Malá nukleolární RNA SNORD56 - Small nucleolar RNA SNORD56

Malá nukleolární RNA SNORD56
RF00275.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD56
Alt. SymbolyU56
RfamRF00275
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U56 (také známý jako SNORD56) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U56 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U56 byl původně klonován z HeLa buněk a předpokládá se, že vede methylaci 2'O-ribózy 18S ribozomální RNA (rRNA) zbytek C517.[2][3]V lidském genomu je U56 kódován v introny stejného hostitelského genu jako několik dalších snoRNA (C / D box snoRNA U57, U86 a HBII-55 a H / ACA box snoRNA ACA51 ).[3]Tento hostitelský gen kóduje nukleolární protein 5A (NOL5A).

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (červen 1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ A b Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy