafialové světlo (UV) odvozených z buněk vaječníků čínského křečka.[7] Bylo izolováno několik nezávislých komplementačních skupin buněk vaječníků čínského křečka (CHO),[8] a tento gen obnovil UV odolnost vůči buňkám komplementační skupiny 4. S ohledem na tuto mezidruhovou metodu genetické komplementace byl gen nazýván „Excision repair cross-komplementing 4“[9]

Člověk ERCC4 Gen kóduje protein XPF o 916 aminokyselinách s molekulovou hmotností přibližně 104 000 daltonů.

Geny podobné ERCC4 s ekvivalentními funkcemi (ortology) se nacházejí v jiných eukaryotických genomech. Mezi nejvíce studované genové ortology patří RAD1 v začínajících kvasnicích Saccharomyces cerevisiae, a rad16 + ve štěpném droždí Schizosaccharomyces pombe.

Protein

Obrázek 1: Schéma XPF ukazující neaktivní doménu helikázy, doménu nukleázy a doménu helix-hairpin-helix

Jedna molekula ERCC1 a jedna molekula XPF se vážou dohromady a tvoří heterodimer ERCC1-XPF, který je aktivní nukleázovou formou enzymu. V heterodimeru ERCC1 – XPF zprostředkovává ERCC1 interakce DNA a protein – protein. XPF poskytuje aktivní místo endonukleázy a podílí se na vazbě DNA a dalších interakcích protein-protein.[7]

Protein ERCC4 / XPF se skládá ze dvou konzervovaných oblastí oddělených méně konzervativní oblastí uprostřed. N-terminální oblast má homologii s několika konzervovanými doménami DNA helikáz patřících do nadrodiny II, ačkoli XPF není DNA helikáza.[10] C-koncová oblast XPF zahrnuje zbytky aktivního místa pro aktivitu nukleázy.[11] (Obrázek 1).

Většina proteinu ERCC1 souvisí na úrovni sekvence s C koncem proteinu XPF.,[12] ale zbytky v nukleázové doméně nejsou přítomny. Doména "helix-hairpin-helix" vázající DNA na C-konci každého proteinu.

Primární sekvencí a strukturní podobností proteinů je nukleáza ERCC1-XPF členem širší rodiny strukturně specifických DNA nukleáz obsahujících dvě podjednotky. Takové nukleázy zahrnují například nukleázu MUS81-EME1.

Strukturně specifická nukleáza

Obrázek 2: Substráty DNA nukleázy ERCC1-XPF

Komplex ERCC1 – XPF je strukturně specifická endonukleáza. ERCC1-XPF neštěpí DNA, která je výlučně jednovláknová nebo dvouvláknová, ale štěpí páteř fosfodiesterové DNA specificky na spojích mezi dvouvláknovou a jednovláknovou DNA. Zavádí řez dvouvláknovou DNA na 5 'straně takového spojení, asi dva nukleotidy pryč[13] (Obrázek 2). Tato strukturní specificita byla původně prokázána pro RAD10-RAD1, kvasinkové ortology ERCC1 a XPF.[14]

Hydrofobní motivy helix – vlásenka – helix v C-koncových oblastech ERCC1 a XPF interagují za účelem podpory dimerizace těchto dvou proteinů.[15][16] Neexistuje žádná katalytická aktivita při absenci dimerizace. Ačkoliv je katalytická doména v XPF a ERCC1 je katalyticky neaktivní, ERCC1 je pro aktivitu komplexu nepostradatelný.

Bylo navrženo několik modelů pro vazbu ERCC1 – XPF na DNA, založené na parciálních strukturách příslušných proteinových fragmentů při atomovém rozlišení.[15] Vazba DNA zprostředkovaná doménami helix-hairpin-helix domén ERCC1 a XPF umisťuje heterodimer na spojení mezi dvouvláknovou a jednovláknovou DNA.

Oprava nukleotidové excize (NER)

Během opravy excizí nukleotidů několik proteinových komplexů spolupracuje na rozpoznání poškozené DNA a lokálně odděluje spirálu DNA na krátkou vzdálenost na obou stranách místa poškození DNA. Nukleáza ERCC1 – XPF incizuje poškozené vlákno DNA na 5 'straně léze.[13] Během NER protein ERCC1 interaguje s proteinem XPA za účelem koordinace vazby DNA a proteinů.

Oprava DNA dvouvláknového zlomu (DSB)

Savčí buňky s mutantem ERCC1 – XPF jsou mírně citlivější než normální buňky na látky (například ionizující záření), které způsobují dvouřetězcové zlomy v DNA.[17][18] Konkrétní cesty opravy homologní rekombinace i nehomologního spojování konců se spoléhají na funkci ERCC1-XPF.[19][20] Relevantní aktivitou ERCC1 – XPF pro oba typy opravy dvouřetězcových zlomů je schopnost odstranit nehomologní 3 'jednovláknové ocasy z konců DNA před opětovným připojením. Tato aktivita je nutná během jednovláknové žíhací subcesty homologní rekombinace. Ořezávání 3 'jednovláknových ocasů je také nutné v mechanicky odlišné subcestě nehomologního koncového spojení, nezávislé na proteinech Ku[21][22] Homologní integrace DNA, důležitá technika pro genetickou manipulaci, závisí na funkci ERCC1-XPF v hostitelské buňce.[23]

Oprava křížových řetězců Interstrand

Savčí buňky nesoucí mutace v ERCC1 nebo XPF jsou obzvláště citlivé na látky, které způsobují křížové vazby mezi řetězci DNA (ICL)[24] Mezivláknové síťování blokuje progresi replikace DNA a struktury na blokovaných vidlicích replikace DNA poskytují substráty pro štěpení pomocí ERCC1-XPF.[25][26] Mohou být provedeny řezy na obou stranách zesítění na jednom řetězci DNA, aby se uvolnilo zesíťování a zahájila se oprava. Alternativně může být v DNA blízko ICL proveden dvouvláknový zlom a následná oprava homologní rekombinace může zahrnovat akci ERCC1-XPF. Ačkoli to není jediná zapojená nukleáza, je pro opravu ICL během několika fází buněčného cyklu vyžadován ERCC1 – XPF.[27][28]

Klinický význam

Xeroderma pigmentosum (XP)

Někteří jedinci se vzácným dědičným syndromem xeroderma pigmentosum mít mutace v ERCC4. Tito pacienti jsou klasifikováni jako XP komplementační skupina F (XP-F). Diagnostickými rysy XP jsou suchá šupinatá pokožka, abnormální pigmentace kůže v oblastech vystavených slunci a silná fotocitlivost doprovázená více než 1000krát vyšším rizikem vzniku rakoviny kůže způsobené UV zářením.[4]

Cockaynův syndrom (CS)

Většina pacientů s XP-F vykazuje mírné příznaky XP, ale několik vykazuje další příznaky Cockaynova syndromu.[29] Pacienti s Cockayneovým syndromem (CS) vykazují fotocitlivost a také vývojové vady a neurologické příznaky.[4][6]

Mutace v genu ERCC4 mohou vést k velmi vzácnému syndromu XF-E.[30] Tito pacienti mají charakteristiky XP a CS, stejně jako další neurologické, hepatobiliární, muskuloskeletální a hematopoetické příznaky.

Fanconiho anémie

Několik lidských pacientů se symptomy Fanconiho anémie (FA) má kauzální mutace v genu ERCC4. Fanconiho anémie je komplexní onemocnění, zahrnující hlavní hematopoetické příznaky. Charakteristickým rysem FA je přecitlivělost na látky, které způsobují křížové vazby mezi řetězci DNA. Pacienti s FA s mutacemi ERCC4 byli klasifikováni jako pacienti patřící do Fanconiho anemické komplementární skupiny Q (FANCQ).[29][31]

ERCC4 (XPF) v normálu dvojtečka

Sekvenční sekce stejné krypta tlustého střeva s imunohistochemické barvení (hnědé) ukazující normální vysokou expresi proteinů pro opravu DNA PMS2 (A), ERCC1 (B) a ERCC4 (XPF) (C). Tato krypta pochází z biopsie 58letého muže, který nikdy neměl tlusté střevo neoplazie a krypta má vysokou expresi těchto opravných proteinů DNA v jádrech absorpčních buněk po většinu krypty. Všimněte si, že výrazy PMS2 a ERCC4 (XPF) (v panelech A a C) jsou v jádra buněk v horní části krypty a na povrchu tlustého střeva lumen mezi kryptami. Původní obrázek, také v publikaci.[32]

ERCC4 (XPF) se obvykle v buňce exprimuje na vysoké úrovni jádra uvnitř vnitřního povrchu dvojtečka (viz obrázek, panel C). Vnitřní povrch tlustého střeva je lemován jednoduchým sloupovitým epitel s invaginace. Invaginace se nazývají střevní žlázy nebo krypty tlustého střeva. Krypty tlustého střeva mají tvar mikroskopických silnostěnných zkumavek se středovým otvorem po celé délce zkumavky (krypta lumen ). Krypty jsou dlouhé asi 75 až 110 buněk. Oprava DNA, zahrnující vysokou expresi proteinů ERCC4 (XPF), PMS2 a ERCC1, se zdá být velmi aktivní v kryptách tlustého střeva v normálníchneoplastický epitel tlustého střeva.

Buňky se produkují na základně krypty a migrují nahoru podél osy krypty, než se vrhnou do tlustého střeva lumen o několik dní později.[33] Existuje 5 až 6 kmenové buňky na základnách krypt.[33] Na vnitřním povrchu průměrného člověka je asi 10 milionů krypt dvojtečka.[32] Pokud kmenové buňky na základně krypty exprimuje ERCC4 (XPF), obecně všech několik tisíc buněk krypty bude také exprimovat ERCC4 (XPF). To je naznačeno hnědou barvou viděnou imunoznačením ERCC4 (XPF) téměř ve všech buňkách v kryptě v panelu C obrázku v této části. Podobná exprese PMS2 a ERCC1 se vyskytuje v tisících buněk v každé normální kryptě tlustého střeva.

Tkáňový řez na obrázku zde také byl obarvený s hematoxylin barvit DNA v jádrech modrošedou barvou. Jádra buněk v lamina propria, buňky, které jsou pod a obklopují epitelové krypty, do značné míry vykazují modrošedou barvu hematoxylinu a mají malou expresi PMS2, ERCC1 nebo ERCC4 (XPF). Kromě toho mají buňky na samém vrcholu krypt obarvených na PMS2 (panel A) nebo ERCC4 (XPF) (panel C) nízké hladiny těchto opravných proteinů DNA, takže tyto buňky také vykazují modrošedé barvení DNA.[32]

Nedostatek ERCC4 (XPF) v epitelu tlustého střeva v sousedství a v rakovině

Sekvenční sekce segmentu dvojtečka epitel blízko a kolorektální karcinom vykazující snížený nebo chybějící výraz PMS2 (A), ERCC1 (B) a ERCC4 (C) v kryptách tlustého střeva. Tento tkáňový segment pochází z a histologicky normální oblast resekce tlustého střeva u mužského pacienta, který měl adenokarcinom v sigmoidním tlustém střevě. U PMS2 (A) chybí exprese v buněčných jádrech těla krypty, krku krypty a tlustého střeva lumen povrch pro všechny epiteliální buňky. U ERCC1 (B) je snížená exprese ve většině buněčných jader krypt, ale je vysoká exprese v buněčných jádrech na krku krypt a v sousedním tlustém střevě lumen povrch. U ERCC4 (XPF) (C) chybí exprese ve většině buněčných jader krypt a v lumenu tlustého střeva v této oblasti tkáně, ale detekovatelná exprese na krku některých krypt. Zdá se, že snížení nebo absence exprese těchto DNA opravných genů v této tkáni je způsobena epigenetická represe.[32] Původní obrázek, také v publikaci.[32]

ERCC4 (XPF) postrádá asi 55% rakoviny tlustého střeva a asi 40% krypt tlustého střeva v epitelu do 10 cm sousedících s rakovinou (v defekty pole z nichž rakovina pravděpodobně vznikla).[32] Když je ERCC4 (XPF) redukován v kryptách tlustého střeva v defektu pole, je to nejčastěji spojeno se sníženou expresí DNA opravných enzymů ERCC1 a PMS2, jak je znázorněno na obrázku v této části. Zdá se, že nedostatky ERCC1 (XPF) v epitelu tlustého střeva jsou způsobeny epigenetický represe.[32] Nedostatek ERCC4 (XPF) by vedl ke snížené opravě poškození DNA. Jak naznačili Harper a Elledge,[34] defekty ve schopnosti správně reagovat a opravit poškození DNA jsou základem mnoha forem rakoviny. Časté epigenetické snížení ERCC4 (XPF) v defektech pole obklopujících rakovinu tlustého střeva i v rakovině (spolu s epigenetickým snížením ERCC1 a PMS2) naznačuje, že takové snížení může často hrát ústřední roli v progresi rakoviny tlustého střeva.

Ačkoli jsou epigenetické redukce exprese ERCC4 (XPF) u lidských karcinomů tlustého střeva časté, mutace v ERCC4 (XPF) jsou u lidí vzácné.[35] Mutace v ERCC4 (XPF) však způsobuje, že pacienti jsou náchylní k rakovině kůže.[35] Zdá se, že zděděný polymorfismus v ERCC4 (XPF) je důležitý také u rakoviny prsu.[36] Tyto občasné mutační změny podtrhují pravděpodobnou roli deficitu ERCC4 (XPF) v progresi k rakovině.

Poznámky

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175595 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ A b C Friedberg EC, Walker GC, Siede W, Wood RD, Schultz RA, Ellenberger T (2006). Oprava DNA a mutageneze. Stiskněte ASM. ISBN  978-1555813192.
  5. ^ „Entrez Gene: ERCC4 excision repair cross-komplementující nedostatek opravy hlodavců, komplementační skupina 4“.
  6. ^ A b Gregg SQ, Robinson AR, Niedernhofer LJ (červenec 2011). "Fyziologické důsledky defektů v ERCC1-XPF DNA opravné endonukleáze". Oprava DNA. 10 (7): 781–91. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. PMC  3139823. PMID  21612988.
  7. ^ A b Westerveld A, Hoeijmakers JH, van Duin M, de Wit J, Odijk H, Pastink A, Wood RD, Bootsma D (1984). "Molekulární klonování genu pro opravu lidské DNA". Příroda. 310 (5976): 425–9. Bibcode:1984Natur.310..425W. doi:10.1038 / 310425a0. PMID  6462228. S2CID  4336902.
  8. ^ Busch D, Greiner C, Lewis K, Ford R, Adair G, Thompson L (září 1989). „Shrnutí komplementačních skupin mutantů CHO buněk citlivých na UV záření izolovaných ve velkém měřítku“. Mutageneze. 4 (5): 349–54. doi:10.1093 / mutage / 4.5.349. PMID  2687628.
  9. ^ Brookman KW, Lamerdin JE, Thelen MP, Hwang M, Reardon JT, Sancar A, Zhou ZQ, Walter CA, Parris CN, Thompson LH (listopad 1996). "ERCC4 (XPF) kóduje lidský nukleotidový excizní opravný protein s homology eukaryotické rekombinace". Molekulární a buněčná biologie. 16 (11): 6553–62. doi:10.1128 / mcb.16.11.6553. PMC  231657. PMID  8887684.
  10. ^ Sgouros J, Gaillard PH, Wood RD (březen 1999). "Vztah mezi DNA-reparační / rekombinační nukleázovou rodinou a archaeální helikázy". Trendy v biochemických vědách. 24 (3): 95–7. doi:10.1016 / s0968-0004 (99) 01355-9. PMID  10203755.
  11. ^ Enzlin JH, Schärer OD (duben 2002). „Aktivní místo endonukleázy pro opravu DNA XPF-ERCC1 tvoří vysoce konzervovaný motiv nukleázy“. Časopis EMBO. 21 (8): 2045–53. doi:10.1093 / emboj / 21.8.2045. PMC  125967. PMID  11953324.
  12. ^ Gaillard PH, Wood RD (únor 2001). „Aktivita jednotlivých podjednotek ERCC1 a XPF při opravě excize nukleotidů DNA“. Výzkum nukleových kyselin. 29 (4): 872–9. doi:10.1093 / nar / 29.4.872. PMC  29621. PMID  11160918.
  13. ^ A b Sijbers AM, de Laat WL, Ariza RR, Biggerstaff M, Wei YF, Moggs JG, Carter KC, Shell BK, Evans E, de Jong MC, Rademakers S, de Rooij J, Jaspers NG, Hoeijmakers JH, Wood RD (září 1996 ). "Xeroderma pigmentosum skupina F způsobená defektem strukturně specifické DNA opravné endonukleázy". Buňka. 86 (5): 811–22. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 80155-5. hdl:1765/3110. PMID  8797827. S2CID  12957716.
  14. ^ Bardwell AJ, Bardwell L, Tomkinson AE, Friedberg EC (září 1994). "Specifické štěpení modelových rekombinací a opravných meziproduktů kvasinkovou endonukleázou Rad1-Rad10 DNA". Věda. 265 (5181): 2082–5. Bibcode:1994Sci ... 265.2082B. doi:10.1126 / science.8091230. PMID  8091230.
  15. ^ A b Tripsianes K, Folkers G, Ab E, Das D, Odijk H, Jaspers NG, Hoeijmakers JH, Kaptein R, Boelens R (prosinec 2005). „Struktura lidských domén interakce ERCC1 / XPF odhaluje komplementární roli dvou proteinů při opravě nukleotidové excize“. Struktura. 13 (12): 1849–1858. doi:10.1016 / j.str.2005.08.014. hdl:1874/14818. ISSN  1633-8413. PMID  16338413.
  16. ^ Faridounnia M, Wienk H, Kovačič L, Folkers GE, Jaspers NG, Kaptein R, Hoeijmakers JH, Boelens R (srpen 2015). „Cerebro-okulo-facio-skeletální syndromová bodová mutace F231L v proteinu pro opravu DNA ERCC1 způsobuje disociaci komplexu ERCC1-XPF“. J Biol Chem. 290 (33): 20541–20555. doi:10,1074 / jbc.M114,635169. ISSN  1083-351X. PMC  4536458. PMID  26085086.
  17. ^ Wood RD, Burki HJ, Hughes M, Poley A (únor 1983). „Radiací indukovaná letalita a mutace v buněčné linii CHO s nedostatkem opravy“. International Journal of Radiation Biology and Related Studies in Physics, Chemistry, and Medicine. 43 (2): 207–13. doi:10.1080/09553008314550241. PMID  6600735.
  18. ^ Ahmad A, Robinson AR, Duensing A, van Drunen E, Beverloo HB, Weisberg DB, Hasty P, Hoeijmakers JH, Niedernhofer LJ (srpen 2008). „Endonukleáza ERCC1-XPF usnadňuje opravu dvouřetězcového zlomu DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 28 (16): 5082–92. doi:10.1128 / MCB.00293-08. PMC  2519706. PMID  18541667.
  19. ^ Sargent RG, Rolig RL, Kilburn AE, Adair GM, Wilson JH, Nairn RS (listopad 1997). "Tvorba delece závislé na deleci v savčích buňkách deficitní v nukleotidovém excizním opravném genu ERCC1". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (24): 13122–7. Bibcode:1997PNAS ... 9413122S. doi:10.1073 / pnas.94.24.13122. PMC  24273. PMID  9371810.
  20. ^ Al-Minawi AZ, Saleh-Gohari N, Helleday T (leden 2008). „Endonukleáza ERCC1 / XPF je vyžadována pro účinné jednovláknové žíhání a genovou konverzi v savčích buňkách“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (1): 1–9. doi:10.1093 / nar / gkm888. PMC  2248766. PMID  17962301.
  21. ^ Bennardo N, Cheng A, Huang N, Stark JM (červen 2008). „Alternativní NHEJ je mechanicky odlišná cesta opravy poškození savčích chromozomů“. Genetika PLOS. 4 (6): e1000110. doi:10.1371 / journal.pgen.1000110. PMC  2430616. PMID  18584027.
  22. ^ Ahmad A, Robinson AR, Duensing A, van Drunen E, Beverloo HB, Weisberg DB, Hasty P, Hoeijmakers JH, Niedernhofer LJ (srpen 2008). „Endonukleáza ERCC1-XPF usnadňuje opravu dvouřetězcového zlomu DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 28 (16): 5082–92. doi:10.1128 / MCB.00293-08. PMC  2519706. PMID  18541667.
  23. ^ Niedernhofer LJ, Essers J, Weeda G, Beverloo B, de Wit J, Muijtjens M, Odijk H, Hoeijmakers JH, Kanaar R (listopad 2001). „Strukturně specifická endonukleáza Ercc1-Xpf je nutná pro cílenou náhradu genů v embryonálních kmenových buňkách“. Časopis EMBO. 20 (22): 6540–9. doi:10.1093 / emboj / 20.22.6540. PMC  125716. PMID  11707424.
  24. ^ Wood RD (červenec 2010). "Savčí nukleotidové excizní opravné proteiny a mezivláknová oprava zesítění". Environmentální a molekulární mutageneze. 51 (6): 520–6. doi:10.1002 / em. 20569. PMC  3017513. PMID  20658645.
  25. ^ Sargent RG, Rolig RL, Kilburn AE, Adair GM, Wilson JH, Nairn RS (listopad 1997). "Tvorba delece závislé na deleci v savčích buňkách deficitní v nukleotidovém excizním opravném genu ERCC1". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (24): 13122–7. Bibcode:1997PNAS ... 9413122S. doi:10.1073 / pnas.94.24.13122. PMC  24273. PMID  9371810.
  26. ^ Klein Douwel D, Boonen RA, Long DT, Szypowska AA, Räschle M, Walter JC, Knipscheer P (květen 2014). „XPF-ERCC1 působí v rámci Unhooking DNA interstrand crosslinks ve spolupráci s FANCD2 a FANCP / SLX4“. Molekulární buňka. 54 (3): 460–71. doi:10.1016 / j.molcel.2014.03.015. PMC  5067070. PMID  24726325.
