Malá nukleolární RNA SNORD46 - Small nucleolar RNA SNORD46

Malá nukleolární RNA SNORD46
RF00218.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD46
Alt. SymbolyU40
RfamRF00218
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U46 (také známý jako SNORD46) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U46 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U46 je kódován v intronu 2 z ribozomální protein Gen S8 u člověka a předpokládá se, že vede methylaci zbytků 2'-O-ribózy na 28S ribozomální RNA (rRNA).[2][3] Homolog této snoRNA v Arabidopsis thaliana se nazývá snoZ153.[4] Některé lidské sekvence U40 byly v databázích sekvencí (Genbank) anotovány jako U46.

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (červenec 1996). „Intronem kódovaná, antisense malá nukleolární RNA: charakterizace devíti nových druhů ukazuje na jejich přímou roli jako vodítka pro methylaci 2R-O-ribózy rRNA“. Journal of Molecular Biology. 260 (2): 178–95. doi:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (květen 2003). „Vysoká rozmanitost snoRNA v rostlinách: identifikace a srovnávací studie 120 genů snoRNA z Oryza sativa“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (10): 2601–13. doi:10,1093 / nar / gkg373. PMC  156054. PMID  12736310.

externí odkazy