Malá nukleolární RNA SNORA2 - Small nucleolar RNA SNORA2 - Wikipedia

Malá nukleolární rodina RNA SNORA2 / SNORA34
RF00410.jpg
Identifikátory
SymbolSNORA2
Alt. SymbolysnoACA2
RfamRF00410
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; HACA box
DoményEukaryota
JÍTGO: 0006396 GO: 0005730
TAKSO: 0000594
PDB strukturPDBe

v molekulární biologie, SNORA2 (také známý jako ACA2) je nekódující RNA (ncRNA), která modifikuje jiné malé jaderné RNA (snRNA). Je členem H / ACA třída malá nukleolární RNA které vedou stránky modifikace uridiny na pseudouridiny.[1]

ACA2 byl původně klonován z HeLa buňky spojením s GAR1 protein. Má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas a má konzervované motivy H / ACA-box. Původně byly identifikovány dvě varianty sekvencí ACA2 (nazývané ACA2a a ACA2b). Obě varianty sdílejí přibližně 66% sekvenční identitu s jinou snoRNA charakterizovanou ve stejné studii zvané ACA34 (také známá jako SNORA34). V lidském genomu jsou všechny tři snoRNA (ACA2a, ACA2b a ACA34) nalezeny v introny stejné gen. Tento gen kóduje předpokládané protein označované jako FLJ20436.[1]

Obě varianty ACA2 mají stejná dvě predikovaná cílová místa (U4263 a U4282) v 28S ribozomální RNA (rRNA). Předpokládá se, že ACA34 bude kromě U4269 28S rRNA cílit na jedno z těchto míst (U4282).[1][2] Sekvenční podobnost, genomová poloha a predikovaná cílová místa těchto tří snoRNA naznačují, že byly generovány následnými duplikacemi genů během evoluce.[1]

Reference

  1. ^ A b C d Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (červenec 2004). "Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machines". Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5797–807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC  480876. PMID  15199136.
  2. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy