Malá nukleolární RNA SNORD25 - Small nucleolar RNA SNORD25

Malá nukleolární RNA SNORD25
RF00054.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD25
Alt. SymbolyU25
RfamRF00054
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U25 (také známý jako SNORD25) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

U25 je členem C / D box třída snoRNA které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U25 se nachází v genových klastrech v rostlinách [2] a v hostitelském genu snoRNA U22 (UHG) u savců.[3] U25 je považován za průvodce methylací 2'-O-ribózy pro ribozomální RNA. Tato RNA byla také v některých rostlinách pojmenována snoRNA R73.

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Qu LH, Meng Q, Zhou H a kol. (2001). „Identifikace 10 nových shluků genů snoRNA z Arabidopsis thaliana“. Nucleic Acids Res. 29 (7): 1623–30. doi:10.1093 / nar / 29.7.1623. PMC  31268. PMID  11266566.
  3. ^ Tycowski KT, MD Shu, Steitz JA (1996). "Savčí gen s introny místo exonů generujících stabilní produkty RNA". Příroda. 379 (6564): 464–6. doi:10.1038 / 379464a0. PMID  8559254.

externí odkazy