Malá nukleolární RNA R66 - Small nucleolar RNA R66

Malá nukleolární RNA R66
RF00202.jpg
Identifikátory
SymbolsnoR66
RfamRF00202
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA R66 (také známý jako snoR66) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoR66 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

snoR66 byl identifikován výpočtovým skríninkem rýže Oryza sativa genomu a navrhuje se, aby fungoval jako metylační průvodce pro 18S ribozomální RNA v rostlinách.[2] Rice snoR66 byl také alternativně pojmenován snoZ269. Také by se nemělo zaměňovat s snoRNA identifikovanou v kvasinkách (Saccharomyces cerevisiae ) a zavolal snR66.[3]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (2003). „Vysoká rozmanitost snoRNA v rostlinách: identifikace a srovnávací studie 120 genů snoRNA z Oryza sativa“. Nucleic Acids Res. 31 (10): 2601–13. doi:10,1093 / nar / gkg373. PMC  156054. PMID  12736310.
  3. ^ Lowe, T. M .; Eddy, S. R. (únor 1999). "Výpočetní obrazovka pro metylační průvodce snoRNA v kvasnicích". Věda. 283 (5405): 1168–1171. Bibcode:1999Sci ... 283.1168L. doi:10.1126 / science.283.5405.1168. PMID  10024243.

externí odkazy