Malá nukleolární RNA SNORD95 - Small nucleolar RNA SNORD95

Malá nukleolární RNA SNORD95
RF00189.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD95
Alt. SymbolyU95
RfamRF00189
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U95 (také známý jako SNORD95 nebo Z38) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U95 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

U95 byl identifikován výpočtovým screeningem intronů ribozomální protein geny pro konzervované motivy sekvence boxu C / D a exprese experimentálně ověřena Northern blot.[2]Předpokládá se, že U95 vede methylaci 2'O-ribózy 28S ribozomálních RNA (rRNA) zbytků A2802 a C2811.[2][3]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ A b Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (listopad 2003). „Identifikace 13 nových RNA pro lidské úpravy průvodce“. Výzkum nukleových kyselin. 31 (22): 6543–51. doi:10.1093 / nar / gkg849. PMC  275545. PMID  14602913.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy