Produkt fúze ribozomálního proteinu se zbytkem ubikvitinu A-52 1 - Ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1

UBA52
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LJ5, 2 MBH, 2 MJB, 2 MUR, 2RSU, 4HJK, 4JIO, 4P4H, 4PIG, 4PIH, 4PIJ, 4RF0, 4RF1, 4S1Z, 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4 UJD, 4D67, 4UJC, 3J7P, 3J7Q, 4XKL, 3J92, 4D5Y, 3J7O, 3J7R, 3PHD, 2KOX, 4UJE, 5A5B, 2N3V, 2N3U, 2N3W, 2NBD, 2NBE, 3VDZ, 5 hp, 3I3T, 5 hpt, 5JBV, 5HPL, 5 HPK, 5J8P
Identifikátory
Aliasy	UBA52, CEP52, HUBCEP52, L40, RPL40, fúzní produkt ribozomálního proteinu se zbytkem ubikvitinu A-52 1
Externí ID	OMIM: 191321 MGI: 3644625 HomoloGene: 68307 Genové karty: UBA52
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	18,577,550 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• strukturní složka ribozomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • proteinová značka; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána endocytických váčků; • buněčné jádro; • ribozom; • extracelulární exosom; • endosomová membrána; • lysozomální membrána; • extracelulární; • nukleoplazma; • mitochondriální vnější membrána; • endoplazmatické retikulum; • cytosol; • buněčná membrána; • oddělení kontroly kvality endoplazmatického retikula; • váček; • membrána endoplazmatického retikula; • hostitelská buňka; • cytosolická velká ribozomální podjednotka; • cytosolická malá ribozomální podjednotka; • synapse;
Biologický proces	• Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • negativní regulace signální dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru; • oprava křížového propojení mezi řetězci; • nukleotidová excize, rozpoznání poškození DNA; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • regulace produkce interferonu typu I.; • Signální dráha mýtného receptoru závislá na TRIF; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • endozomální transport; • oprava nukleotidů excizí globálního genomu; • proces modifikace buněčného proteinu; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • G2 / M přechod mitotického buněčného cyklu; • stresem aktivovaná kaskáda MAPK; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • makroautofagie; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • oprava nukleotidovou excizí, vyplnění mezery DNA; • virová transkripce; • bezchybná syntéza překladu; • regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • SRP-dependentní kotranslační proteinové zacílení na membránu; • JNK kaskáda; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • Signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • vrozený imunitní systém; • Signální dráha zářezu; • regulace stability mRNA; • polyubikvitinace bílkovin; • negativní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • sestava virionu; • aktivace aktivity MAPK; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • komplexně závislý katabolický proces podporující anafázu; • negativní regulace produkce interferonu typu I.; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, nesmysl zprostředkovaný rozpad; • oligomerizační doména vázající nukleotidy obsahující signální cestu; • buněčný proteinový metabolický proces; • GO: 0046795 intracelulární transport viru; • GO: 0019067 virový životní cyklus; • MyD88 závislá signální dráha receptoru podobného mýtnému; • syntéza překladu náchylná k chybám; • Kaskáda MAPK; • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů; • iontový transmembránový transport; • proces biosyntézy glykogenu; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • překladová iniciace; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • syntéza překladů; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • Signální dráha receptoru T buněk; • MyD88 nezávislá signální dráha receptoru podobného mýtnému; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • biosyntéza bílkovin; • oprava nukleotidovou excizí, preincision komplexní sestava; • zpracování rRNA; • Wnt signální cesta; • Signální dráha ERBB2; • oprava nukleotidovou excizí, odvíjení duplexu DNA; • skládání bílkovin; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • ubikvitinace bílkovin; • deubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • vstup bakterie do hostitelské buňky; • transmembránová doprava; • regulace nekroptotického procesu; • membránová organizace; • ořezávání manózy endoplazmatickým retikulem; • homeostáza buněčných iontů železa; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • cílení proteinů na peroxisom; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • modifikace-závislý proteinový katabolický proces; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • reakce na insekticid;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7311
	665964
	ENSG00000221983
	n / a
	P62987
	n / a
NM_001033930; NM_003333; NM_001321017; NM_001321018; NM_001321019;
	NM_001321020; NM_001321021; NM_001321022
	n / a
NP_001029102; NP_001307946; NP_001307947; NP_001307948; NP_001307949;
	NP_001307950; NP_001307951; NP_003324
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

60S ribozomální protein L40 (RPL40) je a protein že u lidí je kódován UBA52 gen.^[4]^[5]

Funkce

Ubikvitin je vysoce konzervovaný jaderný a cytoplazmatický protein, který má hlavní roli při cílení na buněčné proteiny degradace podle 26S proteosom. Podílí se také na údržbě chromatin struktura, regulace genová exprese a stresová reakce. Ubikvitin je syntetizován jako prekurzorový protein skládající se buď z polyubikvitinových řetězců, nebo z jedné ubikvitinové skupiny fúzované s nepříbuzným proteinem. Tento gen kóduje fúzní protein sestávající z ubikvitinu na N-konec a ribozomální protein L40 na C-konec, C-koncový extenzní protein (CEP). V genomu je přítomno více zpracovaných pseudogenů odvozených od tohoto genu.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000221983 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Webb GC, Baker RT, Coggan M, Board PG (červen 1994). "Lokalizace fúzního genu lidského UBA52 ubikvitinu do pásma chromozomů 19p13.1-p12". Genomika. 19 (3): 567–9. doi:10.1006 / geno.1994.1108. PMID 8188300.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBA52 ubikvitin A-52 zbytkový produkt fúze ribozomálního proteinu 1“.