Malá nukleolární RNA SNORD64 - Small nucleolar RNA SNORD64

Malá nukleolární RNA SNORD64
RF00570.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD64
Alt. SymbolysnoHBII-13
RfamRF00570
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

SNORD64 (také známý jako HBII-13) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

SNORD64 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

snoRNA HBII-13 je exprimována hlavně v tkáních mozku, ale je také v plicích, ledvinách a svalech;[2] HBII-13 však nemá identifikovanou cílovou RNA.[3]Gen HBII-13 je umístěn na 460 kb intron velkého otcovsky vyjádřeno transkripční jednotka (SNURF-SNRNP -UBE3A AS) spolu s několika dalšími snoRNA HBII-436, HBII-437, HBII-438A / B a shluky HBII-85, HBII-52.[4] Tento hostitelský gen je antisense transkript k mateřsky exprimovanému genu UBE3A.

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A (prosinec 2000). „Identifikace mozkových specifických a otištěných malých nukleolárních genů RNA vykazujících neobvyklou genomovou organizaci“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (26): 14311–6. doi:10.1073 / pnas.250426397. PMC  18915. PMID  11106375.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (listopad 2001). „Transkript IC-SNURF-SNRPN slouží jako hostitel pro několik malých druhů nukleolárních RNA a jako antisense RNA pro UBE3A.“. Lidská molekulární genetika. 10 (23): 2687–700. doi:10,1093 / hmg / 10,23,2687. PMID  11726556.

externí odkazy