Malá nukleolární RNA SNORD38 - Small nucleolar RNA SNORD38

Malá nukleolární RNA SNORD38
RF00212.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD38
Alt. SymbolyU38
RfamRF00212
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U38 (také známý jako SNORD38) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U38 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-Ó-methylace substrátových RNA.[1]

U38 se nachází v introny 4 a 5 z ribozomální protein S8 u člověka a v homologních genech u myší a krav.[2]Předpokládá se, že U38 vede methylaci zbytků 2'-O-ribózy v 28S ribozomální RNA Rovněž byl identifikován myší homolog U38 (MBII-329).[3]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Nicoloso M, Qu LH, Michot B, Bachellerie JP (červenec 1996). „Intronem kódovaná, antisense malá nukleolární RNA: charakterizace devíti nových druhů ukazuje na jejich přímou roli jako vodítka pro methylaci 2R-O-ribózy rRNA“. Journal of Molecular Biology. 260 (2): 178–95. doi:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy