Malá nukleolární RNA SNORA73 - Small nucleolar RNA SNORA73

Malá nukleolární rodina RNA SNORA73
RF00045.jpg
Identifikátory
SymbolSNORA73
Alt. SymbolyU17
RfamRF00045
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; HACA box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000594
PDB strukturPDBe

v molekulární biologie, malá nukleolární RNA SNORA73 (také zvaný U17 / E1 RNA) patří do třídy H / ACA malé nukleolární RNA (snoRNA). Obratlovci U17 jsou intron -kódováno a pohybuje se v délce od 200 do 230 nukleotidy, delší než většina snoRNA. Je to jedna z nejhojnějších snoRNA v lidské buňky a je zásadní pro štěpení pre-rRNA v 5 'vnějším přepisovaném spaceru (ETS).[1] Toto štěpení vede k tvorbě 18S rRNA. Oblasti RNA U17 jsou komplementární s rRNA a fungují jako vodítka pro interakce RNA / RNA, i když se tyto oblasti mezi organizmy nezdají být dobře konzervované.[2]

Existují důkazy, že SNORA73 (izoformy: SNORA73A a SNORA73B) funguje jako regulátor funkce chromatinu[3]. SNORA73 je RNA spojená s chromatinem (caRNA) a stabilně spojená s chromatinem[4]. Zejména se SNORA73 může vázat na PARP1, což vede k aktivaci jeho funkce ADPRylace (PAR)[5]. SNORA73 interaguje s doménou vázající DNA PARP1. Kromě toho snoRNA aktivovaná PARP1 ADPRyláty DDX21 v buňkách podporují buněčnou proliferaci[6].

Viz také

Reference

  1. ^ Enright CA, Maxwell ES, Eliceiri GL, Sollner-Webb B (listopad 1996). „Zpracování 5'ETS rRNA usnadněné čtyřmi malými RNA: U14, E3, U17 a U3“. RNA. 2 (11): 1094–9. PMC  1369439. PMID  8903340.
  2. ^ Cervelli M, Cecconi F, Giorgi M, Annesi F, Oliverio M, Mariottini P (únor 2002). "Srovnávací strukturní analýza malé nukleolární RNA (snoRNA) obratlovců U17". Journal of Molecular Evolution. 54 (2): 166–79. doi:10.1007 / s00239-001-0065-2. PMID  11821910. S2CID  9424738.
  3. ^ Schubert, T; Pusch, MC; Diermeier, S; Beneš, V; Kremmer, E; Imhof, A; Längst, G (9. listopadu 2012). „Protein Df31 a snoRNA udržují přístupné struktury chromatinu vyššího řádu“. Molekulární buňka. 48 (3): 434–44. doi:10.1016 / j.molcel.2012.08.021. PMID  23022379.
  4. ^ Schubert, T; Pusch, MC; Diermeier, S; Beneš, V; Kremmer, E; Imhof, A; Längst, G (9. listopadu 2012). "Protein Df31 a snoRNA udržují přístupné struktury chromatinu vyššího řádu". Molekulární buňka. 48 (3): 434–44. doi:10.1016 / j.molcel.2012.08.021. PMID  23022379.
  5. ^ Kim, DS; Camacho, CV; Nagari, A; Malladi, VS; Challa, S; Kraus, WL (19. září 2019). „Aktivace PARP-1 snoRNA kontroluje biogenezi ribozomu a růst buněk pomocí RNA helikázy DDX21“. Molekulární buňka. 75 (6): 1270–1285.e14. doi:10.1016 / j.molcel.2019.06.020. PMC  6754283. PMID  31351877.
  6. ^ Kim, DS; Camacho, CV; Nagari, A; Malladi, VS; Challa, S; Kraus, WL (19. září 2019). „Aktivace PARP-1 snoRNA kontroluje biogenezi ribozomu a růst buněk pomocí RNA helikázy DDX21“. Molekulární buňka. 75 (6): 1270–1285.e14. doi:10.1016 / j.molcel.2019.06.020. PMC  6754283. PMID  31351877.

externí odkazy