UBE3A - UBE3A

UBE3A
Protein UBE3A PDB 1c4z.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyUBE3A, ANCR, AS, E6-AP, EPVE6AP, HPVE6A, ubikvitinová proteinová ligáza E3A
Externí IDOMIM: 601623 MGI: 105098 HomoloGene: 7988 Genové karty: UBE3A
Umístění genu (člověk)
Chromozom 15 (lidský)
Chr.Chromozom 15 (lidský)[1]
Chromozom 15 (lidský)
Genomické umístění pro UBE3A
Genomické umístění pro UBE3A
Kapela15q11.2Start25,333,728 bp[1]
Konec25,439,051 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE UBE3A 213128 s na fs.png

PBB GE UBE3A 211285 s na fs.png

PBB GE UBE3A 211575 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

7337

22215

Ensembl

ENSG00000114062

ENSMUSG00000025326

UniProt

Q05086

O08759

RefSeq (mRNA)

NM_001033962
NM_011668
NM_173010

RefSeq (protein)

NP_001029134
NP_035798

Místo (UCSC)Chr 15: 25,33 - 25,44 MbChr 7: 59,23 - 59,31 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Ubikvitin-protein ligáza E3A (UBE3A) také známý jako E6AP ubikvitin-protein ligáza (E6AP) je enzym že u lidí je kódován UBE3A gen. Tento enzym se podílí na cílení bílkoviny pro degradaci uvnitř buňky.

Degradace bílkovin je normální proces, který odstraňuje poškozené nebo nepotřebné proteiny a pomáhá udržovat normální funkce buněk. Ubikvitinová proteinová ligáza E3A váže malý markerový protein zvaný ubikvitin na proteiny, které by měly být degradovány. Volaly buněčné struktury proteazomy rozpoznat a strávit bílkoviny označené ubikvitinem.

Obě kopie genu UBE3A jsou aktivní ve většině tkání těla. Ve většině neurony je však obvykle aktivní pouze kopie zděděná po matce osoby (mateřská kopie); toto je známé jako otcovské potisk. Nedávné důkazy ukazují, že alespoň některé gliové buňky a neurony mohou vykazovat bialelickou expresi UBE3A.[5][6] Je tedy zapotřebí další práce k vymezení úplné mapy potisku UBE3A u lidí a modelových organismů, jako jsou myši. Předpokládá se, že k umlčení Ube3a na otcovské alele dochází prostřednictvím Ube3a-ATS část a lincRNA s názvem „LNCAT“,[7] (Velký nekódující antisense přepis).

Gen UBE3A se nachází na dlouhém (q) rameni chromozom 15 mezi pozicemi 11 a 13, od základní pár 23 133 488 na základní pár 23 235 220.

Klinický význam

Mutace v rámci genu UBE3A jsou zodpovědné za některé případy Angelmanov syndrom a Prader-Williho syndrom. Většina z těchto mutací vede k abnormálně krátké, nefunkční verzi ubikvitinové proteinové ligázy E3A. Protože kopie genu zděděného po otci člověka (otcovská kopie) je v mozku normálně neaktivní, mutace ve zbývající mateřské kopii brání produkci kteréhokoli z enzymů v mozku. Tato ztráta funkce enzymu pravděpodobně způsobí charakteristické rysy těchto dvou stavů.

Gen UBE3A leží v lidské chromozomální oblasti 15q11-13. Další abnormality v této oblasti chromozom 15 může také způsobit Angelmanov syndrom. Tyto chromozomální změny zahrnují delece, přesmyky (translokace ) genetického materiálu a dalších abnormalit. Stejně jako mutace v genu zabraňují tyto chromozomální změny produkci jakékoli funkční ubikvitinové proteinové ligázy E3A v mozku.

