Malá nukleolární RNA SNORA40 - Small nucleolar RNA SNORA40

Malá nukleolární RNA SNORA40
RF00561.jpg
Identifikátory
SymbolSNORA40
Alt. SymbolysnoACA40
RfamRF00561
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; HACA box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000594
PDB strukturPDBe

The malá nukleolární RNA ACA40 patří do Rodina snoRNA H / ACA a vede pseudouridylace z 28S rRNA podjednotka v poloze U4565. snoRNA ACA40 byla objevena ve velkém měřítku klonování Kiss a kol. (2004)[1] od a HeLa buněčný extrakt imunoprecipitovaný protilátkou anti-GAR1. Předpokládá se, že povede pseudouridylace zbytků 28S rRNA U4546 a 18S rRNA 1174.[1][2] Pseudouridylaci těchto zbytků popsali Ofengand a Bakin (1997)[3] and Maden (1990).[4] ACA1, ACA8, ACA18, ACA25, ACA32 a ACA40 a C / D box snoRNA mgh28S-2409 a mgh28S-2411 sdílejí stejný hostitelský gen (MGC5306).

Reference

  1. ^ A b Kiss, Arnold M .; Jády, Beáta E .; Bertrand, Edouard; Kiss, Tamás (2004). "Human Box H / ACA Pseudouridylation Guide RNA Machinery". Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5797–5807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC  480876. PMID  15199136.
  2. ^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (2006). „Výpočetní obrazovka pro průvodce pseudouridilací savců H / ACA RNA“. RNA. 12 (1): 15–25. doi:10,1261 / rna.2210406. PMC  1370881. PMID  16373490.
  3. ^ Ofengand, J; Bakin A (1997). "Mapování na nukleotidové štěpení zbytků pseudouridinu ve velkých podjednotkách ribozomálních RNA z reprezentativních eukaryot, prokaryot, archaebakterií, mitochondrií a chloroplastů". J Mol Biol. 266 (2): 246–268. doi:10.1006 / jmbi.1996.0737. PMID  9047361.
  4. ^ Maden BE (1990). "Mnoho modifikovaných nukleotidů v eukaryotické ribozomální RNA". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 39: 241–303. doi:10.1016 / S0079-6603 (08) 60629-7. PMID  2247610.

externí odkazy