Malá nukleolární RNA SNORD29 - Small nucleolar RNA SNORD29

Malá nukleolární RNA SNORD29
RF00070.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD29
Alt. SymbolyU29
RfamRF00070
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

SNORD29 (také známý jako U29) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

U29 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1][2]

U lidí jsou U29 a několik dalších snoRNA (U22 a U25-U31) umístěny v intronech stejného genu (nazývaného UHG pro hostitelský gen U22).[3][4] U29 se navrhuje k vedení methylace 2'O-ribózy 28S ribozomální RNA (rRNA) zbytek A4493.[5][6]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Polibek T (2002). „Malé nukleolární RNA: hojná skupina nekódujících RNA s různými buněčnými funkcemi“. Buňka. 109 (2): 145–8. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00718-3. PMID  12007400.
  3. ^ Tycowski KT, MD Shu, Steitz JA (1996). "Savčí gen s introny místo exonů generujících stabilní produkty RNA". Příroda. 379 (6564): 464–6. doi:10.1038 / 379464a0. PMID  8559254.
  4. ^ Tycowski KT, Smith CM, Shu MD, Steitz JA (1996). „Malý požadavek na nukleolární RNA pro místně specifickou methylaci ribózy rRNA v Xenopus“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (25): 14480–5. doi:10.1073 / pnas.93.25.14480. PMC  26158. PMID  8962077.
  5. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  6. ^ Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Dodatek 1: Vydání databáze): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy