Malá nukleolární RNA SNORD50 - Small nucleolar RNA SNORD50

Malá nukleolární RNA SNORD50
RF00278.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD50
Alt. SymbolyU50
RfamRF00278
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; CD-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U50 (také známý jako SNORD50) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA je obvykle v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U50 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1][2]

U50 je intronický gen snoRNA lokalizovaný na chromozomu 6q15, v bodě zlomu chromozomální translokace t (3; 6) (q27; q15). Gen U50HG se skládá ze šesti exony, jehož sestřižené transkripty mají malý potenciál pro kódování proteinu, a jeho introny produkují jak U50, tak U50 podobné (U50 ') snoRNA, které jsou lokalizovány v nukleolech.[3] Existují důkazy, že paralogy U50 tvoří novou rodinu genů kontrolujících onkogenezi a citlivost na léčbu rakoviny.[4][5]

Reference

  1. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat 2'-O-methylaci cílové RNA specifické pro konkrétní místo in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Polibek T (1996). „Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a new function for small nucleolar RNAs“. Buňka. 85 (7): 1077–1088. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID  8674114.
  3. ^ Tanaka, R; Satoh H; Moriyama M; Satoh K; Morishita Y; Yoshida S; Watanabe T; Nakamura Y; Mori S (2000). „Hostitelský gen Intronic U50 s malou nukleolární RNA (snoRNA) bez potenciálu kódujícího protein je mapován v bodě zlomu chromozomu t (3; 6) (q27; q15) lidského lymfomu B-buněk“. Geny buňky. 5 (4): 277–287. doi:10.1046 / j.1365-2443.2000.00325.x. PMID  10792466.
  4. ^ Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (říjen 2008). „GAS5, RNA nekódující proteiny, řídí apoptózu a je downregulován u rakoviny prsu“. Onkogen. 28 (2): 195–208. doi:10.1038 / dne 2008.373. PMID  18836484.
  5. ^ Dong XY, Guo P, Boyd J a kol. (Srpen 2009). "Dopad snoRNA U50 na lidskou rakovinu prsu". J Genetická genomika. 36 (8): 447–54. doi:10.1016 / S1673-8527 (08) 60134-4. PMC  2854654. PMID  19683667.

externí odkazy