Malá nukleolární RNA SNORD53 - Small nucleolar RNA SNORD53

Malá nukleolární RNA SNORD53 / SNORD92
RF00325.jpg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence z SNORD53_SNORD92
Identifikátory
SymbolSNORD53_SNORD92
Alt. SymbolySNORD53; U53
RfamRF00325
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U53 (také známý jako SNORD53) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U53 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1][2]

U53 byl původně klonován z HeLa buněk a předpokládá se, že vede 2'O-ribózu methylace 28S ribozomální RNA (rRNA) ve zbytku C3848.[3][4]Souvisí to s myší snoRNA MBII-35[5]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss T (duben 2002). „Malé nukleolární RNA: hojná skupina nekódujících RNA s různými buněčnými funkcemi“. Buňka. 109 (2): 145–8. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00718-3. PMID  12007400.
  3. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (červen 1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  4. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  5. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy