EEF1A2 - EEF1A2

EEF1A2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4C0S, 3C5J
Identifikátory
Aliasy	EEF1A2, EEF1AL, EF-1-alfa-2, EF1A, HS1, STN, STNL, EIEE33, MRD38, eukaryotický translační faktor prodloužení 1 alfa 2
Externí ID	OMIM: 602959 MGI: 1096317 HomoloGene: 121568 Genové karty: EEF1A2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	63,499,185 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • aktivita translačního faktoru, vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • Aktivita GTPázy; • aktivita činitele translačního prodloužení;
Buněčná složka	• myelin; • tělo neuronových buněk; • cytoplazmatická strana lysozomální membrány; • buněčné jádro; • komplex eukaryotického překladu elongační faktor 1; • cytoplazma; • synapse;
Biologický proces	• pozitivní regulace apoptotického procesu; • regulace autofagie zprostředkované chaperonem; • translační prodloužení; • pozitivní regulace aktivity lipidové kinázy; • reakce na elektrický podnět; • biosyntéza bílkovin; • reakce na anorganickou látku;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1917
	13628
	ENSG00000101210
	ENSMUSG00000016349
	Q05639
	P62631
	NM_001958
	NM_007906
	NP_001949
	NP_031932
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor prodloužení 1-alfa 2 je protein že u lidí je kódován EEF1A2 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje izoformu alfa podjednotky faktor prodloužení-1 komplex, který je zodpovědný za enzymatické dodávání aminoacyl tRNA do ribozom. Tato izoforma (alfa 2) je exprimována v mozku, srdci a kosterním svalu a další izoforma (alfa 1 ) je vyjádřen v mozku, placentě, plicích, játrech, ledvinách a slinivce břišní.

Klinický význam

Tento gen může být kritický při vývoji rakovina vaječníků.^[6]

Nařízení

EEF1A2 je přímým cílem miRNA-663 a miRNA-744.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101210 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Knudsen SM, Frydenberg J, Clark BF, Leffers H (září 1993). „Tkáňově závislá variace v expresi izoforem elongačního faktoru 1 alfa: izolace a charakterizace cDNA kódující novou variantu lidského elongačního faktoru 1 alfa“. Eur J Biochem. 215 (3): 549–54. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18064.x. PMID 8354261.
^ Lund A, Knudsen SM, Vissing H, Clark B, Tommerup N (leden 1997). „Přiřazení genů lidského elongačního faktoru 1alfa: EEF1A se mapuje na chromozom 6q14 a EEF1A2 na 20q13.3“. Genomika. 36 (2): 359–61. doi:10.1006 / geno.1996.0475. PMID 8812466.
^ ^A ^b „Entrez Gene: EEF1A2 eukaryotický překladový elongační faktor 1 alfa 2“.
^ Vislovukh A, Kratassiouk G, Porto E, Gralievska N, Beldiman C, Pinna G, El'skaya A, Harel-Bellan A, Negrutskii B, Groisman I (11. června 2013). „Protoonkogenní izoforma A2 eukaryotického translačního elongačního faktoru eEF1 je cílem miR-663 a miR-744“. British Journal of Cancer. 108 (11): 2304–11. doi:10.1038 / bjc.2013.243. PMC 3681015. PMID 23695020.

Další čtení

Lee JM (2004). „Role faktoru prodloužení bílkovin eEF1A2 u rakoviny vaječníků“. Reprod. Biol. Endokrinol. 1: 69. doi:10.1186/1477-7827-1-69. PMC 239897. PMID 14588074.
Beh KJ (1976). "Specifičnost imunoglobulinové třídy neaglutinační protilátky produkované u skotu po očkování proti Brucella abortus 45/20". Aust. Veterinář J. 51 (10): 481–3. doi:10.1111 / j.1751-0813.1975.tb02385.x. PMID 812466.
Lee S, Ann DK, Wang E (1994). „Klonování cDNA lidského a myšího mozku kódujících S1, druhého člena rodiny genů alfa-elongačního faktoru-1 savců: analýza možné evoluční cesty“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203 (3): 1371–7. doi:10.1006 / bbrc.1994.2336. PMID 7945283.
Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). „Identifikace skupiny buněčných kofaktorů, které stimulují vazbu RNA polymerázy II a TRP-185 na 1 TAR RNA viru lidské imunodeficience“. J. Biol. Chem. 271 (8): 4201–8. doi:10.1074 / jbc.271.8.4201. PMID 8626763.
Bischoff C, Kahns S, Lund A, Jørgensen HF, Praestegaard M, Clark BF, Leffers H (2001). „Gen lidského elongačního faktoru 1 A-2 (EEF1A2): kompletní sekvence a charakterizace genové struktury a aktivity promotoru“. Genomika. 68 (1): 63–70. doi:10,1006 / geno.2000.6271. PMID 10950927.
McClatchy DB, Knudsen CR, Clark BF, Kahn RA, Hall RA, Levey AI (2002). „Nová interakce mezi receptorem muskarinového acetylcholinu M4 a faktorem prodloužení 1A2“. J. Biol. Chem. 277 (32): 29268–74. doi:10,1074 / jbc.M203081200. PMID 12048193.
Anand N, Murthy S, Amann G, Wernick M, Porter LA, Cukier IH, Collins C, Gray JW, Diebold J, Demetrick DJ, Lee JM (2002). „Faktor prodloužení bílkovin EEF1A2 je domnělý onkogen u rakoviny vaječníků“. Nat. Genet. 31 (3): 301–5. doi:10.1038 / ng904. PMID 12053177. S2CID 37997742.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Byun HM, Suh D, Jeong Y, Wee HS, Kim JM, Kim WK, Ko JJ, Kim JS, Lee YB, Oh YK (2005). „Plazmidové vektory nesoucí buněčné promotory mohou indukovat prodlouženou genovou expresi v hematopoetických a mezenchymálních progenitorových buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332 (2): 518–23. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.04.155. PMID 15893736.
Ahmed M, Forsberg J, Bergsten P (2005). "Proteinové profilování lidských pankreatických ostrůvků pomocí dvourozměrné gelové elektroforézy a hmotnostní spektrometrie". J. Proteome Res. 4 (3): 931–40. doi:10.1021 / pr050024a. PMID 15952740.
Tomlinson VA, Newbery HJ, Wray NR, Jackson J, Larionov A, Miller WR, Dixon JM, Abbott CM (2006). „Translační prodlužovací faktor eEF1A2 je potenciální onkoprotein, který je nadměrně exprimován ve dvou třetinách nádorů prsu“. Rakovina BMC. 5: 113. doi:10.1186/1471-2407-5-113. PMC 1236916. PMID 16156888.
Li R, Wang H, Bekele BN, Yin Z, Caraway NP, Katz RL, Stass SA, Jiang F (2006). „Identifikace domnělých onkogenů v plicním adenokarcinomu komplexním funkčním genomickým přístupem“. Onkogen. 25 (18): 2628–35. doi:10.1038 / sj.onc.1209289. PMID 16369491.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q05639 (Faktor prodloužení 1-alfa 2) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101210 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8354261-4] Knudsen SM, Frydenberg J, Clark BF, Leffers H (září 1993). „Tkáňově závislá variace v expresi izoforem elongačního faktoru 1 alfa: izolace a charakterizace cDNA kódující novou variantu lidského elongačního faktoru 1 alfa“. Eur J Biochem. 215 (3): 549–54. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18064.x. PMID 8354261.

[pmid8812466-5] Lund A, Knudsen SM, Vissing H, Clark B, Tommerup N (leden 1997). „Přiřazení genů lidského elongačního faktoru 1alfa: EEF1A se mapuje na chromozom 6q14 a EEF1A2 na 20q13.3“. Genomika. 36 (2): 359–61. doi:10.1006 / geno.1996.0475. PMID 8812466.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: EEF1A2 eukaryotický překladový elongační faktor 1 alfa 2“.

[7] Vislovukh A, Kratassiouk G, Porto E, Gralievska N, Beldiman C, Pinna G, El'skaya A, Harel-Bellan A, Negrutskii B, Groisman I (11. června 2013). „Protoonkogenní izoforma A2 eukaryotického translačního elongačního faktoru eEF1 je cílem miR-663 a miR-744“. British Journal of Cancer. 108 (11): 2304–11. doi:10.1038 / bjc.2013.243. PMC 3681015. PMID 23695020.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]