Malá nukleolární RNA SNORD92 - Small nucleolar RNA SNORD92

Malá nukleolární RNA SNORD92
SNORD92
Identifikátory
SymbolSNORD92
RfamRF00605
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box;
PDB strukturPDBe

Malá nukleolární RNA SNORD92 (také známý jako HBII-316) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje v biogenezi (modifikaci) jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

SNORD92 patří do C / D box třída snoRNA, která obsahuje motivy C (UGAUGA) a D (CUGA). Většina členů rodiny C / D boxů pracuje při směrování 2′-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]Tato snoRNA je člověk ortolog myší snoRNA MBII-316.[2]Předpokládá se, že SNORD92 vede methylaci 2'O-ribózy 28S ribozomální RNA (rRNA) zbytek A3846.[3]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Vyčištěné Box C / D snoRNP jsou schopné reprodukovat site-specific 2′-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Huttenhofer, Alexander; Kiefmann, Martin; Meier-Ewert, Sebastian; O'Brien, John; Lehrach, Hans; Bachellerie, Jean-Pierre; Brosius, Jürgen (1. června 2001). „RNomics: experimentální přístup, který identifikuje 201 kandidátů na nové malé RNA bez poselství u myší“. Časopis EMBO. 20 (11): 2943–2953. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.
  3. ^ Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Dodatek 1: Vydání databáze): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy