Malá nukleolární RNA R41 - Small nucleolar RNA R41

Malá nukleolární RNA R41
RF00205.jpg
Identifikátory
SymbolsnoR41
RfamRF00205
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA R41 (také známý jako snoR41) je nekódující RNA (ncRNA) molekula identifikovaná v rostlinách, která funguje při modifikaci jiných malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoR41 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

snoR41 byl identifikován výpočtovým skríninkem rýže Oryza sativa genomu a předpokládá se, že bude působit jako metylační průvodce pro 18S a 25S ribozomální RNA (rRNA). snoR41 byl alternativně pojmenován snoZ154 a snoZ231 v rýži. Uvádí se, že místo methylace 18S je homologní s místem, na které je cíleno U62 u lidí, ale zdá se, že mezi dvěma snoRNA je malá sekvenční podobnost.

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.

externí odkazy