GMP syntáza - GMP synthase - Wikipedia

GMP syntetáza
(hydrolyzující glutamin)
2vxo.jpg
GMP syntetáza, lidská
Identifikátory
EC číslo6.3.5.2
Číslo CAS37318-71-1
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO
Terminálová doména GMP syntetázy C
PDB 1gpm EBI.jpg
escherichia coli gmp syntetáza komplexovaná s amp a pyrofosfátem.[1]
Identifikátory
SymbolGMP_synt_C
PfamPF00958
InterProIPR001674
STRÁNKAPDOC00405
SCOP21 g / min / Rozsah / SUPFAM
GMPS
Protein GMPS PDB 2VPI.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyGMPS, GMP syntáza, guanin monofosfát syntáza, GATD7, GMP syntáza
Externí IDOMIM: 600358 MGI: 2448526 HomoloGene: 68367 Genové karty: GMPS
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[2]
Chromozom 3 (lidský)
Genomické umístění pro GMPS
Genomické umístění pro GMPS
Kapela3q25.31Start155,870,650 bp[2]
Konec155,944,020 bp[2]
Exprese RNA vzor
PBB GE GMPS 214431 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

8833

229363

Ensembl

ENSG00000163655

ENSMUSG00000027823

UniProt

P49915

Q3THK7

RefSeq (mRNA)

NM_003875

NM_001033300

RefSeq (protein)

NP_003866

NP_001028472

Místo (UCSC)Chr 3: 155,87 - 155,94 MbChr 3: 63,98 - 64,02 Mb
PubMed Vyhledávání[4][5]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Guanosinmonofosfát syntetáza, (EC 6.3.5.2) také známý jako GMPS je enzym který převádí xanthosinmonofosfát na guanosinmonofosfát.[6]

Při syntéze purinových nukleotidů de novo je IMP metabolitem odbočky, přičemž v tomto bodě se cesta odchyluje od syntézy guaninových nebo adeninových nukleotidů. Na guaninové nukleotidové dráze se podílejí na přeměně IMP na GMP 2 enzymy, jmenovitě IMP dehydrogenáza (IMPD1), která katalyzuje oxidaci IMP na XMP, a GMP syntetáza, která katalyzuje aminaci XMP na GMP.[6]

Enzymologie

v enzymologie, a GMP syntetáza (hydrolyzující glutamin) (ES 6.3.5.2 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce

ATP + xanthosin 5'-fosfát + L-glutamin + H2Ó AMP + difosfát + GMP + L-glutamát

4 substráty tohoto enzymu jsou ATP, xanthosin 5'-fosfát, L-glutamin, a H2Ó, zatímco jeho 4 produkty jsou AMP, difosfát, GMP, a L-glutamát.

Tento enzym patří do rodiny ligázy, konkrétně těch, které tvoří vazby uhlík-dusík uhlík-dusíkaté ligázy s glutaminem jako amido-N-donorem. The systematické jméno této třídy enzymů je xanthosin-5'-fosfát:L-glutaminová amidoligáza (tvořící AMP). Mezi další běžně používaná jména patří GMP syntetáza (hydrolyzující glutamin), guanylát syntetáza (hydrolyzující glutamin), guanosinmonofosfát syntetáza (hydrolyzující glutamin), xanthosin 5'-fosfát amidotransferáza, a guanosin 5'-monofosfát syntetáza. Tento enzym se účastní metabolismus purinů a metabolismus glutamátu. Alespoň jedna sloučenina, Psikofuranin je známo inhibovat tento enzym.

Strukturální studie

Ke konci roku 2007, 5 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1 GPM, 1WL8, 2A9V, 2D7J, a 2DPL.

Reference

  1. ^ Tesmer JJ, Klem TJ, Deras ML, Davisson VJ, Smith JL (leden 1996). „Krystalová struktura GMP syntetázy odhaluje novou katalytickou triádu a je strukturálním vzorem pro dvě rodiny enzymů.“ Přírodní strukturní biologie. 3 (1): 74–86. doi:10.1038 / nsb0196-74. PMID  8548458. S2CID  30864133.
  2. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163655 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027823 - Ensembl, Květen 2017
  4. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  6. ^ A b „Entrez Gene: GMPS guanin monfosfát syntetáza“.

Další čtení

  • Strana T, Bakay B, Nyhan WL (1984). "Lidská GMP syntetáza". International Journal of Biochemistry. 16 (1): 117–20. doi:10.1016 / 0020-711X (84) 90061-2. PMID  6698284.
  • Nakamura J, Straub K, Wu J, Lou L (říjen 1995). „Funkce hydrolýzy glutaminu u lidské GMP syntetázy. Identifikace esenciálního aktivního cysteinu“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (40): 23450–5. doi:10.1074 / jbc.270.40.23450. PMID  7559506.
  • Nakamura J, Lou L (březen 1995). "Biochemická charakterizace lidské GMP syntetázy". The Journal of Biological Chemistry. 270 (13): 7347–53. doi:10.1074 / jbc.270.13.7347. PMID  7706277.
  • Hirst M, Haliday E, Nakamura J, Lou L (září 1994). "Lidská GMP syntetáza. Purifikace proteinů, klonování a funkční exprese cDNA". The Journal of Biological Chemistry. 269 (38): 23830–7. PMID  8089153.
  • Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Fedorova L, Kost-Alimova M, Gizatullin RZ, Alimov A, Zabarovska VI, Szeles A a kol. (1997). „Přiřazení a uspořádání dvaceti tří jedinečných klonů spojujících NotI obsahujících exprimované geny, včetně genu guanosin 5'-monofosfát syntetázy, k lidskému chromozomu 3“. European Journal of Human Genetics. 5 (2): 110–6. doi:10.1159/000484744. PMID  9195163.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Pegram LD, Megonigal MD, Lange BJ, Nowell PC, Rowley JD, Rappaport EF, Felix CA (prosinec 2000). „translokace t (3; 11) u akutní myeloidní leukémie související s léčbou spojuje MLL s genem GMPS (GUANOSINE 5 'MONOPHOSPHATE SYNTHETASE)“. Krev. 96 (13): 4360–2. doi:10,1182 / krev. V96.13.4360. PMID  11110714.
  • Guo D, Han J, Adam BL, Colburn NH, Wang MH, Dong Z a kol. (Prosinec 2005). "Proteomická analýza substrátů SUMO4 v buňkách HEK293 pod stresem vyvolaným hladovým sérovým účinkem". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 337 (4): 1308–18. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID  16236267.
  • Abrams R, Bentley M (1959). "Biosyntéza purinů nukleových kyselin. III. Tvorba guanosin 5'-fosfátu z xanthosin 5'-fosfátu a L-glutaminu". Oblouk. Biochem. Biophys. 79: 91–110. doi:10.1016/0003-9861(59)90383-2.
  • Lagerkvist U (červenec 1958). "Biosyntéza guanosin 5'-fosfátu. II. Aminace xanthosin 5'-fosfátu čištěným enzymem z holubích jater". The Journal of Biological Chemistry. 233 (1): 143–9. PMID  13563458.

externí odkazy