TRAF5 - TRAF5 - Wikipedia

TRAF5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4GJH
Identifikátory
Aliasy	TRAF5MGC: 39780, RNF84, faktor 5 spojený s TNF receptorem
Externí ID	OMIM: 602356 MGI: 107548 HomoloGene: 27079 Genové karty: TRAF5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	211,374,946 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba thioesterázy; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba kovových iontů; • identická vazba na protein; • vazba na receptor faktoru nekrotizující nádory;
Buněčná složka	• cytosol; • cytoplazmatická strana plazmatické membrány; • centrosome; • Komplex receptoru CD40; • cytoplazma; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • signální transdukce; • apoptotický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7188
	22033
	ENSG00000082512
	ENSMUSG00000026637
	O00463
	P70191
	NM_001033910; NM_004619; NM_145759; NM_001319207
	NM_011633
	NP_001029082; NP_001306136; NP_004610; NP_665702
	NP_035763
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor 5 spojený s TNF receptorem je protein že u lidí je kódován TRAF5 gen.^[4]

Funkce

Lešení protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinových faktorů spojených s receptorem faktoru nekrózy faktorů (TRAF) a obsahuje doménu meprinu a TRAF homologie (MATH), zinkový prst typu RING a dva zinkové prsty typu TRAF . TRAF proteiny jsou spojeny s a zprostředkovávají signální transdukci od členů nadrodiny TNF receptorů. Tento protein je jednou ze složek komplexu více proteinů, který se váže na cytoplazmatické domény receptoru faktoru nekrotizující faktor (TNF) a zprostředkovává aktivaci vyvolanou TNF. Byly charakterizovány alternativní transkripční varianty sestřihu.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že TRAF5 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000082512 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tang XX, Pleasure DE, Ikegaki N (duben 1997). „cDNA klonování, chromozomální lokalizace a profil exprese EPLG8, nového člena rodiny genů EPLG kódujících ligandy receptorů protein-tyrosinkinázy souvisejících s EPH“. Genomika. 41 (1): 17–24. doi:10.1006 / geno.1997.4615. PMID 9126477.
^ „Entrez Gene: TRAF5 TNF receptor asociovaný s faktorem 5“.
^ Nishitoh H, Saitoh M, Mochida Y, Takeda K, Nakano H, Rothe M, Miyazono K, Ichijo H (září 1998). "ASK1 je nezbytný pro aktivaci JNK / SAPK pomocí TRAF2". Molekulární buňka. 2 (3): 389–95. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80283-x. PMID 9774977.
^ Hoeflich KP, Yeh WC, Yao Z, Mak TW, Woodgett JR (říjen 1999). „Zprostředkování efektorových funkcí faktoru spojených s TNF receptorem kinázou-1 regulující signál apoptózy (ASK1)“. Onkogen. 18 (42): 5814–20. doi:10.1038 / sj.onc.1202975. PMID 10523862.
^ Kawamata S, Hori T, Imura A, Takaori-Kondo A, Uchiyama T (březen 1998). „Aktivace signálních transdukčních drah OX40 vede k aktivaci NF-kappaB s faktorem spojeným s receptorem faktoru nekrózy faktoru (TRAF) 2- a TRAF5“ “. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5808–14. doi:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID 9488716.
^ Aizawa S, Nakano H, Ishida T, Horie R, Nagai M, Ito K, Yagita H, Okumura K, Inoue J, Watanabe T (leden 1997). „Faktor 5 spojený s receptorem faktoru nekrotizující faktor a TRAF2 se účastní aktivace NFkappaB zprostředkované CD30“ “. The Journal of Biological Chemistry. 272 (4): 2042–5. doi:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID 8999898.
^ Tsukamoto N, Kobayashi N, Azuma S, Yamamoto T, Inoue J (únor 1999). „Dvě různě regulované aktivační dráhy kappaB jaderného faktoru spouštěné cytoplazmatickým ocasem CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1234–9. doi:10.1073 / pnas.96.4.1234. PMC 15446. PMID 9990007.
^ Ishida TK, Tojo T, Aoki T, Kobayashi N, Ohishi T, Watanabe T, Yamamoto T, Inoue J (září 1996). „TRAF5, nový protein rodiny faktorů spojených s receptorem nádorového nekrotického faktoru, zprostředkovává signalizaci CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (18): 9437–42. doi:10.1073 / pnas.93.18.9437. PMC 38446. PMID 8790348.
^ Darnay BG, Haridas V, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (srpen 1998). „Charakterizace intracelulární domény aktivátoru receptoru NF-kappaB (RANK). Interakce s faktory spojenými s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor a aktivace NF-kappab a c-Jun N-terminální kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20551–5. doi:10.1074 / jbc.273.32.20551. PMID 9685412.
^ Darnay BG, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (březen 1999). „Aktivace NF-kappaB pomocí RANK vyžaduje faktor 6 spojený s receptorem faktoru nekrotizujícím faktor a receptor kinázy indukující NF-kappaB. Identifikace nového motivu interakce TRAF6“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (12): 7724–31. doi:10.1074 / jbc.274.12.7724. PMID 10075662.
^ Galibert L, Tometsko ME, Anderson DM, Cosman D, Dougall WC (prosinec 1998). „Zapojení faktorů spojených s receptorem faktoru nekrotizujících faktor (TNFR) do signálních mechanismů aktivátoru receptoru NF-kappaB, člena nadrodiny TNFR“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34120–7. doi:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID 9852070.
^ Xia XZ, Treanor J, Senaldi G, Khare SD, Boone T, Kelley M, Theill LE, Colombero A, Solovyev I, Lee F, McCabe S, Elliott R, Miner K, Hawkins N, Guo J, Stolina M, Yu G , Wang J, Delaney J, Meng SY, Boyle WJ, Hsu H (červenec 2000). „TACI je receptor interagující s TRAF pro TALL-1, člena rodiny faktorů nekrotizujících nádory zapojených do regulace B buněk“. The Journal of Experimental Medicine. 192 (1): 137–43. doi:10.1084 / jem.192.1.137. PMC 1887716. PMID 10880535.
^ Hsu H, Solovyev I, Colombero A, Elliott R, Kelley M, Boyle WJ (květen 1997). „ATAR, nový člen rodiny receptorů faktoru nekrotizující nádory, signalizuje prostřednictvím TRAF2 a TRAF5“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13471–4. doi:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID 9153189.
^ Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (květen 1997). „Vstupní mediátor herpesviru, člen rodiny receptorů faktorů nekrotizujících nádory (TNFR), interaguje s členy rodiny faktorů spojených s TNFR a aktivuje transkripční faktory NF-kappaB a AP-1“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (22): 14029–32. doi:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID 9162022.

Další čtení

Wajant H, Henkler F, Scheurich P (červen 2001). „Rodina faktorů asociovaných s receptorem TNF: molekuly skeletů pro receptory cytokinů, kinázy a jejich regulátory“. Mobilní signalizace. 13 (6): 389–400. doi:10.1016 / S0898-6568 (01) 00160-7. PMID 11384837.
Bradley JR, Pober JS (říjen 2001). „Faktory spojené s receptorem faktoru nekrotizující faktor tumoru (TRAF)“. Onkogen. 20 (44): 6482–91. doi:10.1038 / sj.onc.1204788. PMID 11607847.
Nakano H, Oshima H, Chung W, Williams-Abbott L, Ware CF, Yagita H, Okumura K (červen 1996). „TRAF5, aktivátor NF-kappaB a domnělý signální snímač pro receptor lymfotoxinu-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (25): 14661–4. doi:10.1074 / jbc.271.25.14661. PMID 8663299.
Ishida TK, Tojo T, Aoki T, Kobayashi N, Ohishi T, Watanabe T, Yamamoto T, Inoue J (září 1996). „TRAF5, nový protein rodiny faktorů spojených s receptorem nádorového nekrotického faktoru, zprostředkovává signalizaci CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (18): 9437–42. doi:10.1073 / pnas.93.18.9437. PMC 38446. PMID 8790348.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Aizawa S, Nakano H, Ishida T, Horie R, Nagai M, Ito K, Yagita H, Okumura K, Inoue J, Watanabe T (leden 1997). „Faktor 5 spojený s receptorem faktoru nekrotizující faktor a TRAF2 se účastní aktivace NFkappaB zprostředkované CD30“ “. The Journal of Biological Chemistry. 272 (4): 2042–5. doi:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID 8999898.
Hsu H, Solovyev I, Colombero A, Elliott R, Kelley M, Boyle WJ (květen 1997). „ATAR, nový člen rodiny receptorů faktoru nekrotizující nádory, signalizuje prostřednictvím TRAF2 a TRAF5“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13471–4. doi:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID 9153189.
Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (květen 1997). „Vstupní mediátor herpesviru, člen rodiny receptorů faktorů nekrotizujících nádory (TNFR), interaguje s členy rodiny faktorů spojených s TNFR a aktivuje transkripční faktory NF-kappaB a AP-1“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (22): 14029–32. doi:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID 9162022.
Nakano H, Shindo M, Yamada K, Yoshida MC, Santee SM, Ware CF, Jenkins NA, Gilbert DJ, Yagita H, Copeland NC, Okumura K (květen 1997). „Faktor 5 spojený s lidským TNF receptorem (TRAF5): klonování cDNA, exprese a přiřazení genu TRAF5 chromozomu 1q32“. Genomika. 42 (1): 26–32. doi:10.1006 / geno.1997.4697. PMID 9177772.
Song HY, Régnier CH, Kirschning CJ, Goeddel DV, Rothe M (září 1997). „Kaskády zprostředkované kinázovým faktorem (TNF): bifurkace drah nukleárního faktoru-kappaB a c-jun N-terminální kinázy (JNK / SAPK) na faktoru 2 spojeném s TNF receptorem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (18): 9792–6. doi:10.1073 / pnas.94.18.9792. PMC 23270. PMID 9275204.
Kawamata S, Hori T, Imura A, Takaori-Kondo A, Uchiyama T (březen 1998). „Aktivace signálních transdukčních drah OX40 vede k aktivaci NF-kappaB s faktorem spojeným s receptorem faktoru nekrózy faktoru (TRAF) 2- a TRAF5“ “. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5808–14. doi:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID 9488716.
Mizushima S, Fujita M, Ishida T, Azuma S, Kato K, Hirai M, Otsuka M, Yamamoto T, Inoue J (leden 1998). „Klonování a charakterizace cDNA kódující lidský homolog faktoru 5 spojeného s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor (TRAF5)“. Gen. 207 (2): 135–40. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00616-1. PMID 9511754.
Akiba H, Nakano H, Nishinaka S, Shindo M, Kobata T, Atsuta M, Morimoto C, Ware CF, Malinin NL, Wallach D, Yagita H, Okumura K (květen 1998). „CD27, člen nadrodiny receptoru faktoru nekrotizující nádory, aktivuje NF-kappaB a stresem aktivovanou proteinovou kinázu / c-Jun N-koncovou kinázu prostřednictvím TRAF2, TRAF5 a NF-kappaB-indukující kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (21): 13353–8. doi:10.1074 / jbc.273.21.13353. PMID 9582383.
McCarthy JV, Ni J, Dixit VM (červenec 1998). „RIP2 je nová kináza aktivující NF-kappaB a indukující buněčnou smrt“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (27): 16968–75. doi:10.1074 / jbc.273.27.16968. PMID 9642260.
Pullen SS, Miller HG, Everdeen DS, Dang TT, Crute JJ, Kehry MR (srpen 1998). „Interakce faktoru spojeného s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor CD40 (TRAF): regulace signalizace CD40 prostřednictvím více vazebných míst TRAF a hetero-oligomerizace TRAF“. Biochemie. 37 (34): 11836–45. doi:10.1021 / bi981067q. PMID 9718306.
Wong BR, Josien R, Lee SY, Vologodskaia M, Steinman RM, Choi Y (říjen 1998). „Rodina signálních převodníků TRAF zprostředkovává aktivaci NF-kappaB receptorem TRANCE“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (43): 28355–9. doi:10.1074 / jbc.273.43.28355. PMID 9774460.
Nishitoh H, Saitoh M, Mochida Y, Takeda K, Nakano H, Rothe M, Miyazono K, Ichijo H (září 1998). "ASK1 je nezbytný pro aktivaci JNK / SAPK pomocí TRAF2". Molekulární buňka. 2 (3): 389–95. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80283-X. PMID 9774977.
Tsukamoto N, Kobayashi N, Azuma S, Yamamoto T, Inoue J (únor 1999). „Dvě různě regulované aktivační dráhy kappaB jaderného faktoru spouštěné cytoplazmatickým ocasem CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1234–9. doi:10.1073 / pnas.96.4.1234. PMC 15446. PMID 9990007.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000082512 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9126477-4] Tang XX, Pleasure DE, Ikegaki N (duben 1997). „cDNA klonování, chromozomální lokalizace a profil exprese EPLG8, nového člena rodiny genů EPLG kódujících ligandy receptorů protein-tyrosinkinázy souvisejících s EPH“. Genomika. 41 (1): 17–24. doi:10.1006 / geno.1997.4615. PMID 9126477.

[entrez-5] „Entrez Gene: TRAF5 TNF receptor asociovaný s faktorem 5“.

[pmid9774977-6] Nishitoh H, Saitoh M, Mochida Y, Takeda K, Nakano H, Rothe M, Miyazono K, Ichijo H (září 1998). "ASK1 je nezbytný pro aktivaci JNK / SAPK pomocí TRAF2". Molekulární buňka. 2 (3): 389–95. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 80283-x. PMID 9774977.

[pmid10523862-7] Hoeflich KP, Yeh WC, Yao Z, Mak TW, Woodgett JR (říjen 1999). „Zprostředkování efektorových funkcí faktoru spojených s TNF receptorem kinázou-1 regulující signál apoptózy (ASK1)“. Onkogen. 18 (42): 5814–20. doi:10.1038 / sj.onc.1202975. PMID 10523862.

[pmid9488716-8] Kawamata S, Hori T, Imura A, Takaori-Kondo A, Uchiyama T (březen 1998). „Aktivace signálních transdukčních drah OX40 vede k aktivaci NF-kappaB s faktorem spojeným s receptorem faktoru nekrózy faktoru (TRAF) 2- a TRAF5“ “. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5808–14. doi:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID 9488716.

[pmid8999898-9] Aizawa S, Nakano H, Ishida T, Horie R, Nagai M, Ito K, Yagita H, Okumura K, Inoue J, Watanabe T (leden 1997). „Faktor 5 spojený s receptorem faktoru nekrotizující faktor a TRAF2 se účastní aktivace NFkappaB zprostředkované CD30“ “. The Journal of Biological Chemistry. 272 (4): 2042–5. doi:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID 8999898.

[pmid9990007-10] Tsukamoto N, Kobayashi N, Azuma S, Yamamoto T, Inoue J (únor 1999). „Dvě různě regulované aktivační dráhy kappaB jaderného faktoru spouštěné cytoplazmatickým ocasem CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1234–9. doi:10.1073 / pnas.96.4.1234. PMC 15446. PMID 9990007.

[pmid8790348-11] Ishida TK, Tojo T, Aoki T, Kobayashi N, Ohishi T, Watanabe T, Yamamoto T, Inoue J (září 1996). „TRAF5, nový protein rodiny faktorů spojených s receptorem nádorového nekrotického faktoru, zprostředkovává signalizaci CD40“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (18): 9437–42. doi:10.1073 / pnas.93.18.9437. PMC 38446. PMID 8790348.

[pmid9685412-12] Darnay BG, Haridas V, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (srpen 1998). „Charakterizace intracelulární domény aktivátoru receptoru NF-kappaB (RANK). Interakce s faktory spojenými s receptorem faktoru nekrotizujícího faktor a aktivace NF-kappab a c-Jun N-terminální kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20551–5. doi:10.1074 / jbc.273.32.20551. PMID 9685412.

[pmid10075662-13] Darnay BG, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (březen 1999). „Aktivace NF-kappaB pomocí RANK vyžaduje faktor 6 spojený s receptorem faktoru nekrotizujícím faktor a receptor kinázy indukující NF-kappaB. Identifikace nového motivu interakce TRAF6“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (12): 7724–31. doi:10.1074 / jbc.274.12.7724. PMID 10075662.

[pmid9852070-14] Galibert L, Tometsko ME, Anderson DM, Cosman D, Dougall WC (prosinec 1998). „Zapojení faktorů spojených s receptorem faktoru nekrotizujících faktor (TNFR) do signálních mechanismů aktivátoru receptoru NF-kappaB, člena nadrodiny TNFR“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34120–7. doi:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID 9852070.

[pmid10880535-15] Xia XZ, Treanor J, Senaldi G, Khare SD, Boone T, Kelley M, Theill LE, Colombero A, Solovyev I, Lee F, McCabe S, Elliott R, Miner K, Hawkins N, Guo J, Stolina M, Yu G , Wang J, Delaney J, Meng SY, Boyle WJ, Hsu H (červenec 2000). „TACI je receptor interagující s TRAF pro TALL-1, člena rodiny faktorů nekrotizujících nádory zapojených do regulace B buněk“. The Journal of Experimental Medicine. 192 (1): 137–43. doi:10.1084 / jem.192.1.137. PMC 1887716. PMID 10880535.

[pmid9153189-16] Hsu H, Solovyev I, Colombero A, Elliott R, Kelley M, Boyle WJ (květen 1997). „ATAR, nový člen rodiny receptorů faktoru nekrotizující nádory, signalizuje prostřednictvím TRAF2 a TRAF5“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13471–4. doi:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID 9153189.

[pmid9162022-17] Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (květen 1997). „Vstupní mediátor herpesviru, člen rodiny receptorů faktorů nekrotizujících nádory (TNFR), interaguje s členy rodiny faktorů spojených s TNFR a aktivuje transkripční faktory NF-kappaB a AP-1“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (22): 14029–32. doi:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID 9162022.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]