Malá nukleolární rostlina RNA snoR9 - Small nucleolar RNA snoR9 plant - Wikipedia

Malá nukleolární RNA snoR9
snoR9_plant
Identifikátory
SymbolsnoR9_plant
RfamRF00348
Další údaje
RNA typGen; snRNA; průvodce; CD-box;
PDB strukturPDBe

snoR9 je nekódující RNA (ncRNA), která funguje v biogenezi (modifikaci) jiných malých jaderných RNA (snRNA). Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako „průvodce RNA“.

R9 je členem C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

Tato rostlinná snoRNA byla identifikována v Arabidopsis thaliana výpočtovým screeningem a experimentálně ověřeno analýzou prodloužení primeru.[2] Tato snoRNA nesouvisí se snoRNA identifikovanou v hypertermofily také zvaný snoR9.

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Barneche F, Gaspin C, Guyot R, Echeverría M (2001). "Identifikace 66 krabicových C / D snoRNA ve Windows Arabidopsis thaliana: rozsáhlé genové duplikace generovaly více izoforem předpovídajících nová ribozomální RNA 2'-O-methylační místa “. J. Mol. Biol. 311 (1): 57–73. doi:10.1006 / jmbi.2001.4851. PMID  11469857.

externí odkazy