Malá nukleolární RNA SNORD62 - Small nucleolar RNA SNORD62

Malá nukleolární RNA SNORD62
RF00153.jpg
Identifikátory
SymbolSNORD62
Alt. SymbolyU62
RfamRF00153
Další údaje
RNA typGen; snRNA; snoRNA; C / D-box
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO: GO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000593
PDB strukturPDBe

snoRNA U62 (také známý jako SNORD62) je nekódující RNA (ncRNA) molekula, která funguje při modifikaci jiné malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro eukaryotické buňky, která je hlavním místem biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.

snoRNA U62 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny box / C / D funguje při směrování 2'-O- pro konkrétní webmethylace substrátových RNA.[1]

V lidském genomu existují dvě identické kopie snoRNA U62 (nazývané U62A a U62B), které se nacházejí uvnitř introny téhož hostitelského genu, který kóduje hypotetický protein (KIAA0515).[2]Předpokládá se, že U62 vede methylaci 2'O-ribózy 18S ribozomální RNA (rRNA) jsou umístěny v A590.[3]

Reference

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Tycowski KT, Smith CM, Shu MD, Steitz JA (prosinec 1996). „Malý požadavek na nukleolární RNA pro místně specifickou methylaci ribózy rRNA v Xenopus“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (25): 14480–5. doi:10.1073 / pnas.93.25.14480. PMC  26158. PMID  8962077.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (leden 2006). „snoRNA-LBME-db, komplexní databáze lidských H / ACA a C / D box snoRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

externí odkazy