TRAF3 - TRAF3

TRAF3
Protein TRAF3 PDB 1flk.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyTRAF3, CAP-1, CAP1, CD40bp, CRAF1, IIAE5, LAP1, faktor 3 spojený s TNF receptorem, RNF118
Externí IDOMIM: 601896 MGI: 108041 HomoloGene: 7981 Genové karty: TRAF3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 14 (lidský)
Chr.Chromozom 14 (lidský)[1]
Chromozom 14 (lidský)
Genomic location for TRAF3
Genomic location for TRAF3
Kapela14q32.32Start102,777,449 bp[1]
Konec102,911,500 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE TRAF3 208315 x at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

7187

22031

Ensembl

ENSG00000131323

ENSMUSG00000021277

UniProt

Q13114

Q60803

RefSeq (mRNA)

NM_001199427
NM_003300
NM_145725
NM_145726

NM_001048206
NM_001286122
NM_011632
NM_001364364

RefSeq (protein)

NP_001186356
NP_003291
NP_663777
NP_663778

NP_001273051
NP_035762
NP_001351293

Místo (UCSC)Chr 14: 102,78 - 102,91 MbChr 12: 111,17 - 111,27 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Faktor související s TNF receptorem (TRAF3) je protein že u lidí je kódován TRAF3 gen. [5][6][7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinových faktorů spojených s TNF receptorem (TRAF). Proteiny TRAF se asociují s a zprostředkují signální transdukci od členů nadrodiny TNF receptorů (TNFR). Tento protein se účastní signální transdukce CD40, člena rodiny TNFR důležitého pro aktivaci imunitní odpovědi. Bylo zjištěno, že tento protein je kritickou složkou signálního komplexu lymfotoxin-beta receptor (LTbetaR), který indukuje aktivaci NF-kappaB a buněčnou smrt iniciovanou ligací LTbeta. Virus Epstein-Barrové kódovaný latentní infekční membránový protein-1 (LMP1) může interagovat s tímto a několika dalšími členy rodiny TRAF, což může být nezbytné pro onkogenní účinky LMP1. Byly popsány tři alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující dvě odlišné izoformy.[8]

Interakce

Ukázalo se, že TRAF3 komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131323 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021277 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Cheng G, Cleary AM, Ye ZS, Hong DI, Lederman S, Baltimore D (březen 1995). "Zapojení CRAF1, příbuzného TRAF, do signalizace CD40". Věda. 267 (5203): 1494–8. doi:10.1126 / science.7533327. PMID  7533327.
  6. ^ Sato T, Irie S, Reed JC (leden 1995). „Nový člen rodiny TRAF domnělých proteinů transdukujících signál se váže na cytosolickou doménu CD40.“ FEBS Dopisy. 358 (2): 113–8. doi:10.1016 / 0014-5793 (94) 01406-Q. PMID  7530216.
  7. ^ Mosialos G, Birkenbach M, Yalamanchili R, VanArsdale T, Ware C, Kieff E (únor 1995). „Protein LMP1 transformující virus Epstein-Barrové zapojuje signální proteiny pro rodinu receptorů faktorů nekrotizujících nádory“. Buňka. 80 (3): 389–99. doi:10.1016/0092-8674(95)90489-1. PMID  7859281.
  8. ^ „Entrez Gene: TRAF3 TNF receptor asociovaný s faktorem 3“.
  9. ^ Yamamoto H, Kishimoto T, Minamoto S (listopad 1998). „Aktivace NF-kappaB v signalizaci CD27: účast faktorů spojených s TNF receptorem v její signalizaci a identifikaci funkční oblasti CD27“. Journal of Immunology. 161 (9): 4753–9. PMID  9794406.
  10. ^ Akiba H, Nakano H, Nishinaka S, Shindo M, Kobata T, Atsuta M, Morimoto C, Ware CF, Malinin NL, Wallach D, Yagita H, Okumura K (květen 1998). „CD27, člen nadrodiny receptoru faktoru nekrotizující nádory, aktivuje NF-kappaB a stresem aktivovanou proteinovou kinázu / c-Jun N-koncovou kinázu prostřednictvím TRAF2, TRAF5 a NF-kappaB-indukující kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (21): 13353–8. doi:10.1074 / jbc.273.21.13353. PMID  9582383.
  11. ^ Tsukamoto N, Kobayashi N, Azuma S, Yamamoto T, Inoue J (únor 1999). „Dvě různě regulované aktivační dráhy kappaB jaderného faktoru spouštěné cytoplazmatickým ocasem CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1234–9. doi:10.1073 / pnas.96.4.1234. PMC  15446. PMID  9990007.
  12. ^ Hu HM, O'Rourke K, Boguski MS, Dixit VM (prosinec 1994). „Nový prstový protein RING interaguje s cytoplazmatickou doménou CD40.“ The Journal of Biological Chemistry. 269 (48): 30069–72. PMID  7527023.
  13. ^ Ni CZ, Welsh K, Leo E, Chiou CK, Wu H, Reed JC, Ely KR (září 2000). "Molekulární základ pro signalizaci CD40 zprostředkovanou TRAF3". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (19): 10395–9. doi:10.1073 / pnas.97.19.10395. PMC  27035. PMID  10984535.
  14. ^ Roy N, Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (prosinec 1997). „Proteiny c-IAP-1 a c-IAP-2 jsou přímými inhibitory specifických kaspáz“. Časopis EMBO. 16 (23): 6914–25. doi:10.1093 / emboj / 16.23.6914. PMC  1170295. PMID  9384571.
  15. ^ Lee ZH, Lee SE, Kwack K, Yeo W, Lee TH, Bae SS, Suh PG, Kim HH (březen 2001). "Štěpení TRAF3 zprostředkované kaspázou v buňkách Jurkat-T stimulovaných FasL". Journal of Leukocyte Biology. 69 (3): 490–6. PMID  11261798.
  16. ^ Leo E, Deveraux QL, Buchholtz C, Welsh K, Matsuzawa S, Stennicke HR, Salvesen GS, Reed JC (březen 2001). „TRAF1 je substrát kaspáz aktivovaných během apoptózy indukované receptorem alfa faktoru nekrózy“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (11): 8087–93. doi:10,1074 / jbc.M009450200. PMID  11098060.
  17. ^ VanArsdale TL, VanArsdale SL, Force WR, Walter BN, Mosialos G, Kieff E, Reed JC, Ware CF (březen 1997). „Signální komplex lymfotoxin-beta receptor: role náboru faktoru 3 souvisejícího s receptorem faktoru nekrózy faktorem při buněčné smrti a aktivaci nukleárního faktoru kappaB“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (6): 2460–5. doi:10.1073 / pnas.94.6.2460. PMC  20110. PMID  9122217.
  18. ^ Wu MY, Wang PY, Han SH, Hsieh SL (duben 1999). „Cytoplazmatická doména receptoru lymfotoxinu-beta zprostředkovává buněčnou smrt v buňkách HeLa“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (17): 11868–73. doi:10.1074 / jbc.274.17.11868. PMID  10207006.
  19. ^ Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (květen 1997). „Vstupní mediátor herpesviru, člen rodiny receptorů faktorů nekrotizujících nádory (TNFR), interaguje s členy rodiny faktorů asociovaných s TNFR a aktivuje transkripční faktory NF-kappaB a AP-1“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (22): 14029–32. doi:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.
  20. ^ Gamper C, van Eyndhoven WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S. „TRAF-3 interaguje s p62 nukleoporinem, složkou centrální zástrčky jaderných pórů, která váže klasické importní komplexy obsahující NLS“. Molekulární imunologie. 37 (1–2): 73–84. doi:10.1016 / s0161-5890 (00) 00015-8. PMID  10781837.
  21. ^ Galibert L, Tometsko ME, Anderson DM, Cosman D, Dougall WC (prosinec 1998). „Zapojení faktorů spojených s receptorem faktoru nekrotizujících faktor (TNFR) do signálních mechanismů aktivátoru receptoru NF-kappaB, člena nadrodiny TNFR“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34120–7. doi:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID  9852070.
  22. ^ Kim HH, Lee DE, Shin JN, Lee YS, Jeon YM, Chung CH, Ni J, Kwon BS, Lee ZH (leden 1999). "Receptorový aktivátor NF-kappaB rekrutuje několik adaptérů rodiny TRAF a aktivuje c-Jun N-koncovou kinázu". FEBS Dopisy. 443 (3): 297–302. doi:10.1016 / s0014-5793 (98) 01731-1. PMID  10025951.
  23. ^ Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216.
  24. ^ Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (srpen 1996). „I-TRAF je nový protein interagující s TRAF, který reguluje transdukci signálu zprostředkovanou TRAF“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (16): 8241–6. doi:10.1073 / pnas.93.16.8241. PMC  38654. PMID  8710854.
  25. ^ Kuai J, Nickbarg E, Wooters J, Qiu Y, Wang J, Lin LL (duben 2003). „Endogenní asociace TRAF2, TRAF3, cIAP1 a Smac s receptorem lymfotoxinu beta odhaluje nový mechanismus apoptózy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (16): 14363–9. doi:10,1074 / jbc.M208672200. PMID  12571250.

Další čtení