Interakce

UBE3A bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114062 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025326 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Jones KA, Han JE, DeBruyne JP, Philpot BD (červen 2016). „Trvalá neuronální exprese Ube3a v suprachiasmatickém jádru modelových myší s Angelmanovým syndromem“. Vědecké zprávy. 6 (1): 28238. Bibcode:2016NatSR ... 628238J. doi:10.1038 / srep28238. PMC  4910164. PMID  27306933.
  6. ^ Grier MD, Carson RP, Lagrange AH ​​(2015-04-20). „Směrem k širšímu pohledu na Ube3a u myšího modelu Angelmanova syndromu: výraz v mozku, míše, sedacím nervu a gliových buňkách“. PLOS ONE. 10 (4): e0124649. Bibcode:2015PLoSO..1024649G. doi:10.1371 / journal.pone.0124649. PMC  4403805. PMID  25894543.
  7. ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (listopad 2001). „Transkript IC-SNURF-SNRPN slouží jako hostitel pro několik malých druhů nukleolárních RNA a jako antisense RNA pro UBE3A.“. Lidská molekulární genetika. 10 (23): 2687–700. doi:10,1093 / hmg / 10,23,2687. PMID  11726556.
  8. ^ A b Oda H, Kumar S, Howley PM (srpen 1999). „Regulace tyrosinkinázy rodiny Src Blk prostřednictvím ubikvitinace zprostředkované E6AP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (17): 9557–62. Bibcode:1999PNAS ... 96,9557O. doi:10.1073 / pnas.96.17.9557. PMC  22247. PMID  10449731.
  9. ^ Kühne C, Banks L (prosinec 1998). „E3-ubikvitinová ligáza / E6-AP spojuje multikopy udržovací protein 7 s ubikvitinační cestou pomocí nového motivu, L2G boxu“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34302–9. doi:10.1074 / jbc.273.51.34302. PMID  9852095.
  10. ^ Kim S, Chahrour M, Ben-Shachar S, Lim J (červenec 2013). "Ube3a / E6AP je zapojen do podmnožiny funkcí MeCP2". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 437 (1): 67–73. doi:10.1016 / j.bbrc.2013.06.036. PMID  23791832.
  11. ^ Nawaz Z, Lonard DM, Smith CL, Lev-Lehman E, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (únor 1999). „Protein asociovaný s Angelmanovým syndromem, E6-AP, je koaktivátorem nadrodiny jaderných hormonálních receptorů“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (2): 1182–9. doi:10.1128 / mcb.19.2.1182. PMC  116047. PMID  9891052.
  12. ^ Lu Z, Hu X, Li Y, Zheng L, Zhou Y, Jiang H, Ning T, Basang Z, Zhang C, Ke Y (srpen 2004). „Lidský papilomavirus 16 E6 interferuje onkoproteiny s inzulinovou signální cestou vazbou na tuberin“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (34): 35664–70. doi:10,1074 / jbc.M403385200. PMID  15175323.
  13. ^ Zheng L, Ding H, Lu Z, Li Y, Pan Y, Ning T, Ke Y (březen 2008). „E3 ubikvitin ligáza E6AP zprostředkovaný obrat TSC2 v přítomnosti a nepřítomnosti HPV16 E6“. Geny do buněk. 13 (3): 285–94. doi:10.1111 / j.1365-2443.2008.01162.x. PMID  18298802.
  14. ^ A b Nuber U, Schwarz S, Kaiser P, Schneider R, Scheffner M (únor 1996). „Klonování lidských ubikvitin-konjugujících enzymů UbcH6 a UbcH7 (E2-F1) a charakterizace jejich interakce s E6-AP a RSP5“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (5): 2795–800. doi:10.1074 / jbc.271.5.2795. PMID  8576257.
  15. ^ Nuber U, Scheffner M (březen 1999). „Identifikace determinantů v E2 ubikvitin-konjugujících enzymech požadovaných pro interakci hek E3 ubikvitin-protein ligáza“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (11): 7576–82. doi:10.1074 / jbc.274.11.7576. PMID  10066826.
  16. ^ A b Anan T, Nagata Y, Koga H, Honda Y, Yabuki N, Miyamoto C, Kuwano A, Matsuda I, Endo F, Saya H, Nakao M (listopad 1998). „Lidský ubikvitin-protein ligáza Nedd4: exprese, subcelulární lokalizace a selektivní interakce s enzymy konjugujícími ubikvitin“. Geny do buněk. 3 (11): 751–63. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00227.x. PMID  9990509.
  17. ^ Hatakeyama S, Jensen JP, Weissman AM (červen 1997). "Subcelulární lokalizace a interakce s ubikvitinem konjugujícím enzymem (E2) ubiquitinových proteinových ligáz savčí rodiny HECT". The Journal of Biological Chemistry. 272 (24): 15085–92. doi:10.1074 / jbc.272.24.15085. PMID  9182527.
  18. ^ Huang L, Kinnucan E, Wang G, Beaudenon S, Howley PM, Huibregtse JM, Pavletich NP (listopad 1999). „Struktura komplexu E6AP-UbcH7: pohledy na ubikvitinaci pomocí enzymové kaskády E2-E3“. Věda. 286 (5443): 1321–6. doi:10.1126 / science.286.5443.1321. PMID  10558980.
  19. ^ A b Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, Gill G, Howley PM (srpen 2000). „HPLIC proteiny mohou poskytovat spojení mezi ubikvitinačním aparátem a proteazomem.“ Molekulární buňka. 6 (2): 409–19. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00040-X. PMID  10983987.

Další čtení

externí odkazy