Malá nukleolární RNA R160 - Small nucleolar RNA R160

Malá nukleolární RNA R160
RF00203.jpg
Identifikátory
SymbolsnoR160
RfamRF00203
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

Sammová nukleolární RNA R160 (také známý jako snoR160) je nekódující RNA (ncRNA) molekula identifikovaná v rostlinách, která funguje při modifikaci jiných malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoR160 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

snoR160 byl identifikován výpočtovým screeningem rýže Oryza sativa a předpokládá se, že bude fungovat jako vodítko methylace pro 25S ribozomální RNA v rostlinách.[2] snoR160 byl také alternativně pojmenován snoZ270 v rýži.

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (2003). „Vysoká rozmanitost snoRNA v rostlinách: identifikace a srovnávací studie 120 genů snoRNA z Oryza sativa“. Nucleic Acids Res. 31 (10): 2601–13. doi:10,1093 / nar / gkg373. PMC  156054. PMID  12736310.

externí odkazy