Malá nukleolární RNA SNORD32 - Small nucleolar RNA SNORD32

Malá nukleolární RNA SNORD32
SNORD32
Identifikátory
SymbolSNORD32
RfamRF00219
Další údaje
RNA typGen; snRNA; průvodce; CD-box;
PDB strukturPDBe

snoRNA U32 (také známý jako SNORD32) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U32 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U32 je kódován v intronu 2 z ribozomální protein Gen L13 u člověka a myši[2] a předpokládá se, že povede methylaci 2'O-ribózy obou 18S ribozomální RNA (rRNA) zbytek G1328 a 28S rRNA zbytek A1511.[2][3] U32A sdílí stejný hostitelský gen s C / D box snoRNA U33, U34 a U35A (RPL13A).[3]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ A b Nicoloso, M; Qu LH; Michot B; Bachellerie JP (1996). „Intronem kódovaná, antisense malá nukleolární RNA: charakterizace devíti nových druhů ukazuje na jejich přímou roli jako vodítka pro methylaci 2R-O-ribózy rRNA“. J Mol Biol. 260 (2): 178–195. doi:10.1006 / jmbi.1996.0391. PMID  8764399.
  3. ^ A b Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Dodatek 1: Vydání databáze): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy