Malá nukleolární RNA SNORD58 - Small nucleolar RNA SNORD58
Malá nukleolární RNA SNORD58 | |
---|---|
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence SNORD58 | |
Identifikátory | |
Symbol | SNORD58 |
Alt. Symboly | U58 |
Rfam | RF00151 |
Další údaje | |
RNA typ | Gen; snRNA; snoRNA; CD-box |
Domény | Eukaryota |
JÍT | GO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO: |
TAK | SO: 0000593 |
PDB struktur | PDBe |
snoRNA U58 (také známý jako SNORD58) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.
snoRNA U57 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]
V lidském genomu jsou dvě blízce příbuzné kopie U85 (nazývané U58A a U58B). Oba jsou kódovány v introny z ribozomální protein Gen RPL17. Předpokládá se, že obě snoRNA vedou methylaci 2'O-ribózy velkého 28S ribozomální RNA (rRNA) podjednotka na zbytku G4198.[2]
Reference
- ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID 8674114.
externí odkazy
- Stránka pro malou nukleolární RNA SNORD58 na Rfam
- Vstup pro SNORD58A na snoRNABase
- Vstup pro SNORD58B na snoRNABase
Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |