Replikační protein A2 - Replication protein A2

RPA2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 DPU, 1L1O, 1QUQ, 1Z1D, 2PI2, 2PQA, 2Z6K, 3KDF, 4MQV, 4OU0
Identifikátory
Aliasy	RPA2„REPA2, RP-A p32, RP-A p34, RPA32, replikační protein A2
Externí ID	OMIM: 179836 MGI: 1339939 HomoloGene: 37712 Genové karty: RPA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	27,914,746 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	132,778,752 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba N-konce proteinu; • jednořetězcová vazba DNA; • poškozená vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu; • vázání proteinové fosfatázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • Vazba telomerické DNA na vlákno bohaté na G; • dvouřetězcová vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• místo dvouvláknového zlomu; • Tělo PML; • nukleoplazma; • chromozom, telomerická oblast; • Komplex faktoru replikace DNA; • chromatin; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • jaderné těleso; • kondenzovaný jaderný chromozom;
Biologický proces	• oprava nukleotidovou excizí, vyplnění mezery DNA; • DNA rekombinace; • oprava křížového propojení mezi řetězci; • regulace opravy dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace; • bezchybná syntéza překladu; • Fáze G1; • syntéza překladu náchylná k chybám; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • replikace DNA; • kontrolní bod poškození mitotické G1 DNA; • regulace kontrolního bodu poškození DNA; • regulace buněčné reakce na teplo; • oprava nesouladu; • syntéza překladů; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • oprava základní excize; • oprava nukleotidovou excizí; • oprava nukleotidovou excizí, stabilizace preincision komplexu; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • Oprava DNA; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace; • oprava nukleotidovou excizí, preincision komplexní sestava; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 3'-k lézi; • lokalizace proteinu do chromozomu; • údržba telomer; • údržba telomer prostřednictvím semi-konzervativní replikace; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • údržba telomer prostřednictvím rekombinace; • Topologická změna DNA; • Odvíjení DNA zapojené do replikace DNA; • mitotická rekombinace; • údržba telomer prostřednictvím telomerázy; • reciproční meiotická rekombinace; • tvorba heteroduplexu; • pozitivní regulace aktivity helikázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6118
	19891
	ENSG00000117748
	ENSMUSG00000028884
	P15927
	Q62193
	NM_001286076; NM_001297558; NM_002946; NM_001355128; NM_001355129
	NM_011284
	NP_001273005; NP_001284487; NP_002937; NP_001342057; NP_001342058
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Replikační protein A 32 kDa podjednotka je protein že u lidí je kódován RPA2 gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že RPA2 komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117748 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028884 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (březen 1993). "Klonování, nadměrná exprese a genomové mapování 14-kDa podjednotky lidského replikačního proteinu A". The Journal of Biological Chemistry. 268 (9): 6131–8. PMID 8454588.
^ „Entrez Gene: RPA2 replikační protein A2, 32 kDa“.
^ Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava excize základny v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.
^ ^A ^b ^C Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (březen 1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA protein-kinázou závislou na DNA a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. Časopis EMBO. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.
^ Sukhodolets KE, Hickman AB, Agarwal SK, Sukhodolets MV, Obungu VH, Novotny EA, Crabtree JS, Chandrasekharappa SC, Collins FS, Spiegel AM, Burns AL, Marx SJ (leden 2003). „32kD podjednotka replikačního proteinu A interaguje s meninem, produktem supresorového genu MEN1“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (2): 493–509. doi:10.1128 / mcb.23.2.493-509.2003. PMC 151531. PMID 12509449.
^ ^A ^b Bochkareva E, Korolev S, Lees-Miller SP, Bochkarev A (duben 2002). „Struktura RPA trimerizačního jádra a jeho role v vícestupňovém mechanismu vázání DNA RPA“. Časopis EMBO. 21 (7): 1855–63. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1855. PMC 125950. PMID 11927569.
^ Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (únor 1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.
^ Kim J, Kim D, Chung J (2000). „Replikační protein a 32 kDa podjednotka (RPA p32) váže doménu SH2 STAT3 a reguluje její transkripční aktivitu.“ Cell Biology International. 24 (7): 467–73. doi:10.1006 / cbir.2000.0525. PMID 10875894.
^ Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (srpen 2005). „53BP1 je spojen s replikačním proteinem A a je vyžadován pro hyperfosforylaci RPA2 po poškození DNA“. Onkogen. 24 (35): 5423–30. doi:10.1038 / sj.onc.1208710. PMID 15856006.
^ Nagelhus TA, Haug T, Singh KK, Keshav KF, Skorpen F, Otterlei M, Bharati S, Lindmo T, Benichou S, Benarous R, Krokan HE (březen 1997). „Sekvence v N-koncové oblasti lidské uracil-DNA glykosylázy s homologií k XPA interaguje s C-koncovou částí 34-kDa podjednotky replikačního proteinu A“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (10): 6561–6. doi:10.1074 / jbc.272.10.6561. PMID 9045683.

Další čtení

Dutta A, Stillman B (červen 1992). "kinázy rodiny cdc2 fosforylují lidský buněčný replikační faktor DNA, RPA a aktivují replikaci DNA". Časopis EMBO. 11 (6): 2189–99. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05278.x. PMC 556686. PMID 1318195.
Erdile LF, Wold MS, Kelly TJ (únor 1990). "Primární struktura podjednotky 32-kDa lidského replikačního proteinu A". The Journal of Biological Chemistry. 265 (6): 3177–82. PMID 2406247.
Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (říjen 1995). „Interakce mezi faktorem opravy DNA XPA a replikačním proteinem A se jeví nezbytná pro opravu excize nukleotidů“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (10): 5396–402. doi:10,1128 / mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.
Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (březen 1994). „Genomické mapování tří genů lidského replikačního proteinu A (RPA1, RPA2 a RPA3) s vysokým rozlišením“. Genomika. 20 (2): 249–57. doi:10.1006 / geno.1994.1161. PMID 8020972.
Nagelhus TA, Haug T, Singh KK, Keshav KF, Skorpen F, Otterlei M, Bharati S, Lindmo T, Benichou S, Benarous R, Krokan HE (březen 1997). „Sekvence v N-koncové oblasti lidské uracil-DNA glykosylázy s homologií k XPA interaguje s C-koncovou částí 34-kDa podjednotky replikačního proteinu A“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (10): 6561–6. doi:10.1074 / jbc.272.10.6561. PMID 9045683.
Amacker M, Hottiger M, Mossi R, Hübscher U (březen 1997). „Nukleokapsidový protein HIV-1 a replikační protein A ovlivňují syntézu DNA vytěsnění řetězce lentivirové reverzní transkriptázy“. AIDS. 11 (4): 534–6. PMID 9084803.
Niu H, Erdjument-Bromage H, Pan ZQ, Lee SH, Tempst P, Hurwitz J (květen 1997). „Mapování aminokyselinových zbytků v podjednotce p34 lidského jednořetězcového proteinu vázajícího DNA fosforylovaného pomocí DNA-dependentní protein kinázy a Cdc2 kinázy in vitro“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (19): 12634–41. doi:10.1074 / jbc.272.19.12634. PMID 9139719.
Zernik-Kobak M, Vasunia K, Connelly M, Anderson CW, Dixon K (září 1997). "Místa UV-indukované fosforylace podjednotky p34 replikačního proteinu A z buněk HeLa". The Journal of Biological Chemistry. 272 (38): 23896–904. doi:10.1074 / jbc.272.38.23896. PMID 9295339.
Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (únor 1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.
Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (březen 1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA protein-kinázou závislou na DNA a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. Časopis EMBO. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.
Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava excize základny v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.
Bochkarev A, Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM (srpen 1999). „Krystalová struktura komplexu replikačních proteinů A podjednotek RPA32 a RPA14 odhaluje mechanismus pro jednořetězcovou vazbu DNA“. Časopis EMBO. 18 (16): 4498–504. doi:10.1093 / emboj / 18.16.4498. PMC 1171524. PMID 10449415.
Lao Y, Gomes XV, Ren Y, Taylor JS, Wold MS (únor 2000). „Interakce replikačního proteinu A s DNA. III. Molekulární podstata rozpoznávání poškozené DNA“. Biochemie. 39 (5): 850–9. doi:10.1021 / bi991704s. PMID 10653628.
Costello JF, Frühwald MC, Smiraglia DJ, Rush LJ, Robertson GP, Gao X, Wright FA, Feramisco JD, Peltomäki P, Lang JC, Schuller DE, Yu L, Bloomfield CD, Caligiuri MA, Yates A, Nishikawa R, Su Huang H, Petrelli NJ, Zhang X, O'Dorisio MS, Held WA, Cavenee WK, Plass C (únor 2000). „Aberantní CpG-ostrovní methylace má nenáhodné a specifické typy nádorů“. Genetika přírody. 24 (2): 132–8. doi:10.1038/72785. PMID 10655057.
Kim J, Kim D, Chung J (2000). „Replikační protein a 32 kDa podjednotka (RPA p32) váže doménu SH2 STAT3 a reguluje její transkripční aktivitu.“ Cell Biology International. 24 (7): 467–73. doi:10.1006 / cbir.2000.0525. PMID 10875894.
Cho JM, Song DJ, Bergeron J, Benlimame N, Wold MS, Alaoui-Jamali MA (září 2000). „RBT1, nový transkripční koaktivátor, váže druhou podjednotku replikačního proteinu A“. Výzkum nukleových kyselin. 28 (18): 3478–85. doi:10.1093 / nar / 28.18.3478. PMC 110737. PMID 10982866.
Kartáč GS, Kelly TJ (říjen 2000). „Fosforylace replikačního proteinu Velká podjednotka v odpovědi kontrolního bodu Saccharomyces cerevisiae“. Výzkum nukleových kyselin. 28 (19): 3725–32. doi:10.1093 / nar / 28.19.3725. PMC 110765. PMID 11000264.
Mer G, Bochkarev A, Gupta R, Bochkareva E, Frappier L, Ingles CJ, Edwards AM, Chazin WJ (říjen 2000). "Strukturální základna pro rozpoznání DNA opravných proteinů UNG2, XPA a RAD52 replikačním faktorem RPA". Buňka. 103 (3): 449–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00136-7. PMID 11081631.
Habel JE, Ohren JF, Borgstahl GE (únor 2001). „Dynamická analýza rozptylu světla celého lidského dimeru RPA14 / 32: čištění, krystalizace a vlastní asociace“. Acta Crystallographica oddíl D. 57 (Pt 2): 254–9. doi:10.1107 / S0907444900015225. PMID 11173472.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117748 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028884 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8454588-5] Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (březen 1993). "Klonování, nadměrná exprese a genomové mapování 14-kDa podjednotky lidského replikačního proteinu A". The Journal of Biological Chemistry. 268 (9): 6131–8. PMID 8454588.

[6] „Entrez Gene: RPA2 replikační protein A2, 32 kDa“.

[pmid10393198-7] Otterlei M, Warbrick E, Nagelhus TA, Haug T, Slupphaug G, Akbari M, Aas PA, Steinsbekk K, Bakke O, Krokan HE (červenec 1999). "Postreplikativní oprava excize základny v ohniscích replikace". Časopis EMBO. 18 (13): 3834–44. doi:10.1093 / emboj / 18.13.3834. PMC 1171460. PMID 10393198.

[pmid10064605-8] A ^b ^C Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (březen 1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA protein-kinázou závislou na DNA a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. Časopis EMBO. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.

[pmid12509449-9] Sukhodolets KE, Hickman AB, Agarwal SK, Sukhodolets MV, Obungu VH, Novotny EA, Crabtree JS, Chandrasekharappa SC, Collins FS, Spiegel AM, Burns AL, Marx SJ (leden 2003). „32kD podjednotka replikačního proteinu A interaguje s meninem, produktem supresorového genu MEN1“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (2): 493–509. doi:10.1128 / mcb.23.2.493-509.2003. PMC 151531. PMID 12509449.

[pmid11927569-10] A ^b Bochkareva E, Korolev S, Lees-Miller SP, Bochkarev A (duben 2002). „Struktura RPA trimerizačního jádra a jeho role v vícestupňovém mechanismu vázání DNA RPA“. Časopis EMBO. 21 (7): 1855–63. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1855. PMC 125950. PMID 11927569.

[pmid9461578-11] Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (únor 1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.

[pmid10875894-12] Kim J, Kim D, Chung J (2000). „Replikační protein a 32 kDa podjednotka (RPA p32) váže doménu SH2 STAT3 a reguluje její transkripční aktivitu.“ Cell Biology International. 24 (7): 467–73. doi:10.1006 / cbir.2000.0525. PMID 10875894.

[pmid15856006-13] Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (srpen 2005). „53BP1 je spojen s replikačním proteinem A a je vyžadován pro hyperfosforylaci RPA2 po poškození DNA“. Onkogen. 24 (35): 5423–30. doi:10.1038 / sj.onc.1208710. PMID 15856006.

[pmid9045683-14] Nagelhus TA, Haug T, Singh KK, Keshav KF, Skorpen F, Otterlei M, Bharati S, Lindmo T, Benichou S, Benarous R, Krokan HE (březen 1997). „Sekvence v N-koncové oblasti lidské uracil-DNA glykosylázy s homologií k XPA interaguje s C-koncovou částí 34-kDa podjednotky replikačního proteinu A“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (10): 6561–6. doi:10.1074 / jbc.272.10.6561. PMID 9045683.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]