Lys-N - Lys-N

Lys-N je metaloendopeptidáza nalezený v houbě Grifola frondosa který štěpí proteiny na aminové straně lysin zbytky.[1]

Krystalová struktura Lys-N s koordinovaným atomem zinku.[2]

Hmotnostní spektrometrie

Lys-N se stává populární proteázou používanou pro trávení bílkovin proteomika experimenty.[Citace je zapotřebí ] Kombinace Lys-N proteolytický sekvenování peptidů a hmotnostní spektrometrie s ETD vytváří tandemová hmotnostní spektra složený převážně z aminoterminálních peptidových fragmentových iontů.[3]Tento fragmentační vzor usnadňuje použitelnost těchto spekter pro sekvenování peptidů de novo.[3]

Viz také

Reference

  1. ^ Nonaka T, Hashimoto Y, Takio K (červenec 1998). „Kinetická charakterizace metaloendopeptidáz specifických pro lysin z plodnic Grifola frondosa a Pleurotus ostreatus“. Journal of Biochemistry. 124 (1): 157–62. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022074. PMID  9644258.
  2. ^ RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB - 1G12 Structure Structure
  3. ^ A b Taouatas N, Drugan MM, Heck AJ, Mohammed S (květen 2008). "Přímé žebříkové sekvenování peptidů pomocí Lys-N metaloendopeptidázy". Přírodní metody. 5 (5): 405–7. doi:10.1038 / nmeth.1204. PMID  18425140.

externí odkazy