Malá nukleolární RNA SNORA44 - Small nucleolar RNA SNORA44

Malá nukleolární RNA SNORA44
RF00405.jpg
Identifikátory
SymbolSNORA44
Alt. SymbolysnoACA44
RfamRF00405
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; H / ACA box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000594
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA SNORA44 (také známý jako ACA44) je a nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA je lokalizován v jádru DNA eukaryotický buňka, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako „průvodce RNA“.

ACA44 byl původně klonován z HeLa buňky[1] a patří do H / ACA box třída snoRNA, protože má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas, má konzervované motivy H / ACA-boxu a je spojena s proteinem GAR1. Předpokládá se, že snoRNA ACA44 řídí pseudouridilaci U822 a U686 18S ribozomální RNA (rRNA). Pseudouridylace je (izomerizace nukleosidu uridin ) do různé izomerní formy pseudouridin.

snoRNA ACA44 je homologní s myš sekvence snoRNA MBI-64 popsaná Hüttenhoferem et al v roce 2001.[2]

Reference

  1. ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (červenec 2004). "Human box H / ACA pseudouridylation guide RNA machines". Molekulární a buněčná biologie. 24 (13): 5797–807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC  480876. PMID  15199136.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy