NÁDRŽ (gen) - TANK (gene)

NÁDRŽ
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 KZZ, 1L0A
Identifikátory
Aliasy	NÁDRŽAktivátor NFKB spojený s členem rodiny I-TRAF, ITRAF, TRAF2, TRAF
Externí ID	OMIM: 603893 MGI: 107676 HomoloGene: 3081 Genové karty: NÁDRŽ
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	161,236,230 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	61,654,171 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba kovových iontů; • aktivita aktivátoru deubiquitinázy; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• Signální dráha mýtného receptoru závislá na TRIF; • signální transdukce; • pozitivní regulace aktivity proteázy specifické pro ubikvitin; • pozitivní regulace deubikvitinace bílkovin; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • negativní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • buněčná odpověď na interleukin-1; • proteolýza; • buněčná reakce na ionizující záření; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • GO: virový proces 0022415;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10010
	21353
	ENSG00000136560
	ENSMUSG00000064289
	Q92844; Q6NW12
	P70347
	NM_001199135; NM_004180; NM_133484
NM_001164071; NM_001164072; NM_011529; NM_001355267; NM_001355268;
	NM_001374667; NM_001378922
	NP_001186064; NP_004171; NP_597841; NP_001186064.1
NP_001157543; NP_001157544; NP_035659; NP_001342196; NP_001342197;
	NP_001361596; NP_001365851
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivátor NF-kappa-B spojený s členem rodiny TRAF je protein že u lidí je kódován NÁDRŽ gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Rodina proteinů TRAF (faktor asociovaný s receptorem faktoru nekrotizující faktor) se sdružuje s a přenáší signály od členů nadrodiny receptorů faktoru nekrotizující nádor. Protein kódovaný tímto genem se nachází v cytoplazmě a může se vázat na TRAF1, TRAF2 nebo TRAF3, čímž inhibuje funkci TRAF sekvestrací TRAF v latentním stavu v cytoplazmě. Například protein kódovaný tímto genem může blokovat vazbu TRAF2 na LMP1, protein transformující virus Epstein-Barr, a inhibovat LMP1 zprostředkovanou aktivaci NF-kappa-B. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že TANK (gen) komunikovat s Kináza vázající TANK 1,^[8]^[9] IKBKE,^[10] TRAF2,^[5]^[8]^[9]^[10] IKBKG^[11] a TRAF3.^[5]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136560 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000064289 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (srpen 1996). „I-TRAF je nový protein interagující s TRAF, který reguluje transdukci signálu zprostředkovanou TRAF“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (16): 8241–6. doi:10.1073 / pnas.93.16.8241. PMC 38654. PMID 8710854.
^ Kaye KM, Devergne O, Harada JN, Izumi KM, Yalamanchili R, Kieff E, Mosialos G (říjen 1996). „Faktor 2 spojený s receptorem faktoru nekrotizující faktor je mediátorem aktivace NF-kappa B latentní infekcí membránového proteinu 1, proteinu transformujícího virus Epstein-Barr“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (20): 11085–90. doi:10.1073 / pnas.93.20.11085. PMC 38288. PMID 8855313.
^ ^A ^b „Entrez Gene: aktivátor NFKB člena rodiny TANK TRAF“.
^ ^A ^b ^C Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
^ ^A ^b Pomerantz JL, Baltimore D (prosinec 1999). „Aktivace NF-kappaB signálním komplexem obsahujícím TRAF2, TANK a TBK1, novou kinázu související s IKK“. Časopis EMBO. 18 (23): 6694–704. doi:10.1093 / emboj / 18.23.6694. PMC 1171732. PMID 10581243.
^ ^A ^b Nomura F, Kawai T, Nakanishi K, Akira S (březen 2000). „NF-kappaB aktivace prostřednictvím IKK-i-dependentní I-TRAF / TANK fosforylace“. Geny do buněk. 5 (3): 191–202. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00315.x. PMID 10759890. S2CID 8489218.
^ Chariot A, Leonardi A, Muller J, Bonif M, Brown K, Siebenlist U (říjen 2002). „Sdružení adaptéru TANK s regulátorem I kappa B kinázy (IKK) NEMO spojuje komplexy IKK s IKK epsilon a TBK1 kinázami“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (40): 37029–36. doi:10,1074 / jbc.M205069200. PMID 12133833.

Další čtení

Chin AI, Shu J, Shan Shi C, Yao Z, Kehrl JH, Cheng G (říjen 1999). „TANK potencuje aktivaci proteinkinázy c-Jun N-koncovou kinázou / stresem aktivovanou proteinovou kinázou zprostředkovanou faktorem spojeným s receptorem faktoru tumorové nekrózy cestou kinázy germinálního centra“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (10): 6665–72. doi:10.1128 / MCB.19.10.6665. PMC 84649. PMID 10490605.
Pomerantz JL, Baltimore D (prosinec 1999). „Aktivace NF-kappaB signálním komplexem obsahujícím TRAF2, TANK a TBK1, novou kinázu související s IKK“. Časopis EMBO. 18 (23): 6694–704. doi:10.1093 / emboj / 18.23.6694. PMC 1171732. PMID 10581243.
Nomura F, Kawai T, Nakanishi K, Akira S (březen 2000). „NF-kappaB aktivace prostřednictvím IKK-i-dependentní I-TRAF / TANK fosforylace“. Geny do buněk. 5 (3): 191–202. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00315.x. PMID 10759890. S2CID 8489218.
Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (červen 2001). „Různorodá rodina proteinů obsahující domény faktoru souvisejícího s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 24242–52. doi:10,1074 / jbc.M100354200. PMID 11279055.
Li C, Ni CZ, Havert ML, Cabezas E, He J, Kaiser D, Reed JC, Satterthwait AC, Cheng G, Ely KR (březen 2002). "Downstream regulátor TANK se váže na rozpoznávací místo CD40 na TRAF3". Struktura. 10 (3): 403–11. doi:10.1016 / S0969-2126 (02) 00733-5. PMID 12005438.
Chariot A, Leonardi A, Muller J, Bonif M, Brown K, Siebenlist U (říjen 2002). „Sdružení adaptéru TANK s regulátorem I kappa B kinázy (IKK) NEMO spojuje komplexy IKK s IKK epsilon a TBK1 kinázami“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (40): 37029–36. doi:10,1074 / jbc.M205069200. PMID 12133833.
Ishida R, Ezura Y, Emi M, Kajita M, Yoshida H, Suzuki T, Hosoi T, Inoue S, Shiraki M, Ito H, Orimo H (srpen 2003). „Sdružení promotoru haplotypu (-1542G / -525C) v genovém proteinu interagujícím s faktorem nekrotizujícím faktor s receptorem asociovaného s genem s nízkou kostní minerální hustotou u japonských žen“. Kost. 33 (2): 237–41. doi:10.1016 / S8756-3282 (03) 00226-6. PMID 14499357.
Li C, Norris PS, Ni CZ, Havert ML, Chiong EM, Tran BR, Cabezas E, Reed JC, Satterthwait AC, Ware CF, Ely KR (prosinec 2003). „Strukturálně odlišné rozpoznávací motivy v lymfotoxin-beta receptoru a CD40 pro signalizaci zprostředkovanou faktorem spojeným s receptorem pro faktor nekrózy (TRAF)“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (50): 50523–9. doi:10,1074 / jbc.M309381200. PMID 14517219.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Bonif M, Meuwis MA, Close P, Benoit V, Heyninck K, Chapelle JP, Bours V, Merville MP, Piette J, Beyaert R, Chariot A (březen 2006). „Fosforylace TANK / I-TRAF zprostředkovaná TNFalpha a IKKbeta: důsledky pro interakci s aktivací NEMO / IKKgamma a NF-kappaB“. The Biochemical Journal. 394 (Pt 3): 593–603. doi:10.1042 / BJ20051659. PMC 1383709. PMID 16336209.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Guo B, Cheng G (duben 2007). "Modulace interferonové antivirové reakce pomocí adaptéru proteinu TANK TBK1 / IKKi". The Journal of Biological Chemistry. 282 (16): 11817–26. doi:10,1074 / jbc.M700017200. PMID 17327220.
Ryzhakov G, Randow F (červenec 2007). „SINTBAD, nová součást vrozené antivirové imunity, sdílí doménu vázající TBK1 s NAP1 a TANK“. Časopis EMBO. 26 (13): 3180–90. doi:10.1038 / sj.emboj.7601743. PMC 1914091. PMID 17568778.
Gatot JS, Gioia R, Chau TL, Patrascu F, Warnier M, Close P, Chapelle JP, Muraille E, Brown K, Siebenlist U, Piette J, Dejardin E, Chariot A (říjen 2007). „Aktivace regulačního faktoru interferonu zprostředkovaná lipopolysacharidy zahrnuje TBK1-IKKepsilon-závislou Lys (63) vázanou polyubikvitinaci a fosforylaci TANK / I-TRAF“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (43): 31131–46. doi:10,1074 / jbc.M701690200. PMID 17823124.

externí odkazy

NÁDRŽ umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
NÁDRŽ podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136560 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000064289 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8710854-5] A ^b ^C Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (srpen 1996). „I-TRAF je nový protein interagující s TRAF, který reguluje transdukci signálu zprostředkovanou TRAF“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (16): 8241–6. doi:10.1073 / pnas.93.16.8241. PMC 38654. PMID 8710854.

[pmid8855313-6] Kaye KM, Devergne O, Harada JN, Izumi KM, Yalamanchili R, Kieff E, Mosialos G (říjen 1996). „Faktor 2 spojený s receptorem faktoru nekrotizující faktor je mediátorem aktivace NF-kappa B latentní infekcí membránového proteinu 1, proteinu transformujícího virus Epstein-Barr“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (20): 11085–90. doi:10.1073 / pnas.93.20.11085. PMC 38288. PMID 8855313.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: aktivátor NFKB člena rodiny TANK TRAF“.

[pmid14743216-8] A ^b ^C Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (únor 2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Přírodní buněčná biologie. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.

[pmid10581243-9] A ^b Pomerantz JL, Baltimore D (prosinec 1999). „Aktivace NF-kappaB signálním komplexem obsahujícím TRAF2, TANK a TBK1, novou kinázu související s IKK“. Časopis EMBO. 18 (23): 6694–704. doi:10.1093 / emboj / 18.23.6694. PMC 1171732. PMID 10581243.

[pmid10759890-10] A ^b Nomura F, Kawai T, Nakanishi K, Akira S (březen 2000). „NF-kappaB aktivace prostřednictvím IKK-i-dependentní I-TRAF / TANK fosforylace“. Geny do buněk. 5 (3): 191–202. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00315.x. PMID 10759890. S2CID 8489218.

[pmid12133833-11] Chariot A, Leonardi A, Muller J, Bonif M, Brown K, Siebenlist U (říjen 2002). „Sdružení adaptéru TANK s regulátorem I kappa B kinázy (IKK) NEMO spojuje komplexy IKK s IKK epsilon a TBK1 kinázami“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (40): 37029–36. doi:10,1074 / jbc.M205069200. PMID 12133833.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]