Malá nukleolární RNA SNORD79 - Small nucleolar RNA SNORD79

Malá nukleolární RNA SNORD79
RF00152.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD79
Alt. SymbolyU79
RfamRF00152
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U79 (také známý jako SNORD79 nebo Z22) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

U79 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

snoRNA U79 se nachází v intron 7 z GAS5 gen u lidí a je také přítomen u myší.[2]Předpokládá se, že U79 vede methylaci 2'O-ribózy 28S ribozomální RNA (rRNA) zbytek A3809.[3]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Smith CM, Steitz JA (prosinec 1998). „Klasifikace gas5 jako hostitelského genu pro multi-malou nukleolární RNA (snoRNA) a člena rodiny 5'-koncových oligopyrimidinových genů odhaluje společné rysy hostitelských genů snoRNA“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (12): 6897–909. doi:10,1128 / mcb.18.12.6897. PMC  109273. PMID  9819378.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy