Malá nukleolární RNA R38 - Small nucleolar RNA R38

Malá nukleolární RNA R38
RF00213.jpg
Identifikátory
SymbolsnoR38
RfamRF00213
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA R38 je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také často označovaná jako vodicí RNA. snoRNA R38 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]snoRNA R38 byla identifikována u lidí, kvasinek,[2] Arabidopsis thaliana[3] a Oryza sativa.[4] snoRNA R38 vede methylaci 2'-O-ribózových míst v 28S rRNA.

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Bachellerie JP, Michot B, Nicoloso M, Balakin A, Ni J, Fournier MJ (1995). „Antisense snoRNA: rodina nukleolárních RNA s dlouhou komplementaritou s rRNA“. Trends Biochem. Sci. 20 (7): 261–4. doi:10.1016 / S0968-0004 (00) 89039-8. PMID  7667877.
  3. ^ Qu LH, Meng Q, Zhou H a kol. (2001). „Identifikace 10 nových shluků genů snoRNA z Arabidopsis thaliana“. Nucleic Acids Res. 29 (7): 1623–30. doi:10.1093 / nar / 29.7.1623. PMC  31268. PMID  11266566.
  4. ^ Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (2003). „Vysoká rozmanitost snoRNA v rostlinách: identifikace a srovnávací studie 120 genů snoRNA z Oryza sativa“. Nucleic Acids Res. 31 (10): 2601–13. doi:10,1093 / nar / gkg373. PMC  156054. PMID  12736310.

externí odkazy