PDE4D - PDE4D

PDE4D
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 MKD, 1OYN, 1PTW, 1Q9M, 1 TB7, 1 TB, 1XOM, 1XON, 1XOQ, 1XOR, 1Y2B, 1Y2C, 1R2D, 1Y2E, 1Y2K, 1 ZKN, 2FM0, 2FM5, 2PW3, 2QYN, 3G4G, 3G4I, 3G4K, 3G4L, 3G58, 3IAD, 3IAK, 3K4S, 3SL3, 3SL4, 3SL5, 3SL6, 3SL8, 3V9B, 4 GB, 4W1O, 4WCU
Identifikátory
Aliasy	PDE4D, ACRDYS2, DPDE3, HSPDE43, PDE4DN2, STRK1, fosfodiesteráza 4D
Externí ID	OMIM: 600129 HomoloGene: 129755 Genové karty: PDE4D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	60,522,120 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba ATPázy; • vazba proteinu lešení; • cAMP vazba; • vazba kovových iontů; • vazba beta-2 adrenergních receptorů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na léky; • aktivita diesterové hydrolázy fosforečné; • vazba enzymu; • aktivita hydrolázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba iontového kanálu; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-AMP fosfodiesterázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklického nukleotidu fosfodiesterázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • centrosome; • organizační centrum mikrotubulů; • apikální plazmatická membrána; • cytoskelet; • membrána; • komplex vápníkového kanálu; • komplex vápníkového kanálu s napětím; • buněčná membrána; • ne membrána;
Biologický proces	• vytvoření endoteliální bariéry; • kontrakce hladkého svalstva; • pozitivní regulace produkce interleukinu-5; • růst mnohobuněčných organismů; • stárnutí; • regulace aktivity receptoru; • pozitivní regulace produkce interferonu-gama; • chemotaxe neutrofilů; • pozitivní regulace produkce interleukinu-2; • regulace buněčné komunikace elektrickým spojením zapojeným do srdečního vedení; • signální dráha adrenergního receptoru; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • Signální dráha receptoru T buněk; • signální dráha adrenergního receptoru zapojená do pozitivní regulace srdeční frekvence; • cAMP zprostředkovaná signalizace; • buněčná odpověď na cAMP; • signální transdukce; • migrace leukocytů; • negativní regulace relaxace srdečního svalu; • regulace uvolňování sekvestrovaného iontu vápníku do cytosolu sarkoplazmatickým retikulem; • negativní regulace srdeční kontrakce; • regulace srdeční frekvence; • regulace aktivity kanálu uvolňujícího vápník citlivý na ryanodin; • cAMP katabolický proces; • buněčná odpověď na stimul adrenalinu; • regulace kontrakce buněk srdečního svalu; • negativní regulace peptidyl-serinové fosforylace; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • negativní regulace signalizace zprostředkované cAMP;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5144
	n / a
	ENSG00000113448
	n / a
	Q08499
	n / a
NM_001104631; NM_001165899; NM_001197218; NM_001197219; NM_001197220;
	NM_001197221; NM_001197222; NM_001197223; NM_006203; NM_001349241; NM_001349242; NM_001349243; NM_001364599; NM_001364600; NM_001364601; NM_001364602; NM_001364603; NM_001364604
	n / a
NP_001098101; NP_001159371; NP_001184147; NP_001184148; NP_001184149;
	NP_001184150; NP_001184151; NP_001184152; NP_006194; NP_001336170; NP_001336171; NP_001336172; NP_001351528; NP_001351529; NP_001351530; NP_001351531; NP_001351532; NP_001351533
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

cAMP-specifická 3 ', 5'-cyklická fosfodiesteráza 4D je enzym že u lidí je kódován PDE4D gen.

Funkce

Gen PDE4D je složitý a má alespoň 9 různých izoforem, které kódují funkční proteiny. Tyto proteiny degradují druhý messenger cAMP, který je klíčovou molekulou transdukce signálu u mnoha typů buněk, včetně vaskulárních buněk (Dominiczak a McBride, 2003). [Dodáno OMIM]^[3]

Interakce

Bylo prokázáno, že PDE4D komunikovat s myomegalin^[4] a GNB2L1.^[5]^[6]

Klinický význam

Mutace v tomto genu byly spojeny s případy akrodysostóza.^[7]

Toto je podtyp PDE4, který se zdá být zapojen do dávivý a antidepresivum účinky Inhibitory PDE4.^[8]

Dále byly jako biomarker rakoviny prostaty navrženy změny v expresi izoformy PDE4D7. ^[9]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113448 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrezův gen: PDE4D fosfodiesteráza 4D, specifická pro cAMP (fosfodiesteráza E3, homolog dunce, Drosophila)".
^ Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, Onuffer J, Jin SL, Conti M (duben 2001). „Myomegalin je nový protein golgi / centrosomu, který interaguje s cyklickou nukleotidovou fosfodiesterázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 11189–98. doi:10,1074 / jbc.M006546200. PMID 11134006.
^ Yarwood SJ, Steele MR, Scotland G, Houslay MD, Bolger GB (květen 1999). "Signální skeletový protein RACK1 selektivně interaguje s izoformou fosfodiesterázy PDE4D5 specifické pro cAMP". The Journal of Biological Chemistry. 274 (21): 14909–17. doi:10.1074 / jbc.274.21.14909. PMID 10329691.
^ Steele MR, McCahill A, Thompson DS, MacKenzie C, Isaacs NW, Houslay MD, Bolger GB (červenec 2001). „Identifikace povrchu na beta-vrtulovém proteinu RACK1, který interaguje s cAMP-specifickou fosfodiesterázou PDE4D5“. Mobilní signalizace. 13 (7): 507–13. doi:10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X. PMID 11516626.
^ Michot C, Le Goff C, Goldenberg A, Abhyankar A, Klein C, Kinning E, Guerrot AM, Flahaut P, Duncombe A, Baujat G, Lyonnet S, Thalassinos C, Nitschke P, Casanova JL, Le Merrer M, Munnich A, Cormier-Daire V (duben 2012). "Exome sekvenování identifikuje PDE4D mutace jako další příčinu akrodysostózy". American Journal of Human Genetics. 90 (4): 740–5. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.03.003. PMC 3322219. PMID 22464250.
^ Zhang HT (2009). „Cyklická AMP-specifická fosfodiesteráza-4 jako cíl pro vývoj antidepresiv“. Současný farmaceutický design. 15 (14): 1688–98. doi:10.2174/138161209788168092. PMID 19442182.
^ Böttcher R, Henderson DJ, Dulla K, van Strijp D, Waanders LF, Tevz G, Lehman ML, Merkle D, van Leenders GJ, Baillie GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (listopad 2015). „Exprese lidské fosfodiesterázy 4D7 (PDE4D7) je zvýšena u TMPRSS2-ERG-pozitivního primárního karcinomu prostaty a nezávisle přispívá ke snížení rizika progrese onemocnění po operaci“. British Journal of Cancer. 113 (10): 1502–11. doi:10.1038 / bjc.2015.335. PMC 4815894. PMID 26575822.
^ Böttcher R, Dulla K, van Strijp D, Dits N, Verhoef EI, Baillie GS, van Leenders GJ, Houslay MD, Jenster G, Hoffmann R (říjen 2016). „Složení lidské izoformy PDE4D je deregulované u primárního karcinomu prostaty a je indikátorem progrese onemocnění a vývoje vzdálených metastáz.“. Cílový cíl. 7 (43): 70669–70684. doi:10.18632 / oncotarget.12204. PMC 5342582. PMID 27683107.
^ Henderson DJ, Byrne A, Dulla K, Jenster G, Hoffmann R, Baillie GS, Houslay MD (březen 2014). „CAMP fosfodiesteráza-4D7 (PDE4D7) je downregulována v buňkách rakoviny prostaty nezávislých na androgenu a zprostředkovává proliferaci kompartmentováním cAMP na plazmatické membráně buněk rakoviny prostaty VCaP“. British Journal of Cancer. 110 (5): 1278–87. doi:10.1038 / bjc.2014.22. PMC 3950871. PMID 24518597.

Další čtení

Wang Q (květen 2005). "Molekulární genetika ischemické choroby srdeční". Aktuální názor na kardiologii. 20 (3): 182–8. doi:10.1097 / 01.hco.0000160373.77190.f1. PMC 1579824. PMID 15861005.
Swinnen JV, Joseph DR, Conti M (listopad 1989). „MRNA kódující vysokoafinitní cAMP fosfodiesterázu regulují hormony a cAMP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 86 (21): 8197–201. doi:10.1073 / pnas.86.21.8197. PMC 298247. PMID 2554303.
Milatovich A, Bolger G, Michaeli T, Francke U (březen 1994). "Chromozomové lokalizace genů pro pět cAMP-specifických fosfodiesteráz u člověka a myši". Somatická buněčná a molekulární genetika. 20 (2): 75–86. doi:10.1007 / BF02290677. PMID 8009369. S2CID 19182571.
Baecker PA, Obernolte R, Bach C, Yee C, Shelton ER (leden 1994). „Izolace cDNA kódující cyklickou AMP fosfodiesterázu citlivou na lidský rolipram (PDE IVD)“. Gen. 138 (1–2): 253–6. doi:10.1016/0378-1119(94)90818-4. PMID 8125310.
Bolger G, Michaeli T, Martins T, St John T, Steiner B, Rodgers L, Riggs M, Wigler M, Ferguson K (říjen 1993). „Rodina lidských fosfodiesteráz homologních s produktem učení a paměti genu Drosophila melanogaster jsou potenciálními cíli pro antidepresiva“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (10): 6558–71. doi:10.1128 / mcb.13.10.6558. PMC 364715. PMID 8413254.
Böttcher R, Henderson DJ, Dulla K, van Strijp D, Waanders LF, Tevz G, Lehman ML, Merkle D, van Leenders GJ, Baillie GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (listopad 2015). „Exprese lidské fosfodiesterázy 4D7 (PDE4D7) je zvýšena u TMPRSS2-ERG-pozitivního primárního karcinomu prostaty a nezávisle přispívá ke snížení rizika progrese onemocnění po operaci“. British Journal of Cancer. 113 (10): 1502–11. doi:10.1038 / bjc.2015.335. PMC 4815894. PMID 26575822.
Böttcher R, Dulla K, van Strijp D, Dits N, Verhoef EI, Baillie GS, van Leenders GJ, Houslay MD, Jenster G, Hoffmann R (říjen 2016). „Složení lidské izoformy PDE4D je deregulované u primárního karcinomu prostaty a je indikátorem progrese onemocnění a vývoje vzdálených metastáz.“. Cílový cíl. 7 (43): 70669–70684. doi:10.18632 / oncotarget.12204. PMC 5342582. PMID 27683107.
Henderson DJ, Byrne A, Dulla K, Jenster G, Hoffmann R, Baillie GS, Houslay MD (březen 2014). „CAMP fosfodiesteráza-4D7 (PDE4D7) je downregulována v buňkách rakoviny prostaty nezávislých na androgenu a zprostředkovává proliferaci kompartmentováním cAMP na plazmatické membráně buněk rakoviny prostaty VCaP“. British Journal of Cancer. 110 (5): 1278–87. doi:10.1038 / bjc.2014.22. PMC 3950871. PMID 24518597.
Sette C, Conti M (červenec 1996). "Fosforylace a aktivace cAMP-specifické fosfodiesterázy pomocí cAMP-závislé proteinové kinázy. Zapojení serinu 54 do aktivace enzymu". The Journal of Biological Chemistry. 271 (28): 16526–34. doi:10.1074 / jbc.271.28.16526. PMID 8663227.
Némoz G, Zhang R, Sette C, Conti M (duben 1996). "Identifikace cyklických variant AMP-fosfodiesterázy z genu PDE4D exprimovaných v lidských periferních mononukleárních buňkách". FEBS Dopisy. 384 (1): 97–102. doi:10.1016/0014-5793(96)00300-6. PMID 8797812. S2CID 42228241.
Bolger GB, Erdogan S, Jones RE, Loughney K, Scotland G, Hoffmann R, Wilkinson I, Farrell C, Houslay MD (prosinec 1997). „Charakterizace pěti různých proteinů produkovaných alternativně sestřiženými mRNA z genu lidské cAMP-specifické fosfodiesterázy PDE4D“. The Biochemical Journal. 328 (Pt 2): 539–48. doi:10.1042 / bj3280539. PMC 1218953. PMID 9371713.
Hoffmann R, Baillie GS, MacKenzie SJ, Yarwood SJ, Houslay MD (únor 1999). „MAP kináza ERK2 inhibuje cyklickou AMP-specifickou fosfodiesterázu HSPDE4D3 tím, že ji fosforyluje na Ser579“. Časopis EMBO. 18 (4): 893–903. doi:10.1093 / emboj / 18.4.893. PMC 1171182. PMID 10022832.
Yarwood SJ, Steele MR, Scotland G, Houslay MD, Bolger GB (květen 1999). "Signální skeletový protein RACK1 selektivně interaguje s izoformou fosfodiesterázy PDE4D5 specifické pro cAMP". The Journal of Biological Chemistry. 274 (21): 14909–17. doi:10.1074 / jbc.274.21.14909. PMID 10329691.
Beard MB, O'Connell JC, Bolger GB, Houslay MD (říjen 1999). "Jedinečná N-koncová doména cAMP fosfodiesterázy PDE4D4 umožňuje interakci se specifickými doménami SH3". FEBS Dopisy. 460 (1): 173–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01335-6. PMID 10571082. S2CID 42574718.
MacKenzie SJ, Baillie GS, McPhee I, Bolger GB, Houslay MD (červen 2000). "ERK2 mitogenem aktivovaná proteinová kináza, vazba, fosforylace a regulace PDE4D cAMP-specifických fosfodiesteráz. Zapojení COOH-koncových dokovacích míst a NH2-koncových UCR oblastí". The Journal of Biological Chemistry. 275 (22): 16609–17. doi:10.1074 / jbc.275.22.16609. PMID 10828059.
Miró X, Casacuberta JM, Gutiérrez-López MD, de Landázuri MO, Puigdomènech P (srpen 2000). „Fosfodiesterázy 4D a 7A sestřihové varianty v reakci HUVEC buněk na TNF-alfa (1)“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 274 (2): 415–21. doi:10,1006 / bbrc.2000.3146. PMID 10913353.
Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, Onuffer J, Jin SL, Conti M (duben 2001). „Myomegalin je nový protein golgi / centrosomu, který interaguje s cyklickou nukleotidovou fosfodiesterázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 11189–98. doi:10,1074 / jbc.M006546200. PMID 11134006.
Zauli G, Milani D, Mirandola P, Mazzoni M, Secchiero P, Miscia S, Capitani S (únor 2001). „HIV-1 Tat protein down-reguluje expresi transkripčního faktoru CREB v neuronálních buňkách PC12 cestou fosfatidylinositol 3-kinázy / AKT / cyklické nukleosidové fosfodiesterázy“. FASEB Journal. 15 (2): 483–91. doi:10.1096 / fj.00-0354com. PMID 11156964. S2CID 26315564.
Dodge KL, Khouangsathiene S, Kapiloff MS, Mouton R, Hill EV, Houslay MD, Langeberg LK, Scott JD (duben 2001). "mAKAP sestavuje signální modul cAMP protein kinázy A / PDE4 fosfodiesterázy". Časopis EMBO. 20 (8): 1921–30. doi:10.1093 / emboj / 20.8.1921. PMC 125429. PMID 11296225.
Steele MR, McCahill A, Thompson DS, MacKenzie C, Isaacs NW, Houslay MD, Bolger GB (červenec 2001). „Identifikace povrchu na beta-vrtulovém proteinu RACK1, který interaguje s cAMP-specifickou fosfodiesterázou PDE4D5“. Mobilní signalizace. 13 (7): 507–13. doi:10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X. PMID 11516626.
Gretarsdottir S, Sveinbjörnsdottir S, Jonsson HH, Jakobsson F, Einarsdottir E, Agnarsson U, Shkolny D, Einarsson G, Gudjonsdottir HM, Valdimarsson EM, Einarsson OB, Thorgeirsson G, Hadzic Gudlaugsdottir GJ, Gill R, Lindpaintner K, Sainz J, Hannesson HH, Sigurdsson GT, Frigge ML, Kong A, Gudnason V, Stefansson K, Gulcher JR (březen 2002). "Lokalizace genu náchylnosti k běžným formám mrtvice na 5q12". American Journal of Human Genetics. 70 (3): 593–603. doi:10.1086/339252. PMC 384939. PMID 11833004.
Moon E, Lee R, Near R, Weintraub L, Wolda S, Lerner A (únor 2002). „Inhibice PDE3B zvyšuje apoptózu indukovanou inhibitorem PDE4 u podskupiny pacientů s chronickou lymfocytární leukémií.“ Klinický výzkum rakoviny. 8 (2): 589–95. PMID 11839681.
Le Jeune IR, Shepherd M, Van Heeke G, Houslay MD, Hall IP (září 2002). „Cyklická AMP-závislá transkripční upregulace fosfodiesterázy 4D5 v buňkách hladkého svalstva lidských dýchacích cest. Identifikace a charakterizace nového promotoru PDE4D5“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (39): 35980–9. doi:10,1074 / jbc.M204832200. PMID 12121997.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113448 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-3] "Entrezův gen: PDE4D fosfodiesteráza 4D, specifická pro cAMP (fosfodiesteráza E3, homolog dunce, Drosophila)".

[pmid11134006-4] Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D, Onuffer J, Jin SL, Conti M (duben 2001). „Myomegalin je nový protein golgi / centrosomu, který interaguje s cyklickou nukleotidovou fosfodiesterázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 11189–98. doi:10,1074 / jbc.M006546200. PMID 11134006.

[pmid10329691-5] Yarwood SJ, Steele MR, Scotland G, Houslay MD, Bolger GB (květen 1999). "Signální skeletový protein RACK1 selektivně interaguje s izoformou fosfodiesterázy PDE4D5 specifické pro cAMP". The Journal of Biological Chemistry. 274 (21): 14909–17. doi:10.1074 / jbc.274.21.14909. PMID 10329691.

[pmid11516626-6] Steele MR, McCahill A, Thompson DS, MacKenzie C, Isaacs NW, Houslay MD, Bolger GB (červenec 2001). „Identifikace povrchu na beta-vrtulovém proteinu RACK1, který interaguje s cAMP-specifickou fosfodiesterázou PDE4D5“. Mobilní signalizace. 13 (7): 507–13. doi:10.1016 / S0898-6568 (01) 00167-X. PMID 11516626.

[pmid.22464250-7] Michot C, Le Goff C, Goldenberg A, Abhyankar A, Klein C, Kinning E, Guerrot AM, Flahaut P, Duncombe A, Baujat G, Lyonnet S, Thalassinos C, Nitschke P, Casanova JL, Le Merrer M, Munnich A, Cormier-Daire V (duben 2012). "Exome sekvenování identifikuje PDE4D mutace jako další příčinu akrodysostózy". American Journal of Human Genetics. 90 (4): 740–5. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.03.003. PMC 3322219. PMID 22464250.

[8] Zhang HT (2009). „Cyklická AMP-specifická fosfodiesteráza-4 jako cíl pro vývoj antidepresiv“. Současný farmaceutický design. 15 (14): 1688–98. doi:10.2174/138161209788168092. PMID 19442182.

[pmid.26575822-9] Böttcher R, Henderson DJ, Dulla K, van Strijp D, Waanders LF, Tevz G, Lehman ML, Merkle D, van Leenders GJ, Baillie GS, Jenster G, Houslay MD, Hoffmann R (listopad 2015). „Exprese lidské fosfodiesterázy 4D7 (PDE4D7) je zvýšena u TMPRSS2-ERG-pozitivního primárního karcinomu prostaty a nezávisle přispívá ke snížení rizika progrese onemocnění po operaci“. British Journal of Cancer. 113 (10): 1502–11. doi:10.1038 / bjc.2015.335. PMC 4815894. PMID 26575822.

[pmid.27683107-10] Böttcher R, Dulla K, van Strijp D, Dits N, Verhoef EI, Baillie GS, van Leenders GJ, Houslay MD, Jenster G, Hoffmann R (říjen 2016). „Složení lidské izoformy PDE4D je deregulované u primárního karcinomu prostaty a je indikátorem progrese onemocnění a vývoje vzdálených metastáz.“. Cílový cíl. 7 (43): 70669–70684. doi:10.18632 / oncotarget.12204. PMC 5342582. PMID 27683107.

[pmid.24518597-11] Henderson DJ, Byrne A, Dulla K, Jenster G, Hoffmann R, Baillie GS, Houslay MD (březen 2014). „CAMP fosfodiesteráza-4D7 (PDE4D7) je downregulována v buňkách rakoviny prostaty nezávislých na androgenu a zprostředkovává proliferaci kompartmentováním cAMP na plazmatické membráně buněk rakoviny prostaty VCaP“. British Journal of Cancer. 110 (5): 1278–87. doi:10.1038 / bjc.2014.22. PMC 3950871. PMID 24518597.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]