Malá nukleolární RNA SNORD111 - Small nucleolar RNA SNORD111

Malá nukleolární RNA SNORD111
RF00611.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD111
RfamRF00611
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA SNORD111 (také známý jako HBII-82) je a nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

SNORD111 patří do C / D box třída snoRNA, která obsahuje motivy C (UGAUGA) a D (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2′-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

Předpokládá se, že SNORD111 vede methylaci 2'O-ribózy 28S ribozomální RNA (rRNA) ve zbytku G3923.[2][3]

Přesná role těchto molekul však v současnosti není známa.

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2′-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  3. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–2953. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy