Receptor pro aktivovanou C kinázu 1 - Receptor for activated C kinase 1

RACK1
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRACK1, Gnb2-rs1, H12.3, HLC-7, PIG21, GNB2L1, receptor pro aktivovanou C kinázu 1
Externí IDOMIM: 176981 MGI: 101849 HomoloGene: 4446 Genové karty: RACK1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomic location for RACK1
Genomic location for RACK1
Kapela5q35.3Start181,236,897 bp[1]
Konec181,248,096 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

10399

14694

Ensembl

ENSG00000204628

n / a

UniProt

P63244

P68040

RefSeq (mRNA)

NM_006098

NM_008143

RefSeq (protein)

NP_006089

NP_032169

Místo (UCSC)Chr 5: 181,24 - 181,25 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Receptor pro aktivovanou C kinázu 1 (RACK1), také známý jako guaninová nukleotidová vazebná proteinová podjednotka podobná beta-2 (GNB2L1), je 35 kDa protein že u lidí je kódován RACK1 gen.[4][5]

Funkce

RACK1 byl původně izolován a identifikován jako intracelulární proteinový receptor pro protein kináza C. berouce na vědomí významnou homologii k beta podjednotce heterotrimerické G proteiny.[4] Pozdější studie zavedly RACK1 a jeho kvasnicový homolog Asc1 jako jádro ribozomální protein z eukaryotická malá (40S) ribozomální podjednotka.[6][7][8] Hodně z funkce Asc1 / RACK1 vyplývá z jeho polohy na „hlavě“ 40S ribozomální podjednotky.[9] Asc1 / RACK1 se účastní několika aspektů eukaryotický překlad a kontrola kvality ribozomu, počítaje v to IRES zprostředkovaný překlad[10], nepřetržitý rozpad[11], nefunkční 18S ribozomální RNA rozklad[12], a řazení rámů.[13]

Interakce

RACK1 je umístěn na povrchu vystaveném rozpouštědlu 40S ribozomální podjednotka, kde je držen na místě prostřednictvím kontaktů s oběma 18S rRNA a další ribozomální proteiny, počítaje v to uS3, uS9, a eS17. Navíc bylo prokázáno, že RACK1 komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000204628 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ A b Ron D, Chen CH, Caldwell J, Jamieson L, Orr E, Mochly-Rosen D (únor 1994). „Klonování intracelulárního receptoru pro protein kinázu C: homolog beta podjednotky G proteinů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (3): 839–43. Bibcode:1994PNAS ... 91..839R. doi:10.1073 / pnas.91.3.839. PMC  521407. PMID  8302854.
  5. ^ Guillemot F, Billault A, Auffray C (červen 1989). „Fyzická vazba genu souvisejícího s guaninovým nukleotidovým proteinem na kuřecí hlavní histokompatibilní komplex“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 86 (12): 4594–8. Bibcode:1989PNAS ... 86,4594G. doi:10.1073 / pnas.86.12.4594. PMC  287317. PMID  2499885.
  6. ^ Sengupta J, Nilsson J, Gursky R, Spahn CM, Nissen P, Frank J (říjen 2004). „Identifikace univerzálního proteinu lešení RACK1 na eukaryotickém ribozomu kryo-EM“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 11 (10): 957–62. doi:10.1038 / nsmb822. PMID  15334071. S2CID  20751757.
  7. ^ Gerbasi VR, Weaver CM, Hill S, Friedman DB, Link AJ (září 2004). „Kvasinky Asc1p a savčí RACK1 jsou funkčně ortologické jádro 40S ribozomálních proteinů, které potlačují genovou expresi“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (18): 8276–87. doi:10.1128 / mcb.24.18.8276-8287.2004. PMC  515043. PMID  15340087.
  8. ^ Rabl J, Leibundgut M, Ataide SF, Haag A, Ban N (únor 2011). "Krystalová struktura eukaryotické 40S ribozomální podjednotky v komplexu s iniciačním faktorem 1". Věda. 331 (6018): 730–6. Bibcode:2011Sci ... 331..730R. doi:10.1126 / science.1198308. hdl:20.500.11850/153130. PMID  21205638. S2CID  24771575.
  9. ^ Coyle SM, Gilbert WV, Doudna JA (březen 2009). „Přímé spojení mezi funkcí RACK1 a lokalizací na ribozomu in vivo“. Molekulární a buněčná biologie. 29 (6): 1626–34. doi:10.1128 / mcb.01718-08. PMC  2648249. PMID  19114558.
  10. ^ Majzoub K, Hafirassou ML, Meignin C, Goto A, Marzi S, Fedorova A, Verdier Y, Vinh J, Hoffmann JA, Martin F, Baumert TF, Schuster C, Imler JL (listopad 2014). „RACK1 řídí IRES zprostředkovaný překlad virů“. Buňka. 159 (5): 1086–1095. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.041. PMC  4243054. PMID  25416947.
  11. ^ Ikeuchi K, Inada T (červen 2016). „Asc1 / RACK1 asociovaný s ribozomy je vyžadován pro endonukleolytické štěpení vyvolané zastaveným ribozomem na 3 'konci nonstop mRNA“. Vědecké zprávy. 6 (1): 28234. doi:10.1038 / srep28234. PMC  4911565. PMID  27312062.
  12. ^ Limoncelli KA, Merrikh CN, Moore MJ (prosinec 2017). „ASC1 a RPS3: noví aktéři v 18S nefunkčním rozpadu rRNA“. RNA. 23 (12): 1946–1960. doi:10.1261 / rna.061671.117. PMC  5689013. PMID  28956756.
  13. ^ Wolf AS, Grayhack EJ (květen 2015). „Asc1, homolog lidského RACK1, zabraňuje posunu rámců v kvasinkách ribozomy zastavenými na CGA kodonových opakováních“. RNA. 21 (5): 935–45. doi:10.1261 / rna.049080.114. PMC  4408800. PMID  25792604.
  14. ^ Wang W, Huang Y, Zhou Z, Tang R, Zhao W, Zeng L, Xu M, Cheng C, Gu S, Ying K, Xie Y, Mao Y (leden 2002). "Identifikace a charakterizace AGTRAP, lidského homologu myšího proteinu spojeného s receptorem pro angiotenzin II (Agtrap)". International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 34 (1): 93–102. doi:10.1016 / s1357-2725 (01) 00094-2. PMID  11733189.
  15. ^ Rigas AC, Ozanne DM, Neal DE, Robson CN (listopad 2003). „Lešení protein RACK1 interaguje s androgenovým receptorem a podporuje vzájemné rozhovory prostřednictvím signální dráhy proteinkinázy C“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (46): 46087–93. doi:10,1074 / jbc.M306219200. PMID  12958311.
  16. ^ A b Liliental J, Chang DD (leden 1998). „Rack1, receptor pro aktivovanou proteinkinázu C, interaguje s podjednotkou integrinu beta“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2379–83. doi:10.1074 / jbc.273.4.2379. PMID  9442085.
  17. ^ Lee HS, Millward-Sadler SJ, Wright MO, Nuki G, Al-Jamal R, Salter DM (listopad 2002). "Aktivace signalizace Integrin-RACK1 / PKCalpha v mechanotransdukci lidských kloubních chondrocytů". Osteoartróza a chrupavka. 10 (11): 890–7. doi:10.1053 / joca.2002.0842. PMID  12435334.
  18. ^ Diederichs S, Bäumer N, Ji P, Metzelder SK, Idos GE, Cauvet T, Wang W, Möller M, Pierschalski S, Gromoll J, Schrader MG, Koeffler HP, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (srpen 2004) . „Identifikace interakčních partnerů a substrátů komplexu cyklin A1-CDK2“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (32): 33727–41. doi:10,1074 / jbc.M401708200. PMID  15159402.
  19. ^ Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhäuser N, Marchisio PC, Biffo S (prosinec 2003). "Uvolnění eIF6 (p27BBP) z podjednotky 60S umožňuje sestavení ribosomu 80S". Příroda. 426 (6966): 579–84. Bibcode:2003 Natur.426..579C. doi:10.1038 / nature02160. PMID  14654845. S2CID  2431706.
  20. ^ Yaka R, He DY, Phamluong K, Ron D (březen 2003). „Polypeptid aktivující hypofýzu adenylátcyklázu (PACAP (1-38)) zvyšuje funkci receptoru N-methyl-D-aspartátu a expresi neurotrofního faktoru odvozeného od mozku prostřednictvím RACK1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (11): 9630–8. doi:10,1074 / jbc.M209141200. PMID  12524444.
  21. ^ Yaka R, Thornton C, Vagts AJ, Phamluong K, Bonci A, Ron D (duben 2002). „Funkce NMDA receptoru je regulována proteinem inhibičního lešení, RACK1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (8): 5710–5. Bibcode:2002PNAS ... 99,5710Y. doi:10.1073 / pnas.062046299. PMC  122836. PMID  11943848.
  22. ^ A b Usacheva A, Smith R, Minshall R, Baida G, Seng S, Croze E, Colamonici O (červen 2001). „Proteinový receptor obsahující motiv WD pro aktivovanou proteinkinázu C (RACK1) je nutný pro nábor a aktivaci signálního měniče a aktivátoru transkripce 1 přes interferonový receptor typu I“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (25): 22948–53. doi:10,1074 / jbc.M100087200. PMID  11301323.
  23. ^ Croze E, Usacheva A, Asarnow D, Minshall RD, Perez HD, Colamonici O (listopad 2000). „Receptor pro aktivovanou C-kinázu (RACK-1), protein obsahující motiv WD, se konkrétně asociuje s lidským IFN receptorem typu I“. Journal of Immunology. 165 (9): 5127–32. doi:10,4049 / jimmunol. 165,9,5127. PMID  11046044.
  24. ^ A b C Usacheva A, Tian X, Sandoval R, Salvi D, Levy D, Colamonici OR (září 2003). „Protein RACK-1 obsahující motiv WD funguje jako skeletový protein v signálním komplexu IFN receptoru typu I“. Journal of Immunology. 171 (6): 2989–94. doi:10,4049 / jimmunol.171.6.2989. PMID  12960323.
  25. ^ Edelmann MJ, Iphöfer A, Akutsu M, Altun M, di Gleria K, Kramer HB, Fiebiger E, Dhe-Paganon S, Kessler BM (březen 2009). "Strukturální základ a specifičnost lidské otubainem 1 zprostředkované deubikvitinace". The Biochemical Journal. 418 (2): 379–90. doi:10.1042 / BJ20081318. PMID  18954305.
  26. ^ Ozaki T, Watanabe K, Nakagawa T, Miyazaki K, Takahashi M, Nakagawara A (květen 2003). „Funkce p73, nikoli p53, je inhibována fyzickou interakcí s RACK1 a jeho inhibiční účinek je potlačen pomocí pRB“. Onkogen. 22 (21): 3231–42. doi:10.1038 / sj.onc.1206382. PMID  12761493.
  27. ^ Yarwood SJ, Steele MR, Scotland G, Houslay MD, Bolger GB (květen 1999). "Signální skeletový protein RACK1 selektivně interaguje s izoformou fosfodiesterázy PDE4D5 specifické pro cAMP". The Journal of Biological Chemistry. 274 (21): 14909–17. doi:10.1074 / jbc.274.21.14909. PMID  10329691.
  28. ^ Steele MR, McCahill A, Thompson DS, MacKenzie C, Isaacs NW, Houslay MD, Bolger GB (červenec 2001). „Identifikace povrchu na beta-vrtulovém proteinu RACK1, který interaguje s cAMP-specifickou fosfodiesterázou PDE4D5“. Mobilní signalizace. 13 (7): 507–13. doi:10.1016 / s0898-6568 (01) 00167-x. PMID  11516626.
  29. ^ Ron D, Jiang Z, Yao L, Vagts A, Diamond I, Gordon A (září 1999). "Koordinovaný pohyb RACK1 s aktivovanou betaIIPKC". The Journal of Biological Chemistry. 274 (38): 27039–46. doi:10.1074 / jbc.274.38.27039. PMID  10480917.
  30. ^ Liedtke CM, Yun CH, Kyle N, Wang D (červen 2002). „Regulace transmembránové regulace závislé na proteinkináze C epsilonu zahrnuje transmembránový regulátor vazby na receptor pro aktivovanou C kinázu (RACK1) a vazby RACK1 na regulační faktor výměny Na + / H +“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (25): 22925–33. doi:10.1074 / jbc.M201917200. PMID  11956211.
  31. ^ Hellberg CB, Burden-Gulley SM, Pietz GE, Brady-Kalnay SM (březen 2002). „Exprese receptorového proteinu-tyrosin fosfatázy, PTPmu, obnovuje adhezi závislou na E-kadherinu v buňkách lidského karcinomu prostaty“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (13): 11165–73. doi:10,1074 / jbc.M112157200. PMID  11801604.
  32. ^ Mourton T, Hellberg CB, Burden-Gulley SM, Hinman J, Rhee A, Brady-Kalnay SM (květen 2001). „PTPmu protein-tyrosin fosfatáza váže a získává protein lešení RACK1 na kontakty mezi buňkami“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (18): 14896–901. doi:10,1074 / jbc.M010823200. PMID  11278757.
  33. ^ Koehler JA, Moran MF (květen 2001). „RACK1, protein lešení proteinkinázy C, interaguje s PH doménou p120GAP“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 283 (4): 888–95. doi:10.1006 / bbrc.2001.4889. PMID  11350068.
  34. ^ Battle MA, Maher VM, McCormick JJ (červen 2003). „ST7 je nový protein s nízkou hustotou lipoproteinového receptoru (LRP) s cytoplazmatickým ocasem, který interaguje s proteiny souvisejícími se signálními transdukčními cestami“. Biochemie. 42 (24): 7270–82. doi:10.1021 / bi034081y. PMID  12809483.
  35. ^ Chang BY, Conroy KB, Machleder EM, Cartwright CA (červen 1998). „RACK1, receptor pro aktivovanou C kinázu a homolog beta podjednotky G proteinů, inhibuje aktivitu src tyrosin kináz a růst buněk NIH 3T3“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (6): 3245–56. doi:10,1128 / mcb.18.6.3245. PMC  108906. PMID  9584165.

Další čtení