Malá nukleolární RNA SNORA65 - Small nucleolar RNA SNORA65

Malá nukleolární RNA SNORA65
RF00302.jpg
Identifikátory
SymbolSNORA65
Alt. SymbolyU65
RfamRF00302
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; H / ACA box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000594
PDB strukturPDBe

SNORA65 (také známý jako U65) je a nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro z eukaryotický buňka, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako „průvodce RNA“.

U65 byl původně klonován z HeLa buňky [1] a patří do H / ACA box třída snoRNA, protože má předpokládanou strukturu vlásenka-pant-vlásenka-ocas a má konzervované motivy H / ACA-boxu.[2]Předpokládá se, že snoRNA U65 řídí pseudouridylaci zbytků U4373 a U4427 28S ribozomální RNA (rRNA).[3]Pseudouridylace je izomerizace nukleosidu uridin na pseudouridin (Ψ). U65 souvisí s snoRNA MBII-351 identifikovanou u myši.[4]

Reference

  1. ^ Ganot P, Caizergues-Ferrer M, Kiss T (duben 1997). „Rodina malých nukleolárních RNA ACA je definována evolučně konzervovanou sekundární strukturou a všudypřítomnými sekvenčními prvky nezbytnými pro akumulaci RNA.“. Geny a vývoj. 11 (7): 941–56. doi:10,1101 / gad.11.7.941. PMID  9106664.
  2. ^ Kiss T (duben 2002). „Malé nukleolární RNA: hojná skupina nekódujících RNA s různými buněčnými funkcemi“. Buňka. 109 (2): 145–8. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 00718-3. PMID  12007400.
  3. ^ Vstup pro U65 na snoRNABase
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (červen 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.

externí odkazy