Malá nukleolární RNA SNORD16 - Small nucleolar RNA SNORD16

Malá nukleolární RNA SNORD16
RF00138.jpg
Identifikátory
Symbol16. SNORD
Alt. SymbolyU16
RfamRF00138
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U16 (také známý jako 16. SNORD) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U16 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

Předpokládá se, že U16 vede methylaci 2'O-ribózy 18S ribozomální RNA (rRNA) zbytku A484 [2] a je zakódován v rámci intron genu pro ribozomální proteiny L1 u zvířat.[3] Tato snoRNA byla u myší nezávisle pojmenována MBII-98.[4]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-László Z, Henry Y, Bachellerie JP, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (červen 1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–88. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Fragapane P, Prislei S, Michienzi A, Caffarelli E, Bozzoni I (červenec 1993). „Nová malá nukleolární RNA (U16) je kódována uvnitř ribosomálního proteinového intronu a vzniká zpracováním pre-mRNA.“. Časopis EMBO. 12 (7): 2921–8. PMC  413545. PMID  8335006.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy