RHAU - RHAU

RHAU (RNA Helikáza spojená s AU - bohatý prvek, známý také jako DHX36 nebo G4R1) je 114-kDa lidská RNA helikáza z DEAH-box rodina helikáz kódovaných DHX36 gen.[1]

Struktura

Schematické znázornění proteinu RHAU

Strukturálně je RHAU modulární protein dlouhý 1008 aminokyselin. Skládá se z ~ 440-aminokyselinového jádra helikázy zahrnujícího všechny podpisové motivy rodiny helikáz DEAH-box s N- a C-koncovými hraničními oblastmi ~ 180, respektive ~ 380 aminokyselinami. Stejně jako všechny proteiny DEAH-box je doména asociovaná s helikázou umístěna v sousedství jádrové oblasti helikázy a zaujímá 75% C-terminální oblasti.

Funkce

RHAU vykazuje jedinečnou závislost na ATP guanin-kvadruplex (G4) aktivita resolvázy a specificita pro její substrát in vitro.[2][3] RHAU váže G4-nukleovou kyselinu se subnanomolární afinitou a odvíjí struktury G4 mnohem efektivněji než dvouvláknová nukleová kyselina. V souladu s těmito biochemickými pozorováními byl RHAU také identifikován jako hlavní zdroj aktivity štěpení tetramolekulární RNA v buněčných lyzátech HeLa.

Předchozí práce ukázala, že RHAU se sdružuje s mRNA a znovu se lokalizuje stresové granule (SG) po translační zástavě vyvolané různými stresy prostředí.[4][5] Ukázalo se, že oblast prvních 105 aminokyselin je kritická pro vazbu RNA a opětovnou lokalizaci na SG.[4]

Reference

  1. ^ Abdelhaleem M, Maltais L, Wain H (červen 2003). "Lidské rodiny genů DDX a DHX domnělých RNA helikáz". Genomika. 81 (6): 618–22. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00049-1. PMID  12782131.
  2. ^ Vaughn JP, Creacy SD, Routh ED a kol. (Listopad 2005). „Proteinový produkt DEXH genu DHX36 je hlavním zdrojem aktivity rozkladu tetramolekulárního kvadruplexu G4-DNA v buněčných lyzátech HeLa.“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (46): 38117–20. doi:10,1074 / jbc.C500348200. PMID  16150737.
  3. ^ Creacy SD, Routh ED, Iwamoto F, Nagamine Y, Akman SA, Vaughn JP (prosinec 2008). „G4 rezolváza 1 váže jak tetramolekulární kvadruplex DNA, tak RNA s vysokou afinitou a je hlavním zdrojem tetramolekulární kvadruplexní aktivity G4-DNA a G4-RNA v lyzátech HeLa buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (50): 34626–34. doi:10,1074 / jbc.M806277200. PMC  2596407. PMID  18842585.
  4. ^ A b Chalupníková K, Lattmann S, Selak N, Iwamoto F, Fujiki Y, Nagamine Y (prosinec 2008). „Nábor RNA helikázy RHAU k namáhání granulí prostřednictvím jedinečné domény vázající RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (50): 35186–98. doi:10,1074 / jbc.M804857200. PMC  3259895. PMID  18854321.
  5. ^ Chalupníková, Kateřina (2008). „Charakterizace funkčních domén RNA helikázy RHAU zapojených do subcelulární lokalizace a interakce RNA“ (PDF).[nespolehlivý lékařský zdroj? ]

externí odkazy