Malá nukleolární RNA SNORD36 - Small nucleolar RNA SNORD36

Malá nukleolární RNA SNORD36
RF00049.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD36
Alt. SymbolyU36
RfamRF00049
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U36 (také známý jako SNORD36) je a nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U36 je členem C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U36 je kódován uvnitř intron z ribozomální protein rpL7a, a má dvě oblasti komplementarity k 18S a 28S ribozomální RNA. Tato komplementarita naznačuje, že U36 funguje jako průvodce methylací 2'-O-ribózy.[2][3] Tato snoRNA souvisí také s jinými snoRNA (snoR47 a Z100) identifikovanými v rostlině rýže Oryza sativa.[3][4]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (1996). „Intronem kódovaná, antisense malá nukleolární RNA: charakterizace devíti nových druhů ukazuje na jejich přímou roli jako vodítka pro methylaci 2R-O-ribózy rRNA“. J. Mol. Biol. 260 (2): 178–95. doi:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ A b Gilley J, Fried M (1998). „Vývoj snoRNA U24 a U36 kódovaných v intronech homologů genů rpL7a obratlovců: jedinečné vlastnosti savčích variant U36“. DNA Cell Biol. 17 (7): 591–602. doi:10.1089 / dna.1998.17.591. PMID  9703018.
  4. ^ Liang D, Zhou H, Zhang P a kol. (2002). „Nová genová organizace: intronické genové shluky snoRNA z Oryza sativa“. Nucleic Acids Res. 30 (14): 3262–72. doi:10.1093 / nar / gkf426. PMC  135747. PMID  12136108.

externí odkazy