Nucleoporin 62 - Nucleoporin 62 - Wikipedia

NUP62
NuclearPore crop.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyNUP62, IBSN, SNDI, p62, nukleoporin 62 kDa, nukleoporin 62
Externí IDOMIM: 605815 MGI: 1351500 HomoloGene: 68773 Genové karty: NUP62
Umístění genu (člověk)
Chromozom 19 (lidský)
Chr.Chromozom 19 (lidský)[1]
Chromozom 19 (lidský)
Genomic location for NUP62
Genomic location for NUP62
Kapela19q13.33Start49,906,825 bp[1]
Konec49,929,763 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

23636

18226

Ensembl

ENSG00000213024

ENSMUSG00000109511

UniProt

P37198

Q63850

RefSeq (mRNA)

NM_153719
NM_001193357
NM_012346
NM_016553
NM_153718

NM_053074

RefSeq (protein)

NP_001180286
NP_036478
NP_057637
NP_714940
NP_714941

NP_444304

Místo (UCSC)Chr 19: 49,91 - 49,93 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Nucleoporin p62 (p62) je proteinový komplex spojený s jaderný obal. Protein p62 zůstává spojen s komplex jaderných pórů -laminová frakce. p62 je syntetizován jako rozpustný cytoplazmatický prekurzor 61 kDa[4] následovaná modifikací, která zahrnuje přidání N-acetylglukosaminových zbytků,[5] následuje asociace s dalšími komplexními proteiny.

Komplex jaderných pórů je masivní struktura, která sahá přes jaderný obal a tvoří bránu, která reguluje tok makromolekul mezi jádrem a cytoplazmou. Nukleoporiny jsou hlavními složkami komplexu jaderných pórů v eukaryotických buňkách. Protein kódovaný tímto genem je členem nukleoporinů obsahujících FG repetice a je lokalizován na centrální zátce jaderných pórů. Tento protein se asociuje s komplexem importin alfa / beta, který se podílí na importu proteinů obsahujících signály nukleární lokalizace. Mnoho variant transkriptu tohoto genu kóduje jedinou proteinovou izoformu.[6]

Struktura

P62 je protein bohatý na serin / threonin s ~ 520 aminokyselinami, s tetrapeptidovými opakováními na amino konci a řadou alfa-helikálních oblastí s hydrofobními sedmička se opakuje[7] tváření beta-vrtule doména. P62 se sestavuje do komplexu obsahujícího 3 adiční proteiny, p60, p54 a p45 [8][9] tvořící komplex p62 ~ 235 kDa. Ó-GlcNAcylace Zdá se, že je zapojen do sestavování a demontáže p62 do komplexů vyššího řádu, a zdá se, že regulační oblast linkeru bohatá na serin / threonin mezi Ser270 až Thr294.[10] The komplex p62 je lokalizován jak na nukleoplazmatické, tak na cytoplazmatické straně komplexu pórů a relativní průměr komplexu p62 vzhledem ke komplexu jaderných pórů naznačuje, že interaguje v bránění pórů.[11]

Funkce

Zdá se, že P62 interaguje s mRNA během transportu z jádra.[12] P62 také interaguje s proteinem nukleárního transportního faktoru (NTF2), který se podílí na přenosu proteinů mezi cytoplazmou a jádrem.[13] Další protein, importin (beta), se váže na část šroubovité tyče p62, která také navazuje na NTF2, což naznačuje vznik hradlového komplexu vyššího řádu.[14] Karyopherin beta2 (transportin), transportér riboproteinu, také interaguje s p62.[15] P62 také interaguje s 93,[16] a když je Nup98 vyčerpán, p62 se nedokáže sestavit s komplexy jaderných pórů.[17] Mutantní póry nemohly ukotvit / transportovat proteiny signály nukleární lokalizace nebo signály importu M9.

Patologie

Protilátky proti p62 komplex se účastní jedné nebo více autoimunitních onemocnění. Glykosylace P62 se zvyšuje u cukrovky[18] a může ovlivnit jeho asociaci s jinými nemocemi. Ve fázi IV je také častější p62 primární biliární cirhóza a je prognostický pro závažné onemocnění.[19]

Interakce

Bylo prokázáno, že nukleoporin 62 komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213024 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ Davis LI, Blobel G (1986). "Identifikace a charakterizace proteinu komplexu jaderných pórů". Buňka. 45 (5): 699–709. doi:10.1016/0092-8674(86)90784-1. PMID  3518946. S2CID  22170880.
  5. ^ Davis LI, Blobel G (1987). „Komplex jaderných pórů obsahuje rodinu glykoproteinů, která zahrnuje p62: glykosylace prostřednictvím dosud neidentifikované buněčné dráhy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (21): 7552–6. Bibcode:1987PNAS ... 84.7552D. doi:10.1073 / pnas.84.21.7552. PMC  299337. PMID  3313397.
  6. ^ „Entrez Gene: NUP62 nukleoporin 62 kDa“.
  7. ^ Starr CM, D'Onofrio M, Park MK, Hanover JA (1990). "Primární sekvence a heterologní exprese glykoproteinu jaderných pórů p62". J. Cell Biol. 110 (6): 1861–71. doi:10.1083 / jcb.110.6.1861. PMC  2116139. PMID  2190987.
  8. ^ Kita K, Omata S, Horigome T (1993). "Čištění a charakterizace komplexu glykoproteinu s jadernými póry obsahujícího p62". J. Biochem. 113 (3): 377–82. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124054. PMID  8486610.
  9. ^ Buss F, Stewart M (1995). „Makromolekulární interakce v komplexu nukleoporin p62 krysích jaderných pórů: vazba nukleoporinu p54 na rodovou doménu p62“. J. Cell Biol. 128 (3): 251–61. doi:10.1083 / jcb.128.3.251. PMC  2120351. PMID  7531196.
  10. ^ Lubas WA, Smith M, Starr CM, Hanover JA (1995). "Analýza glykosylace proteinu p62 jaderných pórů". Biochemie. 34 (5): 1686–94. doi:10.1021 / bi00005a025. PMID  7849028.
  11. ^ Guan T, Müller S, Klier G, Panté N, Blevitt JM, Haner M, Paschal B, Aebi U, Gerace L (1995). „Strukturální analýza komplexu p62, sestava O-vázaných glykoproteinů, která se nachází poblíž centrálního bránového kanálu komplexu jaderných pórů“. Mol. Biol. Buňka. 6 (11): 1591–603. doi:10,1091 / mbc.6.11.1591. PMC  301313. PMID  8589458.
  12. ^ Dargemont C, Schmidt-Zachmann MS, Kühn LC (1995). "Přímá interakce nukleoporinu p62 s mRNA během jeho exportu z jádra". J. Cell Sci. 108 (1): 257–63. PMID  7738103.
  13. ^ Bullock TL, Clarkson WD, Kent HM, Stewart M (1996). "Krystalová struktura rozlišení 1,6 angstromů jaderného transportního faktoru 2 (NTF2)". J. Mol. Biol. 260 (3): 422–31. doi:10.1006 / jmbi.1996.0411. PMID  8757804.
  14. ^ A b Percipalle P, Clarkson WD, Kent HM, Rhodes D, Stewart M (1997). "Molekulární interakce mezi importin alfa / beta heterodimerem a proteiny podílejícími se na importu jaderných proteinů obratlovců". J. Mol. Biol. 266 (4): 722–32. doi:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
  15. ^ Yaseen NR, Blobel G (1997). "Klonování a charakterizace lidského karyofherinu β3". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. doi:10.1073 / pnas.94.9.4451. PMC  20743. PMID  9114010.
  16. ^ A b Grandi P, Dang T, Pané N, Shevchenko A, Mann M, Forbes D, Hurt E (1997). „Nup93, homolog obratlů kvasinek Nic96p, tvoří komplex s novým proteinem 205 kDa a je vyžadován pro správné sestavení jaderných pórů“. Mol. Biol. Buňka. 8 (10): 2017–38. doi:10.1091 / mbc.8.10.2017. PMC  25664. PMID  9348540.
  17. ^ Wu X, Kasper LH, Mantcheva RT, Mantchev GT, Springett MJ, van Deursen JM (2001). „Narušení FG nukleoporinu NUP98 způsobuje selektivní změny ve stechiometrii a funkci komplexu nukleárních pórů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (6): 3191–6. Bibcode:2001PNAS ... 98,3191W. doi:10.1073 / pnas.051631598. PMC  30629. PMID  11248054.
  18. ^ Han I, Oh ES, Kudlow JE (2000). „Reagence stavu O-vázaného N-acetylglukosaminového modifikace proteinu p62 jaderných pórů na extracelulární koncentraci glukózy“. Biochem. J. 350 Pt 1 (Pt 1): 109–14. doi:10.1042/0264-6021:3500109. PMC  1221231. PMID  10926833.
  19. ^ Miyachi K, Hankins RW, Matsushima H, Kikuchi F, Inomata T, Horigome T, Shibata M, Onozuka Y, Ueno Y, Hashimoto E, Hayashi N, Shibuya A, Amaki S, Miyakawa H (2003). „Profil a klinický význam protilátek proti nukleární obálce nalezených u pacientů s primární biliární cirhózou: multicentrická studie“. J. Autoimmun. 20 (3): 247–54. doi:10.1016 / S0896-8411 (03) 00033-7. PMID  12753810.
  20. ^ Yoshima T, Yura T, Yanagi H (listopad 1997). „Doména trimerace lidského faktoru tepelného šoku 2 je schopna interagovat s nukleoporinem p62“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 240 (1): 228–33. doi:10.1006 / bbrc.1997.7662. PMID  9367915.
  21. ^ Ben-Efraim I, Gerace L (leden 2001). „Gradient zvyšující se afinity importinu beta k nukleoporinům na cestě jaderného importu“. J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. doi:10.1083 / jcb.152.2.411. PMC  2199621. PMID  11266456.
  22. ^ Hu T, Guan T, Gerace L (srpen 1996). „Molekulární a funkční charakterizace komplexu p62, sestavy glykoproteinů komplexu nukleárních pórů“. J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. doi:10.1083 / jcb.134.3.589. PMC  2120945. PMID  8707840.
  23. ^ Paschal BM, Gerace L (květen 1995). „Identifikace NTF2, cytosolického faktoru pro jaderný import, který interaguje s proteinem p62 komplexního jádra“. J. Cell Biol. 129 (4): 925–37. doi:10.1083 / jcb.129.4.925. PMC  2120498. PMID  7744965.
  24. ^ Gamper C, van Eyndhoven WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S (2000). „TRAF-3 interaguje s p62 nukleoporinem, složkou centrální zástrčky jaderných pórů, která váže klasické importní komplexy obsahující NLS“. Mol. Immunol. 37 (1–2): 73–84. doi:10.1016 / S0161-5890 (00) 00015-8. PMID  10781837.
  25. ^ Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (květen 1999). „Role pro RanBP1 při uvolňování CRM1 z komplexu jaderných pórů v terminálním kroku jaderného exportu“. J. Cell Biol. 145 (4): 645–57. doi:10.1083 / jcb.145.4.645. PMC  2133185. PMID  10330396.
  26. ^ Lindsay ME, Holaska JM, Welch K, Paschal BM, Macara IG (červen 2001). „Ran-binding protein 3 je kofaktorem pro export jaderného proteinu zprostředkovaného Crm1“. J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. doi:10.1083 / jcb.153.7.1391. PMC  2150735. PMID  11425870.

Další čtení