AIR syntetáza (FGAM cykláza) - AIR synthetase (FGAM cyclase)
fosforibosylformylglycinamidin cykloligáza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
EC číslo | 6.3.3.1 | ||||||||
Číslo CAS | 9023-53-4 | ||||||||
Databáze | |||||||||
IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
AIR syntetáza je pátý enzym v de novo syntéza purin nukleotidy. Katalyzuje reakci za vzniku 5-aminoimidazol ribotid (AIR) z formylglycinamidin-ribonukleotid FGAM. Tato reakce uzavře kruh a vytvoří 5členný imidazolový kruh purinového jádra (AIR):
AIR syntetáza katalyzuje přenos kyslíku formylové skupiny na fosfát. Jedná se o sekvenční mechanismus, ve kterém se ATP váže jako první na enzym a ADP se uvolňuje jako poslední. Tento enzym hydrolyzuje ATP za účelem aktivace kyslíku amidu za účelem provedení nukleofilního útoku dusíkem. U lidí a mnoha dalších zvířat je tento enzym obsažen v trifunkční purinový biosyntetický protein adenosin-3 polypeptid.
Nomenklatura
The systematické jméno z této třídy enzymů je 2- (formamido) -Nl- (5-fosforibosyl) acetamidincykloligáza (tvořící ADP). Mezi další běžně používaná jména patří:
- AIR syntetáza,
- 5'-aminoimidazol ribonukleotid syntetáza,
- 2- (formamido) -1-N- (5-fosforibosyl) acetamidin cykloligáza (tvořící ADP),
- fosforibosylaminoimidazol syntetáza a
- fosforibosylformylglycinamidin cykloligáza.
Purinová syntéza
Puriny jsou jedním ze dvou typů dusíkatých heterocyklických bází, které jsou jednou ze tří složek nukleotidů, které tvoří nukleové kyseliny. Syntéza může být de novo nebo záchranná - AIR syntetáza je součástí de novo cesta. První potvrzený krok de novo dráhy začíná fosforibosylpyrofosfátem (PRPP) a konečným produktem je inosinmonofosfát (IMP). IMP se nakonec převede na puriny AMP nebo GMP. Purinová kruhová struktura se skládá z připojení 1 nebo 2 atomů najednou k ribózovému cukru. The de novo cesta má tendenci být zachována u většiny organismů.
Cowpea AIR syntetáza
Synthetáza AIR se nachází v obou mitochondrie a plastidy; mitochondriální forma má o 5 více aminokyselin než plastidová forma.[1] Enzym je u cowpeas kódován jediným genem, a to navzdory skutečnosti, že existuje v různých formách v plastidech a mitochondriích. To naznačuje, že různé verze mohou být odvozeny z jednoho přepisu. Jedna studie navrhuje, aby existovala přísná transkripční kontrola pur5, genu kódujícího AIR syntetázu.[2]
Reference
- ^ Goggin DE, Lipscombe R, Fedorova E, Millar AH, Mann A, Atkins CA, Smith PM (březen 2003). „Duální intracelulární lokalizace a cílení na aminoimidazolovou ribonukleotidovou syntetázu v Cowpea“. Plant Physiol. 131 (3): 1033–41. doi:10.1104 / pp.102.015081. PMC 166869. PMID 12644656.
- ^ Smith PM, Mann AJ, Goggin DE, Atkins CA (duben 1998). „AIR syntetáza v uzlech cowpea: produkt jediného genu zaměřený na dvě organely?“. Plant Mol. Biol. 36 (6): 811–20. doi:10.1023 / A: 1005969830314. PMID 9520274.
Další čtení
- Levenberg B, Buchanan JM (1957). "Biosyntéza purinů. XII. Struktura, enzymatická syntéza a metabolismus 5-amino-imidazol ribotidu". J. Biol. Chem. 224 (2): 1005–18. PMID 13405929.
- Levenberg B, Buchanan JM (1957). "Biosyntéza purinů. XIII. Struktura, enzymatická syntéza a metabolismus (alfa-N-formyl) -glycinamidin ribotidu". J. Biol. Chem. 224 (2): 1019–27. PMID 13405930.
- Li C, Kappock TJ, Stubbe J, Weaver TM, Ealick SE (1999). „Rentgenová krystalová struktura aminoimidazol ribonukleotid syntetázy (PurM) z purinové biosyntetické dráhy Escherichia coli v rozlišení 2,5 A“. Struktura. 7 (9): 1155–66. doi:10.1016 / S0969-2126 (99) 80182-8. PMID 10508786.
externí odkazy
- AIR + syntetáza v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)