  27. ^ Rahn JJ, Adair GM, Nairn RS (červenec 2010). "Více rolí ERCC1-XPF při opravě křížového síťování savců". Environmentální a molekulární mutageneze. 51 (6): 567–81. doi:10.1002 / em.20583. PMID  20658648. S2CID  29240680.
  28. ^ Clauson C, Schärer OD, Niedernhofer L (říjen 2013). „Pokroky v porozumění složitým mechanismům opravy DNA mezi řetězci“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 5 (10): a012732. doi:10.1101 / cshperspect.a012732. PMC  4123742. PMID  24086043.
  29. ^ A b Kashiyama K, Nakazawa Y, Pilz DT, Guo C, Shimada M, Sasaki K, Fawcett H, Wing JF, Lewin SO, Carr L, Li TS, Yoshiura K, Utani A, Hirano A, Yamashita S, Greenblatt D, Nardo T , Stefanini M, McGibbon D, Sarkany R, Fassihi H, Takahashi Y, Nagayama Y, Mitsutake N, Lehmann AR, Ogi T (květen 2013). „Porucha nukleázy ERCC1-XPF vede k různým klinickým projevům a způsobuje Cockaynův syndrom, xeroderma pigmentosum a Fanconiho anémii“. American Journal of Human Genetics. 92 (5): 807–19. doi:10.1016 / j.ajhg.2013.04.007. PMC  3644632. PMID  23623389.
  30. ^ Niedernhofer LJ, Garinis GA, Raams A, Lalai AS, Robinson AR, Appeldoorn E, Odijk H, Oostendorp R, Ahmad A, van Leeuwen W, Theil AF, Vermeulen W, van der Horst GT, Meinecke P, Kleijer WJ, Vijg J , Jaspers NG, Hoeijmakers JH (prosinec 2006). „Nový progeroidní syndrom odhaluje, že genotoxický stres potlačuje somatotrofní osu“. Příroda. 444 (7122): 1038–43. Bibcode:2006Natur.444.1038N. doi:10.1038 / nature05456. PMID  17183314. S2CID  4358515.
  31. ^ Bogliolo M, Schuster B, Stoepker C, Derkunt B, Su Y, Raams A, Trujillo JP, Minguillón J, Ramírez MJ, Pujol R, Casado JA, Baños R, Rio P, Knies K, Zúñiga S, Benítez J, Bueren JA , Jaspers NG, Schärer OD, de Winter JP, Schindler D, Surrallés J (květen 2013). „Mutace v ERCC4 kódující endonukleázu XPF opravující DNA způsobují Fanconiho anémii“. American Journal of Human Genetics. 92 (5): 800–6. doi:10.1016 / j.ajhg.2013.04.002. PMC  3644630. PMID  23623386.
  32. ^ A b C d E F G Facista A, Nguyen H, Lewis C, Prasad AR, Ramsey L, Zaitlin B, Nfonsam V, Krouse RS, Bernstein H, Payne CM, Stern S, Oatman N, Banerjee B, Bernstein C (2012). „Nedostatečná exprese DNA opravných enzymů v časném postupu ke sporadické rakovině tlustého střeva“. Genome Integr. 3 (1): 3. doi:10.1186/2041-9414-3-3. PMC  3351028. PMID  22494821.
  33. ^ A b Baker AM, Cereser B, Melton S, Fletcher AG, Rodriguez-Justo M, Tadrous PJ, Humphries A, Elia G, McDonald SA, Wright NA, Simons BD, Jansen M, Graham TA (2014). „Kvantifikace vývoje krypty a kmenových buněk v normálním a neoplastickém lidském tlustém střevě“. Cell Rep. 8 (4): 940–7. doi:10.1016 / j.celrep.2014.07.019. PMC  4471679. PMID  25127143.
  34. ^ Harper JW, Elledge SJ (2007). „Odpověď na poškození DNA: deset let poté“. Mol. Buňka. 28 (5): 739–45. doi:10.1016 / j.molcel.2007.11.015. PMID  18082599.
  35. ^ A b Gregg SQ, Robinson AR, Niedernhofer LJ (2011). "Fyziologické důsledky defektů v ERCC1-XPF DNA opravné endonukleáze". Oprava DNA (Amst.). 10 (7): 781–91. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. PMC  3139823. PMID  21612988.
  36. ^ Lee E, Levine EA, Franco VI, Allen GO, Gong F, Zhang Y, Hu JJ (2014). "Kombinované modely genetického a výživového rizika trojnásobně negativního karcinomu prsu". Rakovina výživy. 66 (6): 955–63. doi:10.1080/01635581.2014.932397. PMID  25023197. S2CID  22065506.

externí odkazy